77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3365 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3365  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  584  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00368392  normal  0.053126 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1835  hypothetical protein  39.86 
 
 		 289 aa  199  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000837176  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3359  hypothetical protein  40.4 
 
 		 294 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0941553  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.93 
 
 		 307 aa  176  6e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  35.53 
 
 		 301 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3366  hypothetical protein  34.45 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00324933  normal  0.0324358 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1412  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 352 aa  89  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0757  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  31.43 
 
 		 367 aa  87.8  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like  29.21 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.584493  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2072  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  26.46 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2074  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  29.08 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2073  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  25.29 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1341  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  28.96 
 
 		 363 aa  77.8  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.207775  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3124  ABC transporter permease protein  26.38 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2874  ABC transporter permease protein  25.33 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.77039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2548  hypothetical protein  25.11 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1432  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  27.6 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2165  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  31.73 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1578  hypothetical protein  26.55 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0086  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3759  ABC-2 type transporter  22.71 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2085  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  28.43 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0725  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  29.86 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3208  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  27.54 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0106078  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4072  copper ABC transporter permease  24.73 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0317141  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3643  ABC-2 type transporter  23.75 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1372  NosY transmembrane protein  23.96 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4913  ABC transporter transmembrane protein  27.17 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.589533  decreased coverage  0.000401262 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1393  ABC transporter transmembrane protein  24.87 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2634  ABC-2 type transporter  23.38 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3145  nitrous oxide metabolic protein  27.42 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1643  ABC-2 type transporter  27.51 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1625  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0633194  normal  0.92428 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2322  membrane protein nosY  22.7 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.761196  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0213  membrane protein NosY  24.74 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2118  copper ABC transporter, permease protein  28.18 
 
 		 278 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0992  copper ABC transporter, permease protein NosY, putative  28.18 
 
 		 278 aa  52.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.953803  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0659  ABC-2 type transporter  24.02 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2567  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  20.86 
 
 		 276 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.240437  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2258  hypothetical protein  27.27 
 
 		 278 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4447  copper ABC transporter, permease protein  30.95 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0457  ABC-2 type transporter  27.32 
 
 		 324 aa  50.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4735  copper ABC transporter, permease protein  25.81 
 
 		 272 aa  50.4  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.371219  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2063  copper ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 		 278 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439493  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1716  copper ABC transporter permease  33.02 
 
 		 283 aa  50.1  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3202  putative transmembrane protein  27.27 
 
 		 275 aa  49.7  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1425  ABC-2 type transporter for copper permease protein  24.06 
 
 		 272 aa  48.9  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0140  NosY protein  24.21 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3332  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component-like protein  22.22 
 
 		 483 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300875  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0488  copper ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3324  NosL family protein  22.83 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3357  copper ABC transporter, permease protein  24.19 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.668342  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1056  ABC-2 type transporter  26.2 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1135  ABC-2 type transporter  26.2 
 
 		 271 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.014071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1479  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 		 271 aa  47  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0431  nitrous oxide metabolic protein  25 
 
 		 275 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.856673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2082  ABC-2 type transporter  23.86 
 
 		 319 aa  46.2  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3360  hypothetical protein  22.4 
 
 		 465 aa  45.8  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.435546 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2354  nitrous oxide metabolic protein  24.19 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4468  copper ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0498  copper ABC transporter, permease protein  29.63 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0497  copper ABC transporter, permease protein  25.71 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0488  copper ABC transporter, permease protein  28.57 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3533  copper ABC transporter, permease protein  28.95 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3197  nitrous oxide maturation protein NosY  24.09 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4343  NosY, nitrous-oxide reductase, NosY component  26.32 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0228  ABC-2 type transporter  27.94 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1083  ABC-2 type transporter  30.28 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  23.33 
 
 		 366 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2566  ABC-2 type transporter  27.43 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  24.76 
 
 		 927 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2858  copper ABC transporter, permease protein NosY  25.86 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2968  copper ABC transporter permease  24.71 
 
 		 279 aa  43.1  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.135557  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2216  nitrous oxide metabolic protein  23.66 
 
 		 272 aa  42.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3403  ABC-2 type transporter  21.6 
 
 		 272 aa  42.4  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.257748  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>