More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0633 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0633  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 259 aa  514  1.0000000000000001e-145  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2485  hypothetical protein  80.69 
 
 		 255 aa  391  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2221  ABC-2 type transporter  69.17 
 
 		 241 aa  342  2e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0188043 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1227  ABC-2 type transporter  35.66 
 
 		 249 aa  174  9e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1576  hypothetical protein  37.1 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  35.98 
 
 		 251 aa  165  8e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0022  ABC-2 type transporter  34.31 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2468  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2256  ABC-2 type transporter  36.21 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.038902 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  34.44 
 
 		 245 aa  118  7.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0987  ABC-2 type transporter  33.61 
 
 		 247 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0449521 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0271  ABC-2 type transporter  33.64 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0843829  hitchhiker  0.000145713 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.76 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.8 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  26.69 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  30.15 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 372 aa  65.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.57 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  29.83 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.6 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 288 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  31.85 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  24.19 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.57 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.57 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  22.08 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5370  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.94 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  26.67 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.51 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  29.77 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  24.07 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  29.3 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.17 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4674  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0280  ABC-2 type transporter  30.25 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0967  ABC-2 type transporter  23.44 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  28 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2004  ABC-2 type transporter  22.71 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  28.1 
 
 		 376 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  24.85 
 
 		 371 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 381 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00580  ABC-2 type transport system permease protein  26.9 
 
 		 369 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0449353  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.49 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 443 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  32.45 
 
 		 339 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0755  ABC-2 type transporter  25.9 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  28.41 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2056  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.374499  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  25.65 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2524  ABC-2 type transporter  27.81 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0411  putative NodJ  32.14 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  24.6 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3348  ABC transporter, permease protein  23.68 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0192428  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  27.33 
 
 		 372 aa  52.8  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_354  ABC-2 type transport system, permease protein  32.14 
 
 		 255 aa  53.1  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.216034  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  23.08 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0747  hypothetical protein  26.23 
 
 		 253 aa  53.1  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  23.68 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  23.16 
 
 		 256 aa  52.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  28.29 
 
 		 378 aa  52.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1192  ABC-2 type transporter  25.32 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  26.77 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2722  ABC transporter membrane spanning protein  24.5 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  24.4 
 
 		 232 aa  52.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0013  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 251 aa  52.4  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.728607  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0276  ABC-2 type transporter, NodJ  27.56 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.664635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 381 aa  52  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  28.49 
 
 		 241 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  29.11 
 
 		 360 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 370 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2346  ABC transporter  23.46 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  29.36 
 
 		 277 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1804  ABC-2 type transporter  22.31 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128108 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 		 336 aa  51.6  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  26.82 
 
 		 369 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2484  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.308148  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  26.67 
 
 		 372 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27780  putative ABC transporter, permease protein  23.46 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.235012 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  31.91 
 
 		 339 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  31.91 
 
 		 339 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1012  ABC transporter, permease protein  27.04 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000447992  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  23.16 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1142  ABC transporter permease protein  27.04 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0101435  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  28.97 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03454  hypothetical protein  22.63 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4411  ABC-2 type transporter  27.68 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 296 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>