More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2900 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2900  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 131 aa  264  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.276504  normal  0.0712491 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3302  HIT family protein  100 
 
 		 131 aa  264  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4584  histidine triad (HIT) protein  54.26 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000842385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1591  histidine triad (HIT) protein  50.39 
 
 		 129 aa  143  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01700  HIT family protein  49.61 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127711  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1687  HIT family protein  51.56 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3809  histidine triad (HIT) protein  51.15 
 
 		 133 aa  138  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1055  histidine triad (HIT) protein  57.36 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0302  histidine triad (HIT) protein  47.24 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1632  HIT family protein  45.38 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0437202  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0732  hypothetical protein  47.24 
 
 		 132 aa  127  6e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1241  histidine triad (HIT) protein  47.29 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0826  histidine triad (HIT) protein  43.94 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15219  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1815  histidine triad (HIT) protein  43.85 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0400003  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3102  histidine triad (HIT) protein  46.15 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.550311  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4588  histidine triad (HIT) protein  41.54 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4971  histidine triad (HIT) protein  41.54 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4676  histidine triad (HIT) protein  41.54 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0370318  normal  0.851631 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2413  histidine triad (HIT) protein  45.04 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0135198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5173  histidine triad (HIT) protein  42.31 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1583  histidine triad (HIT) protein  39.23 
 
 		 134 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10774  hypothetical protein  38.28 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3629  histidine triad (HIT) protein  39.32 
 
 		 133 aa  97.8  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07820  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  40.35 
 
 		 142 aa  96.7  9e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1701  histidine triad (HIT) protein  39.69 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2368  histidine triad (HIT) protein  40.46 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014225 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2633  histidine triad (HIT) protein  39.69 
 
 		 142 aa  94  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00206121  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1970  histidine triad (HIT) protein  38.58 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.939838  hitchhiker  0.0000383714 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  43.69 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  40.44 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  41.75 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  41.75 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  42 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  39.13 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  33.83 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0788  histidine triad (HIT) protein  37.88 
 
 		 455 aa  77.8  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.864692  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  41.18 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1275  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  41.67 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  34.59 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  33.83 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  39.22 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1076  histidine triad (HIT) protein  38.64 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3451  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2683  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1302  histidine triad (HIT) protein  36.76 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  38.53 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  40.2 
 
 		 133 aa  73.6  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  33.82 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2151  histidine triad (HIT) protein  38.94 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  41 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4709  histidine triad (HIT) protein  36.11 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  36.79 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  32.84 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0952  histidine triad (HIT) protein  41.9 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117681  hitchhiker  0.00115812 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  39.25 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  32.33 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  32.33 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  34.07 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  33.08 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  40.38 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  39.22 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  35.51 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0519  histidine triad nucleotide-binding protein 2 (hint-2)(hint-3)  39.22 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  36.09 
 
 		 142 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3416  histidine triad  37.04 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.621229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3422  histidine triad  37.04 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  36.76 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3351  histidine triad  37.04 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2807  histidine triad (HIT) protein  38.81 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  36.89 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  36.09 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3517  hypothetical protein  37.04 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.810284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1025  histidine triad (HIT) protein  34.62 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0608  histidine triad (HIT) protein  39.22 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  31.82 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  38.76 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1255  HIT family protein  36.54 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  34.33 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  34.33 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3536  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.806394 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  39 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  42.57 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  39.42 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1532  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  0.453293 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  39.42 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  39.42 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  39.42 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1783  histidine triad (HIT) protein  38.1 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.344857  normal  0.911997 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  39.42 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  39.42 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  37.25 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  37.4 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>