More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0919 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0919  GMP synthase subunit A  100 
 
 		 189 aa  385  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2002  GMP synthase subunit A  73.54 
 
 		 189 aa  307  5.9999999999999995e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0166  GMP synthase subunit A  60 
 
 		 181 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1489  GMP synthase, small subunit  57.84 
 
 		 184 aa  210  7.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0704  GMP synthase subunit A  58.38 
 
 		 184 aa  209  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.2759 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2444  GMP synthase, small subunit  57.61 
 
 		 184 aa  203  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.433142  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1588  GMP synthase subunit A  55.74 
 
 		 188 aa  202  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  51.65 
 
 		 188 aa  193  1e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2424  GMP synthase subunit A  52.72 
 
 		 182 aa  190  9e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176542  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0736  GMP synthase subunit A  49.19 
 
 		 184 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.683361  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0029  GMP synthase subunit A  51.91 
 
 		 183 aa  187  5.999999999999999e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0133  GMP synthase subunit A  49.45 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361551  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1228  GMP synthase subunit A  48.35 
 
 		 189 aa  185  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1547  GMP synthase subunit A  50 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0690  GMP synthase subunit A  47.8 
 
 		 189 aa  182  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.635266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0571  GMP synthase subunit A  53.51 
 
 		 184 aa  181  5.0000000000000004e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  45.05 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0606  GMP synthase, small subunit  40.31 
 
 		 196 aa  152  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0254  GMP synthase, small subunit  40 
 
 		 188 aa  144  6e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  40.88 
 
 		 527 aa  140  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1183  GMP synthase C terminal domain protein  40.11 
 
 		 523 aa  136  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.853141 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1203  glutamine amidotransferase class-I  42.25 
 
 		 188 aa  135  4e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.858252  hitchhiker  0.00205906 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  41.18 
 
 		 511 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  37.84 
 
 		 513 aa  134  7.000000000000001e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08800  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.56 
 
 		 533 aa  134  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  38.74 
 
 		 516 aa  133  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1364  GMP synthase subunit A  40.74 
 
 		 189 aa  134  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  41.4 
 
 		 515 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  39.78 
 
 		 533 aa  132  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  40.53 
 
 		 513 aa  132  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  40 
 
 		 506 aa  131  5e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  37.43 
 
 		 514 aa  130  7.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0749  GMP synthase  40 
 
 		 547 aa  130  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1516  GMP synthase  44.75 
 
 		 505 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  37.84 
 
 		 511 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  36.41 
 
 		 525 aa  129  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  38.3 
 
 		 517 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.89 
 
 		 526 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  36.32 
 
 		 510 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  37.37 
 
 		 510 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  38.38 
 
 		 513 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  35.45 
 
 		 520 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  37.57 
 
 		 528 aa  129  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1723  GMP synthase  44.51 
 
 		 505 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.734167 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  37.43 
 
 		 529 aa  128  5.0000000000000004e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  36.51 
 
 		 510 aa  128  6e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1250  GMP synthase, large subunit  38.46 
 
 		 523 aa  127  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026459  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  36.02 
 
 		 523 aa  127  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.74 
 
 		 510 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1385  GMP synthase  36.76 
 
 		 511 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  37.57 
 
 		 512 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  35.14 
 
 		 511 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  37.1 
 
 		 509 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  37.37 
 
 		 510 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  36.84 
 
 		 509 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  37.37 
 
 		 509 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2576  GMP synthase  38.46 
 
 		 529 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141885 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  36.98 
 
 		 522 aa  125  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  38.38 
 
 		 511 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3119  GMP synthase  36.92 
 
 		 525 aa  125  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1573  GMP synthase  35.48 
 
 		 507 aa  125  5e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  37.57 
 
 		 512 aa  125  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1298  GMP synthase  37.76 
 
 		 525 aa  124  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  36.46 
 
 		 526 aa  124  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  37.57 
 
 		 512 aa  124  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  37.37 
 
 		 511 aa  124  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  37.02 
 
 		 515 aa  124  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  37.02 
 
 		 515 aa  124  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  37.02 
 
 		 515 aa  124  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  37.02 
 
 		 512 aa  124  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  37.84 
 
 		 507 aa  124  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  35.98 
 
 		 520 aa  124  9e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  37.02 
 
 		 512 aa  124  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0638  GMP synthase  36.65 
 
 		 511 aa  124  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1314  GMP synthase  37.06 
 
 		 525 aa  123  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.867472  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  39.89 
 
 		 511 aa  124  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0645  GMP synthase, large subunit  38.12 
 
 		 507 aa  124  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1269  GMP synthase  36.92 
 
 		 525 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0189098  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3003  GMP synthase  36.92 
 
 		 525 aa  123  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.417306  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  36.84 
 
 		 522 aa  123  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0650  GMP synthase, large subunit  37.57 
 
 		 534 aa  123  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.371588  normal  0.419451 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  35.08 
 
 		 512 aa  123  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19190  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.84 
 
 		 536 aa  122  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0538351 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  37.02 
 
 		 512 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1264  GMP synthase  36.22 
 
 		 511 aa  123  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  36.02 
 
 		 508 aa  123  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  35.36 
 
 		 516 aa  122  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  33.85 
 
 		 525 aa  122  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  36.46 
 
 		 512 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  36.46 
 
 		 515 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0337  GMP synthase, large subunit  36.56 
 
 		 510 aa  122  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10270  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.36 
 
 		 530 aa  122  4e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.38684 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1772  GMP synthase  41.85 
 
 		 505 aa  121  6e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.564322  hitchhiker  0.00463456 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1555  GMP synthase  36.22 
 
 		 510 aa  121  6e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  34.95 
 
 		 528 aa  121  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0477  GMP synthase  36.22 
 
 		 511 aa  121  7e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2869  GMP synthase  38.46 
 
 		 529 aa  120  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.256862  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0342  GMP synthase  37.57 
 
 		 514 aa  120  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  33.87 
 
 		 507 aa  120  9e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  36.84 
 
 		 511 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>