More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1843 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1843  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 320 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00347923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0771  alpha/beta hydrolase fold protein  84.64 
 
 		 312 aa  475  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  61.38 
 
 		 294 aa  341  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  62.01 
 
 		 294 aa  338  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  60.93 
 
 		 294 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1705  alpha/beta hydrolase fold  61.87 
 
 		 321 aa  315  9e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565807 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 		 278 aa  133  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 		 291 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  32.12 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 		 324 aa  129  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  31.13 
 
 		 335 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  30.33 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 291 aa  109  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 		 301 aa  108  9.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 		 284 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  34.01 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  34.01 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 303 aa  105  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  30.5 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  32.07 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  32.78 
 
 		 288 aa  102  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 		 290 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  27.8 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  31.42 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  24.07 
 
 		 291 aa  99.8  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  24.67 
 
 		 317 aa  99  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 309 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 309 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 309 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  28.21 
 
 		 297 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  28.21 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  28.17 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  28.21 
 
 		 297 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 288 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 302 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.05 
 
 		 341 aa  97.1  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3168  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 		 305 aa  96.3  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 		 348 aa  96.3  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  25.33 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  25.95 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  28.72 
 
 		 298 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  30 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  29.49 
 
 		 283 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 302 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  23.94 
 
 		 289 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  31.63 
 
 		 304 aa  92.8  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 270 aa  93.2  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 296 aa  92.4  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  23.94 
 
 		 289 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 297 aa  91.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 282 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  28.81 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 		 287 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  28.67 
 
 		 312 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 297 aa  90.1  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 299 aa  90.1  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  25 
 
 		 346 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.11 
 
 		 309 aa  89.7  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 287 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  29.37 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  31.05 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 275 aa  87.4  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 		 308 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  29.28 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 306 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 306 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  37.39 
 
 		 311 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>