102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0700 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0700  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
155 aa  316  6e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.363105 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1909  alkylhydroperoxidase-like protein  53.95 
 
 
149 aa  178  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0493  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.884775  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0332  alkylhydroperoxidase  49.06 
 
 
144 aa  117  7e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1046  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1580  alkylhydroperoxidase  41.61 
 
 
144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.589547  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0548  hypothetical protein  37.6 
 
 
144 aa  97.4  7e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.142286 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2298  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.84 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2058  alkylhydroperoxidase  35.71 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.567856  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2441  alkylhydroperoxidase  31.61 
 
 
163 aa  85.1  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0248  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.54 
 
 
150 aa  84.7  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1559  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.589442  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2388  alkylhydroperoxidase  40.62 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0786304  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1382  alkylhydroperoxidase  32.41 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0810  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  39.68 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4864  alkylhydroperoxidase  37.31 
 
 
131 aa  51.2  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0960  alkylhydroperoxidase  36.92 
 
 
113 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4447  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
115 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0188771  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0076  alkylhydroperoxidase  34.21 
 
 
134 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2422  alkylhydroperoxidase-like protein  32.63 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.231154  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3027  alkylhydroperoxidase  35.94 
 
 
112 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2062  alkylhydroperoxidase  32.63 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470283  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1372  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.06 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0412  alkylhydroperoxidase  32.38 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2957  alkylhydroperoxidase  35.62 
 
 
115 aa  49.7  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.656402 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1616  alkylhydroperoxidase  33.85 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630224  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3273  alkylhydroperoxidase  31.58 
 
 
114 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.11 
 
 
178 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2594  alkylhydroperoxidase  32.93 
 
 
108 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.403755  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3878  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.93 
 
 
109 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0630  alkylhydroperoxidase-like protein  34.52 
 
 
98 aa  46.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.11265  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0305  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.93 
 
 
109 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0666  alkylhydroperoxidase  32.93 
 
 
109 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0788  alkylhydroperoxidase  32.93 
 
 
109 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0757  alkylhydroperoxidase  32.93 
 
 
109 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0689  alkylhydroperoxidase  32.93 
 
 
109 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.262808  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4255  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  35.94 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4897  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.52 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3266  alkylhydroperoxidase  34.52 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6910  alkylhydroperoxidase  34.52 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4434  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3423  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1966  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.5 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14987  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1343  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.67 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.555544 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1638  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.5 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.139612  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.23 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120276  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0545  alkylhydroperoxidase  29.63 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00390564  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0531  alkylhydroperoxidase  34.38 
 
 
111 aa  45.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267067  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  24.47 
 
 
177 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0497  alkylhydroperoxidase  40.82 
 
 
114 aa  44.7  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.40883 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6446  alkylhydroperoxidase  27 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0195398  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0074  alkylhydroperoxidase  28.77 
 
 
115 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6153  alkylhydroperoxidase  27 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163282  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2116  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.11 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3145  carboxymuconolactone decarboxylase  37.14 
 
 
166 aa  44.3  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.821034  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0284  alkylhydroperoxidase  32.26 
 
 
116 aa  44.3  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2663  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.27 
 
 
134 aa  44.3  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07355  hypothetical protein  29.25 
 
 
112 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0669  hypothetical protein  29.25 
 
 
112 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2178  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.32 
 
 
117 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783696  hitchhiker  5.56678e-19 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0360  carboxymuconolactone decarboxylase  29.79 
 
 
117 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4192  alkylhydroperoxidase AhpD  34.38 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.222216 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1151  hypothetical protein  38.1 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4300  alkylhydroperoxidase  28.44 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.74871 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0152  alkylhydroperoxidase  28.44 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.909501  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02489  carboxymuconolactone decarboxylase  30.99 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0707  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.33 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1458  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.94 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.27365  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1160  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.137487 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1155  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.75 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.24424 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1580  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.63 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15118  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  24.69 
 
 
225 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12358  carboxymuconolactone decarboxylase  32.26 
 
 
116 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3382  hypothetical protein  31.09 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.282694  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4131  alkylhydroperoxidase  30.16 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2677  alkylhydroperoxidase  33.77 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1182  alkylhydroperoxidase  37.5 
 
 
163 aa  42  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3032  alkylhydroperoxidase  29.59 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  31.94 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0301  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.36 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4301  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 
120 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.350468  normal  0.0338908 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  23.4 
 
 
177 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0827  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.09 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0858  alkylhydroperoxidase  38.33 
 
 
88 aa  41.2  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0911009  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1284  alkylhydroperoxidase  31.75 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5451  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.18 
 
 
117 aa  41.2  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.528829  normal  0.936262 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.37 
 
 
178 aa  41.2  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1303  alkylhydroperoxidase  30.16 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1171  alkylhydroperoxidase  31.75 
 
 
121 aa  40.8  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5750  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.16 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.36901 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  23.08 
 
 
177 aa  40.8  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0840  alkylhydroperoxidase  31.88 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4997  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.29 
 
 
156 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.56474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5085  alkylhydroperoxidase  35.29 
 
 
156 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3419  alkylhydroperoxidase  25.61 
 
 
123 aa  40.4  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0197505  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5378  alkylhydroperoxidase  35.29 
 
 
156 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28383  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1281  alkylhydroperoxidase  32.5 
 
 
100 aa  40.4  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.534657  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1265  alkylhydroperoxidase  27.85 
 
 
101 aa  40.4  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0145354 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>