More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4214 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4214  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  646    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.383155 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3740  LysR family transcriptional regulator  99.68 
 
 		 315 aa  645    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1681  LysR family transcriptional regulator  96.83 
 
 		 315 aa  629  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446962  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4325  LysR family transcriptional regulator  96.51 
 
 		 315 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4041  LysR family transcriptional regulator  96.51 
 
 		 315 aa  626  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3196  LysR family transcriptional regulator  95.56 
 
 		 315 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4285  LysR family transcriptional regulator  92.38 
 
 		 315 aa  600  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.300927 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1839  LysR family transcriptional regulator  83.12 
 
 		 336 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0596  LysR family transcriptional regulator  83.12 
 
 		 336 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2329  LysR family transcriptional regulator  83.12 
 
 		 354 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0872  LysR family transcriptional regulator  83.12 
 
 		 336 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1646  LysR family transcriptional regulator  83.12 
 
 		 354 aa  521  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1112  LysR family transcriptional regulator  83.12 
 
 		 336 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358465  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1025  LysR family transcriptional regulator  82.47 
 
 		 336 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.951762  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4797  transcriptional regulator, LysR family  72.73 
 
 		 331 aa  471  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0282773  hitchhiker  0.00000720419 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1864  LysR family transcriptional regulator  71.61 
 
 		 331 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.708451  normal  0.0358907 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5074  LysR family transcriptional regulator  71.06 
 
 		 332 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2780  transcriptional regulator, LysR family  59.49 
 
 		 312 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.916486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1581  LysR family transcriptional regulator  59.49 
 
 		 312 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.457037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1371  LysR family transcriptional regulator  59.15 
 
 		 313 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1450  LysR family transcriptional regulator  57.56 
 
 		 313 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1428  LysR family transcriptional regulator  57.56 
 
 		 313 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.986267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4595  LysR family transcriptional regulator  57.88 
 
 		 313 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.489457  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1332  LysR family transcriptional regulator  59.15 
 
 		 313 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601876  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1347  LysR family transcriptional regulator  58.01 
 
 		 312 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.336134 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0968  LysR family transcriptional regulator  57.56 
 
 		 313 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1865  LysR family transcriptional regulator  58.94 
 
 		 313 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000631239 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1679  LysR family transcriptional regulator  57.28 
 
 		 313 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1469  LysR family transcriptional regulator  57.28 
 
 		 313 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0936  transcriptional regulator  57.28 
 
 		 313 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434313  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1855  transcriptional regulator  57.28 
 
 		 313 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1701  LysR family transcriptional regulator  57.28 
 
 		 313 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0412  LysR family transcriptional regulator  57.28 
 
 		 313 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0750  LysR family transcriptional regulator  57.28 
 
 		 313 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.63163  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2624  transcriptional regulator  57.28 
 
 		 313 aa  360  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0210848  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1210  putative transcriptional regulator  56.29 
 
 		 317 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4584  LysR family transcriptional regulator  54.67 
 
 		 315 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13510  LysR family transcriptional regulator  55.63 
 
 		 317 aa  343  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0865  LysR family transcriptional regulator  54.33 
 
 		 315 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1262  LysR family transcriptional regulator  54 
 
 		 315 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.902208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4461  LysR family transcriptional regulator  54 
 
 		 315 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1216  transcriptional regulator, LysR family  54.64 
 
 		 315 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1044  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  54.64 
 
 		 332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.865685  normal  0.351691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2420  LysR family transcriptional regulator  49.19 
 
 		 334 aa  324  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259227 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0937  LysR family transcriptional regulator  52 
 
 		 322 aa  321  8e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04020  Transcriptional regulator, LysR family  48.73 
 
 		 323 aa  312  4.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.010464  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0237  putative transcriptional regulator  50.17 
 
 		 355 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6200  LysR family transcriptional regulator  52.43 
 
 		 316 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0503075 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6676  LysR family transcriptional regulator  52.43 
 
 		 316 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.454387  normal  0.341133 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5833  LysR family transcriptional regulator  52.43 
 
 		 316 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4638  transcriptional regulator  50.33 
 
 		 314 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6527  LysR family transcriptional regulator  51.46 
 
 		 313 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3585  LysR family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 312 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5752  LysR family transcriptional regulator  52.15 
 
 		 313 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.515576 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5996  LysR family transcriptional regulator  52.15 
 
 		 313 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.48899 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52930  transcriptional regulator  50 
 
 		 314 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01980  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 312 aa  299  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.445097 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1196  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 323 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.191376  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0435  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 323 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.231747  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1142  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 323 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1404  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 323 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1489  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 323 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0157  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 323 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820068  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10730  transcriptional regulator, LysR family  49.35 
 
 		 311 aa  297  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1394  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 430 aa  296  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5327  LysR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 317 aa  296  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0620404 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0008  transcriptional regulator  46.62 
 
 		 431 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636727  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4343  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 327 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1305  LysR family transcriptional regulator  46.01 
 
 		 322 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.565063 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4120  LysR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 323 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5836  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 329 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5024  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 329 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.205227  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5764  LysR family transcriptional regulator  46.01 
 
 		 322 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4426  LysR family transcriptional regulator  46.01 
 
 		 322 aa  291  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4540  LysR family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29008  normal  0.0118827 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3964  LysR family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 322 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0669221  normal  0.168256 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3828  LysR family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 322 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.224143  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1113  LysR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 318 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.293194 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3043  LysR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.696334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6627  LysR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 308 aa  271  9e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.184966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2804  LysR family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2931  LysR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 352 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2278  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3493  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.911238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2435  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 310 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2866  LysR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 310 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.50633 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1894  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 324 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2317  LysR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 315 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4290  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 328 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.376477 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3189  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 328 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4971  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 328 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0570046  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27400  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  38.87 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5702  LysR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 320 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0313513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3413  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0065  transcription regulator protein  38.05 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3684  transcriptional regulator, LysR family  37.71 
 
 		 312 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3361  transcriptional regulator, LysR family  37.71 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>