235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1105 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1105  NLP/P60 protein  100 
 
 		 581 aa  1211    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2976  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  39.81 
 
 		 523 aa  77.4  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0805  cell wall-associated hydrolase  38.02 
 
 		 395 aa  75.9  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0271814  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  38.18 
 
 		 291 aa  73.2  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  33.58 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0643  cell wall-associated hydrolase  33.6 
 
 		 487 aa  67  0.0000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0011775  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2333  NLP/P60 protein  27.92 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  0.0124113 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  31.34 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  30.91 
 
 		 333 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  33.63 
 
 		 318 aa  62.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  33.88 
 
 		 325 aa  62  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1364  NLP/P60 protein  30.95 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  36.44 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  28.08 
 
 		 1048 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1093  hypothetical protein  20.8 
 
 		 527 aa  60.8  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1072  hypothetical protein  20.8 
 
 		 527 aa  60.8  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  31.25 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  32.84 
 
 		 478 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  35.04 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  32.84 
 
 		 479 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2384  NLP/P60 protein  33.04 
 
 		 364 aa  59.3  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473535  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  33.58 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  34.31 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  33.58 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  34.31 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11506  invasion protein  30.5 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0747167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  33.09 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  34.31 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  35.85 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  32.84 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  32.84 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  32.84 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3603  NLP/P60 protein  28.93 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  32.85 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  32.85 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  29.2 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  29.2 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  28.95 
 
 		 333 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1216  NLP/P60 protein  33.05 
 
 		 212 aa  56.6  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000177513  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  31.82 
 
 		 556 aa  56.2  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  28.95 
 
 		 333 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  28.95 
 
 		 333 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2403  NLP/P60 protein  32.56 
 
 		 505 aa  56.2  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0747  NLP/P60 protein  28.57 
 
 		 298 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000792578  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  36.79 
 
 		 256 aa  55.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  28.95 
 
 		 333 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  29.2 
 
 		 333 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  26.72 
 
 		 234 aa  55.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  28.83 
 
 		 333 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  27.68 
 
 		 335 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  28.95 
 
 		 333 aa  55.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  33.02 
 
 		 250 aa  54.7  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  31.3 
 
 		 535 aa  54.7  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  30.39 
 
 		 180 aa  55.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  28.95 
 
 		 333 aa  55.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0303  NLP/P60 protein  25.89 
 
 		 357 aa  55.1  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1652  NLP/P60 protein  29.91 
 
 		 178 aa  54.7  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111398  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 308 aa  54.7  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2077  NLP/P60 protein  28.68 
 
 		 498 aa  54.7  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  38.82 
 
 		 370 aa  54.7  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8103  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  33.04 
 
 		 393 aa  54.7  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  27.19 
 
 		 221 aa  54.3  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1816  NLP/P60 protein  29.91 
 
 		 330 aa  53.9  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00581974  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2022  NLP/P60 protein  30.53 
 
 		 242 aa  53.9  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.321386 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  31.4 
 
 		 340 aa  53.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4554  NLP/P60 protein  32.74 
 
 		 286 aa  53.5  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  31.82 
 
 		 373 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  33.05 
 
 		 210 aa  53.5  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3552  NLP/P60 protein  31.82 
 
 		 297 aa  53.5  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.01109  normal  0.684862 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3731  NLP/P60 protein  36.89 
 
 		 409 aa  53.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000196287  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  26.06 
 
 		 208 aa  52.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4988  NLP/P60 protein  36 
 
 		 448 aa  52.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  32.61 
 
 		 458 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30760  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.58 
 
 		 261 aa  52  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.787895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0124  NLP/P60 family protein  29.66 
 
 		 159 aa  52  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1605  NLP/P60 protein  29.91 
 
 		 279 aa  52  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  25.17 
 
 		 179 aa  51.6  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  29.41 
 
 		 174 aa  52  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0696  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  29.41 
 
 		 300 aa  52.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  32.52 
 
 		 265 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2140  NLP/P60 protein  31.45 
 
 		 427 aa  52  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000576124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  34.12 
 
 		 450 aa  52  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  30.51 
 
 		 270 aa  51.6  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1892  NLP/P60 protein  28.12 
 
 		 319 aa  51.6  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  31.39 
 
 		 302 aa  51.6  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.65 
 
 		 332 aa  51.6  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4472  NLP/P60 protein  32.74 
 
 		 225 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1658  hypothetical protein  29.91 
 
 		 287 aa  51.6  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.110646  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  30.15 
 
 		 177 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  30 
 
 		 177 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5043  endopeptidase lytE  37 
 
 		 436 aa  50.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1956  NLP/P60 protein  31.09 
 
 		 296 aa  51.2  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5427  endopeptidase lytE  37 
 
 		 436 aa  50.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5283  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  37 
 
 		 436 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000121595 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  27.01 
 
 		 476 aa  50.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1987  NLP/P60 protein  32.41 
 
 		 271 aa  50.8  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  31.67 
 
 		 391 aa  50.8  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  30.84 
 
 		 524 aa  50.8  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  27.52 
 
 		 221 aa  50.8  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5314  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  35.64 
 
 		 473 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>