More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0378 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  100 
 
 		 259 aa  511  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  98.84 
 
 		 259 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  92.28 
 
 		 259 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  77.11 
 
 		 260 aa  381  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  75.3 
 
 		 260 aa  372  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  64.46 
 
 		 261 aa  315  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  61.32 
 
 		 252 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  61.57 
 
 		 261 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  59.67 
 
 		 245 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0779  ABC transporter related  59.02 
 
 		 249 aa  287  9e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2893  ABC transporter related  61.26 
 
 		 259 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7222  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.88 
 
 		 245 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  44.67 
 
 		 260 aa  223  3e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  46.55 
 
 		 261 aa  221  7e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  46.72 
 
 		 267 aa  221  9e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  45.12 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  45.78 
 
 		 254 aa  216  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  45.78 
 
 		 254 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  45.97 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  50.43 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  48.56 
 
 		 286 aa  215  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  45.78 
 
 		 254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  48.95 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  45.49 
 
 		 263 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47.47 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  48.37 
 
 		 274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  46.64 
 
 		 272 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  46.46 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  44.89 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  46.15 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  45.38 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  46.22 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  45.68 
 
 		 246 aa  209  5e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  44.14 
 
 		 280 aa  208  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  47.56 
 
 		 271 aa  208  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1077  ATPase  49.76 
 
 		 251 aa  208  8e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.096527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  43.75 
 
 		 252 aa  208  8e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  44.96 
 
 		 271 aa  208  9e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  45.34 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  44.53 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  46.89 
 
 		 256 aa  206  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  45.38 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.56 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  44.23 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  47.39 
 
 		 265 aa  205  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  45.26 
 
 		 259 aa  205  6e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  44.83 
 
 		 259 aa  205  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.54 
 
 		 258 aa  204  8e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  44.83 
 
 		 259 aa  204  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  50.23 
 
 		 274 aa  204  9e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.94 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  50.44 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  45.16 
 
 		 304 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  43.41 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  49.33 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  47.98 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48.25 
 
 		 275 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  42.86 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  47.14 
 
 		 276 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  44.25 
 
 		 267 aa  202  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 437 aa  202  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  46.02 
 
 		 264 aa  202  5e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  48.23 
 
 		 279 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  44.09 
 
 		 278 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  46.05 
 
 		 261 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  48.54 
 
 		 263 aa  202  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  44.26 
 
 		 258 aa  201  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  40.5 
 
 		 251 aa  201  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  43.53 
 
 		 259 aa  201  8e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  45.34 
 
 		 445 aa  201  9e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  50.66 
 
 		 271 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  50 
 
 		 264 aa  201  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  50.43 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  49.33 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  45.98 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  45.27 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  40.59 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3600  ABC transporter related  47.77 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00199632  normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  48.23 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  45.69 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  45.99 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  42.91 
 
 		 432 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  42.91 
 
 		 432 aa  200  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  48.02 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  46.9 
 
 		 253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  45.06 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3407  ABC transporter related  47.77 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.81445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  46.9 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  48.54 
 
 		 297 aa  199  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  47.17 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  52.78 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.89 
 
 		 276 aa  199  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  45.75 
 
 		 445 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  45.19 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  48.67 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  46.22 
 
 		 287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3042  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  46.12 
 
 		 557 aa  199  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.499138  normal  0.908503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>