More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03029 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 182 aa  370  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  59.76 
 
 		 164 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  56.21 
 
 		 180 aa  197  7.999999999999999e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  57.06 
 
 		 168 aa  192  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  53.05 
 
 		 171 aa  191  7e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  58.02 
 
 		 170 aa  190  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  54.12 
 
 		 176 aa  187  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  54.94 
 
 		 176 aa  186  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  56.17 
 
 		 170 aa  186  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  53.75 
 
 		 170 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  57.24 
 
 		 182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  52.35 
 
 		 170 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  53.94 
 
 		 170 aa  182  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  53.94 
 
 		 170 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  53.33 
 
 		 171 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  53.94 
 
 		 170 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  53.94 
 
 		 170 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  53.66 
 
 		 171 aa  180  9.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  53.66 
 
 		 171 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  52.07 
 
 		 169 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  53.66 
 
 		 171 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  53.66 
 
 		 171 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  53.66 
 
 		 171 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  52.07 
 
 		 169 aa  179  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  51.9 
 
 		 168 aa  178  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  54.66 
 
 		 165 aa  177  5.999999999999999e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  51.48 
 
 		 169 aa  177  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  49.06 
 
 		 169 aa  177  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  53.21 
 
 		 173 aa  174  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  52.29 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  47.9 
 
 		 168 aa  169  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  50.3 
 
 		 163 aa  167  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  46.67 
 
 		 166 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  46.67 
 
 		 166 aa  164  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  46.06 
 
 		 166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  46.06 
 
 		 166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  46.06 
 
 		 166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  56.55 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  53.33 
 
 		 174 aa  160  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  45.57 
 
 		 164 aa  159  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  52.67 
 
 		 174 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  45.57 
 
 		 164 aa  159  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  45.57 
 
 		 164 aa  159  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  45.57 
 
 		 164 aa  159  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  45.57 
 
 		 164 aa  159  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  45.57 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  45.57 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  51.61 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  45.57 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  45.57 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 		 166 aa  159  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  52 
 
 		 173 aa  157  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  47.2 
 
 		 169 aa  157  9e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  51.37 
 
 		 166 aa  153  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  52.05 
 
 		 166 aa  153  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  49.1 
 
 		 169 aa  153  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  49.1 
 
 		 169 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  52.05 
 
 		 172 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  50.68 
 
 		 166 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  50.68 
 
 		 166 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  50.68 
 
 		 166 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  50.68 
 
 		 166 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  50.68 
 
 		 166 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  50.68 
 
 		 166 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  50.68 
 
 		 166 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  48.52 
 
 		 169 aa  150  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  55.3 
 
 		 179 aa  150  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  51.37 
 
 		 172 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  44.67 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  47.13 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  53.24 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  53.24 
 
 		 169 aa  149  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  49.1 
 
 		 173 aa  148  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  44.67 
 
 		 170 aa  149  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  53.24 
 
 		 165 aa  148  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  49.32 
 
 		 178 aa  147  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  44.65 
 
 		 172 aa  147  7e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  49.32 
 
 		 157 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  52.94 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 170 aa  145  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  53.46 
 
 		 168 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  49.32 
 
 		 166 aa  144  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  47.89 
 
 		 154 aa  144  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  44.17 
 
 		 174 aa  143  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  47.33 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  46.99 
 
 		 167 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  50.34 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  47.33 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  51.9 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  47.44 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  47.18 
 
 		 154 aa  142  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  46.36 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  52.2 
 
 		 173 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  45.86 
 
 		 162 aa  140  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  48.06 
 
 		 181 aa  140  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  47.95 
 
 		 166 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>