More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0252 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0252  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 		 222 aa  431  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00632373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5128  cytochrome oxidase subunit III oxidase polypeptide I  54.59 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0728  cytochrome c oxidase subunit III  52.17 
 
 		 202 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3634  cytochrome c oxidase subunit III  51.32 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.040361  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3957  cytochrome c oxidase subunit III  50.53 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.179765 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2476  cytochrome c oxidase, subunit III  43 
 
 		 235 aa  128  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.314801  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2427  cytochrome c oxidase subunit III  45.2 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3797  cytochrome c oxidase subunit III  44.15 
 
 		 202 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4874  cytochrome c oxidase subunit III  44.15 
 
 		 202 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.108668 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5938  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  44.66 
 
 		 203 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6211  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like protein  45.15 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2266  cytochrome c oxidase subunit III  42.13 
 
 		 237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2343  cytochrome c oxidase subunit III  41.14 
 
 		 202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7360  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  44.12 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3467  cytochrome c oxidase subunit III  32.98 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1566  cytochrome-C oxidase oxidoreductase protein  44.17 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3896  cytochrome c oxidase  37.68 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2360  cytochrome c oxidase subunit III  40.21 
 
 		 233 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2592  cytochrome c oxidase subunit III  40.53 
 
 		 237 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0439  cytochrome c oxidase subunit III  34.74 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0988011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5674  cytochrome c oxidase subunit III  31.98 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.842654 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0520  cytochrome c oxidase subunit III  29.78 
 
 		 187 aa  85.5  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0779441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3993  cytochrome c oxidase subunit III  32.58 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.115102  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2203  cytochrome c oxidase, subunit III  32.57 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000157592  normal  0.966564 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4112  cytochrome c oxidase, subunit III  27.96 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.771178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4943  cytochrome c oxidase, subunit III  26.7 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1677  cytochrome c oxidase subunit III  29.26 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881512  normal  0.222894 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  28.89 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  30.14 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  29.02 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2209  cytochrome c oxidase, subunit III  28.7 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00141599  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3135  Cytochrome-c oxidase  28.16 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1946  cytochrome c oxidase subunit III  28.77 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000125492 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0298  cytochrome c oxidase, subunit III  27.03 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397561 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2692  Cytochrome-c oxidase  29.12 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.48074  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  29 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  30.83 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  27.98 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0431  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.59 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  28.5 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  28.21 
 
 		 202 aa  62  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  32.61 
 
 		 234 aa  62  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  28.12 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2677  Cytochrome-c oxidase  28.72 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  27.36 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15710  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 3  28.05 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4646  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.49 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0847054  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  30 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1022  cytochrome c oxidase subunit III  27.41 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.113935  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3340  Cytochrome-c oxidase  30.43 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3108  Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase subunit 3-like  29.05 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175944  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1506  cytochrome c oxidase, subunit III  25 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.105054  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3534  cytochrome c oxidase, subunit III  29.89 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  29.79 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  30.85 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  26.44 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5384  cytochrome c oxidase, subunit III  29.85 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1296  cytochrome-c oxidase  29.45 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.805813 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1446  cytochrome c oxidase subunit III  27.83 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.190204  normal  0.245723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1373  cytochrome c oxidase subunit III  29.56 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.907318  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1809  cytochrome c oxidase subunit III  30 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3250  cytochrome c oxidase subunit III  26.85 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0735358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  25.64 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3712  cytochrome c oxidase, subunit III  30.53 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.386532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  29.71 
 
 		 231 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3302  cytochrome c oxidase, subunit III  30.6 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.639722  normal  0.219398 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5662  cytochrome c oxidase, subunit III  30.53 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5349  cytochrome c oxidase, subunit III  30.53 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  29.3 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3353  cytochrome c oxidase, subunit III  30.6 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3291  cytochrome c oxidase, subunit III  30.6 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  31.77 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0654  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.32 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  32.37 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2809  cytochrome c oxidase, subunit III  30.53 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1860  transmembrane cytochrome O ubiquinol oxidase (subunit III) oxidoreductase protein  30.5 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.63375  normal  0.148603 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  32.84 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  25.96 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0276  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18856  normal  0.0430335 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  29.07 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1327  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.98 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3575  cytochrome c oxidase subunit III  29.32 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515089  normal  0.0102703 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  30.47 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  26.55 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3557  cytochrome c oxidase, subunit III  27.7 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  29.33 
 
 		 832 aa  55.1  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3860  cytochrome c oxidase, subunit III  28.41 
 
 		 206 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.516047  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  28.03 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4220  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  28.41 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1143  cytochrome c oxidase, subunit III  28.98 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.537108  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4148  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.41 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1142  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  27.93 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0473851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  28.5 
 
 		 743 aa  54.7  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3063  Cytochrome-c oxidase  32.95 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458737  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001555  cytochrome O ubiquinol oxidase subunit III  26.14 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0739  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.67 
 
 		 202 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346867  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  27.97 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3141  cytochrome c oxidase subunit III  27.82 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.785996 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  32.39 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  29.09 
 
 		 294 aa  53.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>