More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2107 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  100 
 
 		 123 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  56.3 
 
 		 125 aa  148  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 123 aa  113  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  47.86 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 121 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  43.97 
 
 		 121 aa  110  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  43.97 
 
 		 121 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0903  cell division response regulator DivK  43.7 
 
 		 121 aa  110  9e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.91869  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  43.1 
 
 		 121 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  43.1 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  45.3 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  45.3 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.07 
 
 		 1230 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  43.97 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  47.5 
 
 		 128 aa  107  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 123 aa  106  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  45 
 
 		 121 aa  107  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  43.97 
 
 		 121 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  47.79 
 
 		 124 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.93 
 
 		 964 aa  106  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0988  response regulator receiver  45.83 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.634077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  42.73 
 
 		 1200 aa  106  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  43.59 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  39.32 
 
 		 497 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.55 
 
 		 1245 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  45.69 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  46.28 
 
 		 123 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 1771 aa  103  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  46.55 
 
 		 1361 aa  103  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1099  response regulator receiver  46.67 
 
 		 129 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.3 
 
 		 1234 aa  102  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 1792 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  43.1 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  44.44 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 1786 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 1782 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 1784 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.32 
 
 		 1767 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  43.7 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  45.37 
 
 		 1233 aa  101  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.34 
 
 		 1767 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  40.17 
 
 		 1765 aa  100  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.88 
 
 		 1768 aa  100  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0876  response regulator receiver  42.98 
 
 		 526 aa  100  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183507 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 		 392 aa  100  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.69 
 
 		 1362 aa  100  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.05 
 
 		 947 aa  100  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.17 
 
 		 1767 aa  100  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  40.52 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 1765 aa  99.4  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 126 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  39.84 
 
 		 1322 aa  99.8  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  43.52 
 
 		 1236 aa  99.4  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 		 1352 aa  98.6  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2535  response regulator receiver protein  43.93 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.59 
 
 		 1234 aa  98.2  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.53 
 
 		 763 aa  98.6  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 		 1271 aa  98.2  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.59 
 
 		 1238 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.59 
 
 		 1238 aa  97.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 126 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.59 
 
 		 1238 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.59 
 
 		 1238 aa  97.8  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3565  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 126 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  40 
 
 		 932 aa  97.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 947 aa  97.1  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  41.38 
 
 		 1188 aa  96.7  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.23 
 
 		 1223 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 123 aa  96.3  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 1284 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  39.17 
 
 		 1060 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0305  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.21 
 
 		 967 aa  96.7  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000133293 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 1236 aa  96.7  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  38.79 
 
 		 1331 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  39.45 
 
 		 571 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.38 
 
 		 1172 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.52 
 
 		 1236 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.52 
 
 		 1236 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.52 
 
 		 1236 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.81 
 
 		 945 aa  95.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  40 
 
 		 932 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 1044 aa  94.4  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 818 aa  94.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 		 962 aa  94.4  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1943  histidine kinase  45.37 
 
 		 647 aa  94  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.539019  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3009  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 818 aa  94  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>