51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1576 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  100 
 
 		 350 aa  704    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  69.63 
 
 		 347 aa  496  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0626  putative translation factor pelota  50.71 
 
 		 351 aa  375  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.991887  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0937  putative translation factor pelota  41.55 
 
 		 341 aa  273  3e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0307408  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1329  putative translation factor pelota  42.12 
 
 		 341 aa  272  7e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.520708 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1565  translation factor pelota  40.06 
 
 		 340 aa  260  3e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.718031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0438  putative translation factor pelota  42.43 
 
 		 341 aa  259  4e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.750363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  41.52 
 
 		 348 aa  259  7e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  40.56 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2924  translation factor pelota  40.34 
 
 		 356 aa  256  6e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  40.06 
 
 		 348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  40.06 
 
 		 342 aa  249  6e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  38.3 
 
 		 348 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  38.01 
 
 		 348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  41.74 
 
 		 355 aa  242  7e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1591  cell division protein pelota  38.01 
 
 		 348 aa  241  9e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2121  translation factor pelota  39.94 
 
 		 355 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.163385  normal  0.700321 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  40.39 
 
 		 355 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0342  translation factor pelota  38.1 
 
 		 328 aa  216  5e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1062  translation factor pelota  30.95 
 
 		 344 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24748  predicted protein  27.82 
 
 		 413 aa  131  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0109  eRF1 domain-containing 1 protein  26.59 
 
 		 349 aa  123  6e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000388933 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42885  predicted protein  28.68 
 
 		 395 aa  119  9e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04530  translation factor pelota, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02960)  26.84 
 
 		 403 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.664166  decreased coverage  0.00419597 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44170  predicted protein  26.27 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.717736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0491  eRF1 domain-containing 1 protein  27.25 
 
 		 330 aa  113  5e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2156  cell division protein pelota  27.84 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0245621  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0556  eRF1 domain-containing protein  27.11 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1763  cell division protein pelota  27.71 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000803667 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00930  pelota, putative  23.51 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0299897  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1714  eRF1 domain-containing 1 protein  26.88 
 
 		 333 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.839139  normal  0.0545178 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1534  eRF1 domain-containing 1 protein  26.3 
 
 		 330 aa  96.7  6e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1858  eRF1 domain-containing protein  29.63 
 
 		 338 aa  94  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.61394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  32.78 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  25.69 
 
 		 413 aa  56.2  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  27.63 
 
 		 423 aa  53.1  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  26.94 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0287  peptide chain release factor 1  27.71 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  24.55 
 
 		 417 aa  49.7  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  27.86 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1738  peptide chain release factor 1  27.5 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  28.08 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80337  transcriptional release factor (ERF1)  26.51 
 
 		 436 aa  47  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.565887  normal  0.0934364 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  24.31 
 
 		 417 aa  47  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05580  translation release factor, putative  28.57 
 
 		 439 aa  47  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690785  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  25.32 
 
 		 357 aa  47  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0264  peptide chain release factor 1  27.42 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000379955 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  23.81 
 
 		 410 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  26.9 
 
 		 415 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  25.77 
 
 		 338 aa  44.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08853  ERF1_PODAN Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 (ERF1) (Eukaryotic release factor 1)Eukaryotic polypeptide releasing factor ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJX9]  31.07 
 
 		 435 aa  42.7  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>