More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1996 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 379 aa  788    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1153  aminotransferase class I and II  75.67 
 
 		 397 aa  607  9.999999999999999e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.454468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  73.02 
 
 		 400 aa  599  1e-170  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0434  aminotransferase class I and II  56.62 
 
 		 393 aa  442  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3813  aminotransferase  59.69 
 
 		 405 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.512222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0910  aminotransferase class I and II  58.55 
 
 		 421 aa  421  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.111037 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  51.19 
 
 		 390 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1235  aminotransferase class I and II  47.48 
 
 		 393 aa  364  1e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0627  aminotransferase class I and II  50.14 
 
 		 369 aa  358  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  46.05 
 
 		 387 aa  351  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1783  aminotransferase class I and II  48.94 
 
 		 390 aa  330  3e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  44.27 
 
 		 413 aa  310  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2793  aminotransferase  42.59 
 
 		 386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  43.23 
 
 		 397 aa  306  3e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  44.33 
 
 		 409 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  42.82 
 
 		 395 aa  301  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  43.8 
 
 		 389 aa  298  7e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  42.49 
 
 		 395 aa  298  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  44.83 
 
 		 402 aa  292  6e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1729  aminotransferase  42.71 
 
 		 385 aa  292  8e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118879  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0798  aspartate aminotransferase  42.22 
 
 		 387 aa  291  9e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.96 
 
 		 387 aa  291  1e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  41.73 
 
 		 394 aa  289  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.68 
 
 		 385 aa  289  7e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  42.37 
 
 		 382 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  39.74 
 
 		 389 aa  286  4e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  40.62 
 
 		 384 aa  285  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  41.46 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  42.13 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1353  aspartate aminotransferase  43.27 
 
 		 385 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  40.05 
 
 		 386 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  43.39 
 
 		 388 aa  282  6.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1502  aminotransferase class I and II  42.63 
 
 		 388 aa  282  7.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000290558  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  40.92 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  42.74 
 
 		 387 aa  280  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1558  aminotransferase class I and II  39.74 
 
 		 386 aa  280  4e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0317788  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  42.02 
 
 		 401 aa  279  7e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  40.81 
 
 		 394 aa  279  7e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  38.21 
 
 		 387 aa  278  8e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  40.27 
 
 		 394 aa  278  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  42.71 
 
 		 387 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  40 
 
 		 409 aa  275  9e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  40 
 
 		 384 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  40.41 
 
 		 395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  38.48 
 
 		 385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  40.38 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  41.77 
 
 		 421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  40 
 
 		 392 aa  273  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  39.3 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  41.53 
 
 		 381 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  38.69 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  37.94 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  40.31 
 
 		 391 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.16 
 
 		 413 aa  269  7e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  40.21 
 
 		 393 aa  268  8.999999999999999e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1947  aminotransferase  39.31 
 
 		 400 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.128663 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  40.65 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  39.79 
 
 		 391 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  40.37 
 
 		 387 aa  266  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  37.4 
 
 		 383 aa  266  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  39.08 
 
 		 386 aa  266  5e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  37.4 
 
 		 383 aa  266  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  37.14 
 
 		 389 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  40.21 
 
 		 408 aa  265  8e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  37.7 
 
 		 388 aa  265  8.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  40.99 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  38.12 
 
 		 391 aa  263  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  38.76 
 
 		 389 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  38.2 
 
 		 388 aa  263  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  37.73 
 
 		 388 aa  260  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  40.47 
 
 		 397 aa  260  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4927  putative aminotransferase  37.94 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  37.93 
 
 		 399 aa  259  7e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  39.64 
 
 		 397 aa  259  8e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  39.3 
 
 		 391 aa  258  8e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  37.01 
 
 		 385 aa  258  9e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  38.18 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0752  aminotransferase, class I and II  38.72 
 
 		 399 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  36.65 
 
 		 385 aa  257  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  38.92 
 
 		 391 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  38.55 
 
 		 396 aa  258  2e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1981  putative aminotransferase  37.73 
 
 		 396 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2834  aminotransferase class I and II  40.16 
 
 		 386 aa  256  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1369  putative aminotransferase  38.44 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  38.85 
 
 		 400 aa  256  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2249  putative aminotransferase  38.52 
 
 		 390 aa  255  7e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369728  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  36.48 
 
 		 386 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  36.48 
 
 		 386 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  39.51 
 
 		 383 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  35.64 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1613  putative aminotransferase  38.26 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2225  putative aminotransferase  38.26 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4804  aminotransferase class I and II  34 
 
 		 413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.607245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  36.41 
 
 		 390 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  38.76 
 
 		 389 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  38.76 
 
 		 389 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.344557 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  36.48 
 
 		 386 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  36.48 
 
 		 386 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  36.48 
 
 		 386 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  37.01 
 
 		 385 aa  253  5.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>