116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1805 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3472  hypothetical protein  64.6 
 
 		 710 aa  975    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00128156 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1717  phosphoesterase, RecJ-like  53.28 
 
 		 612 aa  662    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.35157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1805  phosphoesterase, RecJ-like protein  100 
 
 		 707 aa  1446    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1489  phosphoesterase domain-containing protein  59.38 
 
 		 722 aa  884    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0735  hypothetical protein  50.58 
 
 		 612 aa  640    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.577185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1551  phosphoesterase domain-containing protein  56.17 
 
 		 611 aa  672    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428573  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1586  phosphoesterase domain-containing protein  56.36 
 
 		 611 aa  683    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.75872  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1073  phosphoesterase RecJ domain protein  53.72 
 
 		 612 aa  679    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0779999  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0559  phosphoesterase domain-containing protein  42.99 
 
 		 761 aa  598  1e-169  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1359  phosphoesterase domain-containing protein  42.86 
 
 		 761 aa  596  1e-169  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.710726  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0279  phosphoesterase domain-containing protein  43.12 
 
 		 761 aa  590  1e-167  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0217  phosphoesterase domain-containing protein  43.05 
 
 		 758 aa  579  1e-164  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0624  phosphoesterase domain-containing protein  42.69 
 
 		 761 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2404  phosphoesterase RecJ domain protein  44.81 
 
 		 648 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0717  phosphoesterase RecJ domain protein  44.28 
 
 		 641 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1907  phosphoesterase RecJ domain protein  46.22 
 
 		 636 aa  514  1e-144  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0129661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2119  phosphoesterase RecJ domain protein  45.7 
 
 		 634 aa  514  1e-144  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0619  phosphoesterase RecJ domain protein  45.96 
 
 		 637 aa  509  1e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.205669  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2720  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.91 
 
 		 735 aa  268  4e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0876  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  34 
 
 		 732 aa  254  4.0000000000000004e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.836846  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1616  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  32.48 
 
 		 725 aa  239  1e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.837282 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2195  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.94 
 
 		 731 aa  230  7e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2931  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  31.14 
 
 		 730 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.522801  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1441  phosphoesterase domain-containing protein  28.5 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1088  chaperone protein DnaJ  39.44 
 
 		 394 aa  56.6  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.038983  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1487  chaperone protein DnaJ  38.03 
 
 		 382 aa  56.2  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.992778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0023  chaperone protein DnaJ  33.67 
 
 		 384 aa  55.1  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2486  Sel1 domain-containing protein  33 
 
 		 688 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.172439  normal  0.868366 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0260  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  27.56 
 
 		 708 aa  52.8  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0777668  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1616  chaperone protein DnaJ  38.16 
 
 		 352 aa  52.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.214383 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1872  chaperone protein DnaJ  36.62 
 
 		 395 aa  51.2  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000340868  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1691  chaperone protein DnaJ  36.62 
 
 		 401 aa  51.2  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.211452  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1191  single strand DNA-specific exonuclease  26.7 
 
 		 736 aa  50.8  0.00008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0127  chaperone DnaJ  34.25 
 
 		 378 aa  49.7  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2869  chaperone protein DnaJ  39.19 
 
 		 382 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1582  chaperone protein DnaJ  33.8 
 
 		 395 aa  49.7  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2463  chaperone protein DnaJ  39.19 
 
 		 382 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.820869  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1693  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.63 
 
 		 757 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1726  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.63 
 
 		 757 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.364642  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  31.94 
 
 		 375 aa  48.9  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0629  chaperone protein DnaJ  33.78 
 
 		 393 aa  48.1  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.976387  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  37.84 
 
 		 380 aa  48.1  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1422  chaperone protein DnaJ  35.21 
 
 		 400 aa  47.8  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.234078  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0627  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.57 
 
 		 697 aa  48.1  0.0006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0979  chaperone DnaJ-like  33.33 
 
 		 401 aa  48.1  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109475 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0703  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40 
 
 		 713 aa  48.1  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  33.33 
 
 		 372 aa  47.8  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2482  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.78 
 
 		 772 aa  47.8  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.676792  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  33.33 
 
 		 387 aa  47.8  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1234  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  35.71 
 
 		 699 aa  47.8  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1146  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.82 
 
 		 722 aa  47.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119982  normal  0.231253 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0543  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.84 
 
 		 771 aa  47.8  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.109089  normal  0.335288 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07680  chaperone protein DnaJ  36.11 
 
 		 373 aa  47.8  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.447562 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  36.49 
 
 		 379 aa  47.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  33.33 
 
 		 387 aa  47  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0900  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  30.32 
 
 		 857 aa  47  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000643224  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  29.11 
 
 		 732 aa  46.2  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3179  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 		 365 aa  46.2  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000698212 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  32.05 
 
 		 380 aa  46.2  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1167  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40 
 
 		 721 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.859366  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2348  chaperone protein DnaJ  35.62 
 
 		 380 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.576372  normal  0.374369 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1235  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40 
 
 		 721 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434132  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0290  chaperone protein DnaJ  29.17 
 
 		 387 aa  46.2  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.000211792  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  32.91 
 
 		 382 aa  45.8  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1107  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.57 
 
 		 749 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.583336  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0071  molecular chaperone, heat shock protein  30 
 
 		 379 aa  45.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1934  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.14 
 
 		 702 aa  45.4  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1475  chaperone protein DnaJ  32.88 
 
 		 385 aa  45.4  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1208  chaperone protein DnaJ  35.62 
 
 		 373 aa  45.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.827822  hitchhiker  0.00896971 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1148  chaperone protein DnaJ  34.67 
 
 		 359 aa  45.8  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.697031  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0493  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.68 
 
 		 705 aa  45.4  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000650099  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  32.88 
 
 		 374 aa  45.8  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2921  chaperone protein DnaJ  36.49 
 
 		 379 aa  45.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3810  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.24 
 
 		 774 aa  45.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0319705 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  28.15 
 
 		 566 aa  45.4  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1147  chaperone protein DnaJ  34.25 
 
 		 373 aa  45.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1652  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.14 
 
 		 702 aa  45.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0212  chaperone protein DnaJ  30.14 
 
 		 372 aa  45.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.321042  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  38.18 
 
 		 385 aa  44.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0378  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.06 
 
 		 865 aa  45.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3601  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.68 
 
 		 711 aa  44.7  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0442861 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  25.36 
 
 		 798 aa  44.7  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  26.7 
 
 		 779 aa  44.3  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0009  chaperone protein DnaJ  36 
 
 		 376 aa  44.7  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0447538  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0541  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  33.68 
 
 		 711 aa  44.3  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0570  chaperone protein DnaJ  28.38 
 
 		 390 aa  44.3  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.603323  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1607  chaperone protein DnaJ  32.05 
 
 		 355 aa  44.3  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.231275  normal  0.231372 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2765  chaperone protein DnaJ  33.33 
 
 		 389 aa  44.3  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137899  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3356  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.68 
 
 		 711 aa  44.3  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.68 
 
 		 734 aa  43.9  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.8 
 
 		 699 aa  44.3  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000012543  hitchhiker  0.000000583672 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1096  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.8 
 
 		 699 aa  44.3  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0013386  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1035  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.8 
 
 		 699 aa  44.3  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000390234  hitchhiker  0.0000000630128 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  33.78 
 
 		 373 aa  43.9  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3592  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.68 
 
 		 705 aa  44.3  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.42208  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3999  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.68 
 
 		 705 aa  44.3  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3726  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.68 
 
 		 705 aa  44.3  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0042224  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0534  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.68 
 
 		 711 aa  44.3  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000544711 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3607  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.68 
 
 		 711 aa  44.3  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4483  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.68 
 
 		 711 aa  44.3  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>