More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3906 on replicon NC_008739
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008739  Maqu_3906  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  634    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2674  LysR family transcriptional regulator  62.33 
 
 		 294 aa  394  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0765  LysR, substrate-binding  61.09 
 
 		 299 aa  391  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.960601  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1066  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.567936  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2774  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 298 aa  209  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446959 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3570  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  37.02 
 
 		 302 aa  198  9e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.52 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  35.99 
 
 		 307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3413  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4475  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 301 aa  196  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4422  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481788 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2375  transcriptional regulator, LysR family  34.36 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00507322  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  35.49 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  35.76 
 
 		 299 aa  192  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4333  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.207282 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3839  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  36.18 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  35.22 
 
 		 335 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 296 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1391  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 298 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0065  transcription regulator protein  33.79 
 
 		 312 aa  189  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  35.15 
 
 		 293 aa  188  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  35.31 
 
 		 304 aa  188  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3361  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 303 aa  187  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2617  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000166311  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1031  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10730  transcriptional regulator, LysR family  37.59 
 
 		 311 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3684  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 309 aa  185  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1347  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 312 aa  185  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.336134 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4209  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00680  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2734  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4214  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.383155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0056  putative transcriptional regulator  35.64 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1543  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 299 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2979  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438714  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05458  transcription regulator protein  35.4 
 
 		 298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3953  transcriptional regulator, LysR family  33.99 
 
 		 300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  32.42 
 
 		 305 aa  182  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3740  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 315 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4797  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0282773  hitchhiker  0.00000720419 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2624  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0210848  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0813  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.909105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1679  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0936  transcriptional regulator  36.05 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434313  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2357  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.2 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.673893  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1855  transcriptional regulator  36.05 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0750  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.63163  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0412  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3230  regulatory protein, LysR  34.68 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.796191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2524  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1469  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3128  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 349 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1701  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2663  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 328 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1480  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191498 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1839  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 336 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0596  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 336 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0872  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 336 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1112  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 336 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358465  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2329  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 354 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1646  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 354 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3902  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 296 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2989  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.061408 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1581  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 312 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1864  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 331 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.708451  normal  0.0358907 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 305 aa  179  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0953  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 300 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4285  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 315 aa  179  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.300927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01980  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 312 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.445097 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4325  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 315 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1323  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 300 aa  178  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4041  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 315 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4247  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  178  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 322 aa  178  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0237  putative transcriptional regulator  34.93 
 
 		 355 aa  178  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0927  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.503807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2586  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 301 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0277024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04020  Transcriptional regulator, LysR family  34.22 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.010464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>