More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3812 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3812  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  645    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06569  hypothetical protein  46.55 
 
 
311 aa  255  7e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1335  hypothetical protein  41.67 
 
 
302 aa  231  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.83359  hitchhiker  0.000108954 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000693  hypothetical protein  48.74 
 
 
215 aa  192  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00760  hypothetical protein  44.04 
 
 
284 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1221  hypothetical protein  41.52 
 
 
286 aa  186  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1275  hypothetical protein  40.62 
 
 
286 aa  186  4e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.111691  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0408  integral membrane protein  41.48 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00379615  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2143  drug/metabolite exporter family protein  40.89 
 
 
297 aa  169  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000798469  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0385  hypothetical protein  36.24 
 
 
291 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0296  integral membrane domain-containing protein  34.44 
 
 
307 aa  143  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3884  hypothetical protein  35.19 
 
 
306 aa  142  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.288513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0248  hypothetical protein  35.69 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4255  hypothetical protein  33.71 
 
 
295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3688  hypothetical protein  34.44 
 
 
306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0257  hypothetical protein  34.81 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3696  hypothetical protein  34.44 
 
 
307 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4191  hypothetical protein  34.07 
 
 
294 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4073  hypothetical protein  34.07 
 
 
294 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4103  hypothetical protein  33.7 
 
 
294 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3993  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.07 
 
 
294 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0223  hypothetical protein  35.9 
 
 
289 aa  133  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.877306  normal  0.333334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3358  integral membrane domain-containing protein  33.46 
 
 
290 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1083  integral membrane domain-containing protein  30.65 
 
 
290 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.739829  normal  0.417186 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2871  hypothetical protein  30.94 
 
 
283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0538592  hitchhiker  0.00207422 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2769  hypothetical protein  30.4 
 
 
283 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0260023  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2701  hypothetical protein  31.32 
 
 
283 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00447474  hitchhiker  0.0000895819 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1411  hypothetical protein  31.66 
 
 
283 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.325978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1372  hypothetical protein  31.66 
 
 
283 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.601004  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1388  hypothetical protein  31.66 
 
 
283 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2971  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.27 
 
 
283 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.111815 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  31.39 
 
 
281 aa  97.8  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1569  integral membrane domain-containing protein  29.81 
 
 
283 aa  94.7  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  31.09 
 
 
317 aa  89  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  28.22 
 
 
315 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  27.24 
 
 
302 aa  86.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  27.9 
 
 
310 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.46 
 
 
322 aa  82  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  27.52 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  30.57 
 
 
316 aa  79.7  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  29.24 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  26.04 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2540  hypothetical protein  27.78 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 
305 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  29.82 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  27.57 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  27.51 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.91 
 
 
301 aa  75.9  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  27.65 
 
 
318 aa  75.5  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.87 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  32.13 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2509  hypothetical protein  26.52 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.126674  normal  0.276837 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  26.71 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  29.35 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  28.63 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1856  hypothetical protein  27.19 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  28.28 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2502  hypothetical protein  32.16 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  27.91 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.64 
 
 
333 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3305  protein of unknown function DUF6  31.15 
 
 
313 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  27.04 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.7 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0427978  normal  0.17643 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  26.67 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1093  integral membrane protein  27.4 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.536997  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1998  hypothetical protein  31.7 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.746729  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3630  hypothetical protein  27.84 
 
 
309 aa  72.4  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.153402 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.33 
 
 
339 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  27.88 
 
 
279 aa  72.4  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  26.67 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  30.99 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2046  hypothetical protein  31.98 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.782897  normal  0.0300532 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1983  hypothetical protein  31.98 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0578  hypothetical protein  26 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.242573  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  25.27 
 
 
347 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0987  RarD family transporter  30.58 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0666  hypothetical protein  27.66 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0393  hypothetical protein  25.64 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5553  hypothetical protein  25.18 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.84 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4025  hypothetical protein  30.73 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651718  normal  0.814245 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0649  hypothetical protein  27 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  28.07 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1169  hypothetical protein  28.32 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.841455 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  28.21 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  26.62 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0931  hypothetical protein  29.2 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  28.97 
 
 
331 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0364  RarD family protein  25.74 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  27.6 
 
 
293 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3870  hypothetical protein  29.23 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.320842 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  26.91 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2209  hypothetical protein  27.44 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0133362  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2661  hypothetical protein  29.15 
 
 
319 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2232  hypothetical protein  26.07 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  29.1 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  30.77 
 
 
306 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>