More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1341 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1341  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 203 aa  413  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1864  ABC transporter related  54.23 
 
 		 205 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0039  ABC transporter related  55.38 
 
 		 202 aa  237  8e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.118925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1275  ABC transporter related  52.5 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0328  ABC transporter related  50.25 
 
 		 204 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0212  ABC transporter-like  52 
 
 		 209 aa  219  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0015  ABC transporter-like  50.75 
 
 		 205 aa  218  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.794177  normal  0.0136608 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0191  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 		 208 aa  217  1e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1469  ABC transporter related protein  48.22 
 
 		 207 aa  214  8e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1325  ATPase  48.45 
 
 		 200 aa  203  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.525584  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2554  ABC transporter related  47 
 
 		 212 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0272018  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2199  ABC transporter related  42.35 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0438677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1129  ABC transporter related  41.27 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368288  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1075  nickel ABC transporter, ATP-binding protein  41.27 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3551  nickel ABC transporter ATP-binding protein  41.27 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00474231  normal  0.0402539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3070  ABC transporter related  41.55 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.024747  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1380  ABC transporter ATP-binding protein  39.89 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.397211 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2102  ABC transporter ATP-binding protein  40.11 
 
 		 196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000123245 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1365  ATP-binding protein of ABC transport system  40.11 
 
 		 196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.290603  hitchhiker  0.00148941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1921  ATP-binding protein of ABC transport system  39.89 
 
 		 196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000629617  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1349  ATP-binding protein of ABC transport system  39.89 
 
 		 196 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000774102  normal  0.444548 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3640  ABC transporter related  43.82 
 
 		 198 aa  145  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0641  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.75 
 
 		 230 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  34.47 
 
 		 269 aa  136  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3716  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.94 
 
 		 524 aa  136  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  35.92 
 
 		 268 aa  135  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0160  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.69 
 
 		 320 aa  133  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1838  nickel transporter ATP-binding protein NikE  33.01 
 
 		 268 aa  132  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  hitchhiker  0.00699569 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0024  ABC transporter related protein  34 
 
 		 254 aa  132  5e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000767046  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1679  putative dipeptide ABC transporter  38.97 
 
 		 196 aa  131  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  34.67 
 
 		 258 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.55 
 
 		 260 aa  130  9e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  34.52 
 
 		 550 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2773  ABC transporter related  35.81 
 
 		 250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  33.96 
 
 		 257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1280  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.66 
 
 		 235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5293  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.9 
 
 		 294 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  33.17 
 
 		 516 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0306  ABC transporter-like protein  34.63 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26290  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  29.81 
 
 		 566 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.152268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2207  ABC transporter related  33.17 
 
 		 549 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252505  normal  0.194829 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0213  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.01 
 
 		 257 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3863  ABC transporter related  35.44 
 
 		 269 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5111  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.01 
 
 		 257 aa  128  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0193  ABC transporter related  35.86 
 
 		 239 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.58083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0173  ABC transporter related  33.01 
 
 		 257 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  32.26 
 
 		 566 aa  128  7.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0208  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.54 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0189  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  32.54 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0188  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  32.54 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2826  ABC transporter related  36.13 
 
 		 572 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.0638843 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0189  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 257 aa  125  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.67 
 
 		 254 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0208  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.06 
 
 		 257 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00492  ABC transporter ATPase component  35.42 
 
 		 571 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4132  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  32.69 
 
 		 322 aa  125  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0930  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  33.5 
 
 		 322 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0560  ABC transporter related  31.53 
 
 		 542 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000861738  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1234  ABC transporter related  35.05 
 
 		 270 aa  125  5e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0176  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.06 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0232  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  32.06 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  31.13 
 
 		 539 aa  124  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4401  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  31.16 
 
 		 325 aa  125  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.433175 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  31.22 
 
 		 545 aa  125  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0077  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.5 
 
 		 327 aa  124  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.221676  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2015  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.13 
 
 		 329 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.471661  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2541  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  34.01 
 
 		 337 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000886627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001975  peptide ABC transporter ATP-binding protein  34.9 
 
 		 571 aa  124  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.175781  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0783  ABC transporter related  31.51 
 
 		 295 aa  124  8.000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.806728 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0425  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.71 
 
 		 323 aa  123  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  33.01 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2563  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.36 
 
 		 571 aa  123  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000295279  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1972  ABC transporter related  34 
 
 		 273 aa  123  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  29.61 
 
 		 547 aa  123  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  33.33 
 
 		 593 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0179  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  31.73 
 
 		 257 aa  122  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0138  ABC transporter related  32.66 
 
 		 308 aa  122  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.99 
 
 		 564 aa  122  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1929  ABC transporter related  29.03 
 
 		 271 aa  122  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1802  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.22 
 
 		 307 aa  122  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0111168  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  33.33 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  30 
 
 		 543 aa  121  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2853  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 		 322 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.242382 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5512  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  31.63 
 
 		 366 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.312894 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2990  ABC transporter, ATPase subunit  31.43 
 
 		 559 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4117  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.68 
 
 		 332 aa  122  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.725576  normal  0.145061 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  34.85 
 
 		 576 aa  122  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0672  ABC transporter related  30.1 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.92463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1429  ABC transporter related  33.66 
 
 		 561 aa  121  6e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.531386 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1033  ABC transporter related  34.67 
 
 		 248 aa  121  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1451  ABC transporter related  31.02 
 
 		 555 aa  121  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  30.66 
 
 		 256 aa  121  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  35.82 
 
 		 247 aa  121  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  33.02 
 
 		 265 aa  121  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0066  ABC transporter related protein  31.91 
 
 		 303 aa  121  8e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3544  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.91 
 
 		 328 aa  121  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1440  ABC transporter related  33.65 
 
 		 233 aa  121  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.926008  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1469  ABC transporter related  33.65 
 
 		 233 aa  121  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0083934  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0660  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  31.98 
 
 		 326 aa  121  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  32.04 
 
 		 253 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>