More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1896 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1896  preprotein translocase subunit YidC  100 
 
 
291 aa  596  1e-169  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000421909  hitchhiker  1.20858e-25 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1942  60 kDa inner membrane insertion protein  52.21 
 
 
263 aa  273  4.0000000000000004e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000307817  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2063  preprotein translocase subunit YidC  47.33 
 
 
278 aa  246  3e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.79999  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1862  preprotein translocase subunit YidC  46.25 
 
 
286 aa  236  3e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0130  preprotein translocase subunit YidC  43.3 
 
 
269 aa  224  1e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0409  SpoIIIJ family protein  42.16 
 
 
271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  41.63 
 
 
255 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  42.04 
 
 
255 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  42.04 
 
 
255 aa  206  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  41.63 
 
 
255 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  41.63 
 
 
255 aa  206  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  41.63 
 
 
255 aa  206  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  41.63 
 
 
255 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  41.63 
 
 
255 aa  206  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  41.3 
 
 
258 aa  206  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  41.3 
 
 
255 aa  205  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  40.37 
 
 
252 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  41.22 
 
 
255 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  38.78 
 
 
256 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  41.49 
 
 
249 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3560  OxaA-like protein precursor  41.06 
 
 
254 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5166  OxaA-like protein precursor  38.26 
 
 
260 aa  179  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1789  preprotein translocase subunit YidC  37.83 
 
 
268 aa  176  5e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000505185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0082  OxaA-like protein precursor  39.75 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5176  OxaA-like protein precursor  39.75 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4746  OxaA-like protein precursor  39.34 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5161  OxaA-like protein precursor  39.34 
 
 
260 aa  172  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4889  OxaA-like protein precursor  38.93 
 
 
260 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5263  OxaA-like protein precursor  38.93 
 
 
260 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5131  OxaA-like protein precursor  38.93 
 
 
260 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4731  OxaA-like protein precursor  38.93 
 
 
260 aa  171  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.569831  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3610  OxaA-like protein precursor  39.75 
 
 
257 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4848  OxaA-like protein precursor  38.11 
 
 
260 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2235  60 kDa inner membrane insertion protein  41.1 
 
 
300 aa  152  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.971455  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3965  60 kDa inner membrane insertion protein  36.2 
 
 
330 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255718  normal  0.0997602 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0217  protein translocase subunit yidC  33.88 
 
 
583 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.498573  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  38.17 
 
 
223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2521  protein translocase subunit yidC  37.85 
 
 
225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0677656  hitchhiker  0.0000441825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1427  60 kDa inner membrane insertion protein  36.44 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.739034  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08476  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.32 
 
 
622 aa  129  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.47 
 
 
531 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.88 
 
 
530 aa  129  6e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.88 
 
 
530 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.16 
 
 
526 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  35.61 
 
 
532 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0881  60 kDa inner membrane insertion protein  36.9 
 
 
514 aa  127  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0524  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.43 
 
 
536 aa  127  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.7 
 
 
532 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.36 
 
 
575 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  34.45 
 
 
607 aa  126  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.65 
 
 
528 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  32.86 
 
 
543 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0976  60 kDa inner membrane insertion protein  38.54 
 
 
515 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000560326  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.15 
 
 
517 aa  124  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.85 
 
 
553 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.82 
 
 
518 aa  124  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.88 
 
 
548 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.88 
 
 
548 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  33.88 
 
 
548 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  33.88 
 
 
548 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.62 
 
 
567 aa  123  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.88 
 
 
548 aa  124  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.88 
 
 
548 aa  124  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.88 
 
 
548 aa  124  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.88 
 
 
548 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.45 
 
 
541 aa  123  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  33.88 
 
 
548 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.37 
 
 
557 aa  123  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  33 
 
 
557 aa  123  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.43 
 
 
554 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.43 
 
 
554 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2671  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.89 
 
 
238 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.372035  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.82 
 
 
548 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.37 
 
 
581 aa  122  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.82 
 
 
548 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.82 
 
 
548 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.82 
 
 
548 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2224  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.42 
 
 
565 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.176857  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.75 
 
 
560 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2994  putative inner membrane protein translocase component YidC  39.89 
 
 
238 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0429051  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2314  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.6 
 
 
565 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  33.86 
 
 
344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000325406  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  33.73 
 
 
628 aa  120  3e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.15 
 
 
555 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  30.25 
 
 
545 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1967  YidC translocase/secretase  32.14 
 
 
548 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.537012  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.24 
 
 
548 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.84 
 
 
546 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.84 
 
 
546 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  34.55 
 
 
539 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.84 
 
 
546 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  32.59 
 
 
229 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.32 
 
 
548 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 
555 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4358  protein translocase subunit yidC  36.63 
 
 
545 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  34.97 
 
 
547 aa  119  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.48 
 
 
541 aa  119  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  34.85 
 
 
219 aa  119  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1196  60 kDa inner membrane insertion protein  30.96 
 
 
313 aa  119  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000975332  decreased coverage  0.000283466 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4495  60 kDa inner membrane insertion protein  37.37 
 
 
546 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>