More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1768 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  100 
 
 		 131 aa  253  8e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2115  putative signal transduction protein with CBS domains  68.64 
 
 		 148 aa  159  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5727  putative signal transduction protein with CBS domains  50 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  42.2 
 
 		 140 aa  88.2  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  43.12 
 
 		 142 aa  86.7  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  41.82 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  40.5 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2870  CBS  37.72 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3744  signal transduction protein  38.14 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  40.37 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  36.36 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  35.51 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  39.32 
 
 		 688 aa  78.2  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  44.44 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  42.05 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  38.89 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  32.56 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  34.19 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  35.59 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  36.45 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5476  putative signal transduction protein with CBS domains  43.14 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  38.46 
 
 		 688 aa  73.9  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  32.23 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  34.58 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2835  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 615 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609535 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  38.46 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  37.23 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  35.14 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1751  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 615 aa  72  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1524  CBS domain-containing protein  37.21 
 
 		 618 aa  72  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  36.8 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  35 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  31.75 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  43.7 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3159  putative signal transduction protein with CBS domains  35.04 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3605  hypothetical protein  39.45 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.103373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  38.3 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3250  signal-transduction protein  35.83 
 
 		 174 aa  70.5  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0271263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2234  putative signal transduction protein with CBS domains  34.78 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1794  CBS  34.48 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.562095 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  30.7 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  30.77 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2797  signal-transduction protein  40.4 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.182223  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  38.3 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  40.91 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  34.23 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  34.23 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  34.23 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  34.23 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  34.23 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  34.23 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  34.23 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  37.36 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  38.71 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  37.36 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2637  signal-transduction protein  35 
 
 		 615 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  31.01 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  29.92 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  31.4 
 
 		 207 aa  67.4  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  32.14 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  35.54 
 
 		 606 aa  67  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00722  Signaling protein with a cAMP-binding, CBS domains and predicted nucleotidyltransferase domain  35.34 
 
 		 613 aa  67  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3292  signal transduction protein  33.04 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2672  signal-transduction protein  35 
 
 		 615 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3565  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  35.54 
 
 		 606 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1712  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35 
 
 		 615 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  hitchhiker  0.00000133647 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  37 
 
 		 331 aa  67  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0964  putative signal transduction protein with CBS domains  40.4 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2357  cyclic nucleotide-binding protein  36 
 
 		 615 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  28.97 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  31.36 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0695  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.17 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0173289  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  38.78 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  34.34 
 
 		 615 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1254  CBS  30.36 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.378403  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2751  CBS domain-containing protein  35 
 
 		 615 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0342062 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  39.8 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  32.5 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  34.51 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2439  CBS domain-containing protein  39.81 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1577  putative signal transduction protein with CBS domains  38.18 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.011912  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  37 
 
 		 286 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  34.07 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0642  putative signal transduction protein with CBS domains  34.48 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.413978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1837  CBS domain-containing protein  29.46 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0592619 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  31.53 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  37.63 
 
 		 688 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1474  signal transduction protein  38.46 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  31.01 
 
 		 615 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  32.98 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  31.4 
 
 		 614 aa  64.3  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  32.43 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2757  CBS domain-containing protein  30.36 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212289  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2616  CBS domain-containing protein  33.93 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>