More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1976 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1991  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.01 
 
 
593 aa  636    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1976  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 
602 aa  1249    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.33 
 
 
728 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.66 
 
 
705 aa  598  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  48.49 
 
 
705 aa  595  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  48.49 
 
 
705 aa  595  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.49 
 
 
705 aa  597  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.66 
 
 
705 aa  597  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.83 
 
 
706 aa  595  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.32 
 
 
705 aa  595  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.32 
 
 
705 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.32 
 
 
705 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.32 
 
 
705 aa  595  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.32 
 
 
705 aa  593  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.39 
 
 
707 aa  579  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.9 
 
 
592 aa  556  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.59 
 
 
594 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.79 
 
 
724 aa  527  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.62 
 
 
721 aa  527  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  43.51 
 
 
597 aa  511  1e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.27 
 
 
617 aa  502  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.27 
 
 
599 aa  488  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.89 
 
 
611 aa  479  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.9 
 
 
620 aa  482  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.44 
 
 
626 aa  476  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.81 
 
 
611 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41 
 
 
596 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.61 
 
 
614 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3998  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.21 
 
 
597 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0373347  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0218  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.21 
 
 
610 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0555  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.21 
 
 
610 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.18 
 
 
608 aa  463  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.35 
 
 
608 aa  465  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.71 
 
 
625 aa  464  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.68 
 
 
611 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.68 
 
 
611 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.93 
 
 
609 aa  459  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.32 
 
 
607 aa  459  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.68 
 
 
611 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.695622 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  40.68 
 
 
611 aa  458  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.17 
 
 
592 aa  456  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.68 
 
 
609 aa  457  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.68 
 
 
609 aa  458  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.68 
 
 
609 aa  458  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  40.68 
 
 
609 aa  458  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.4 
 
 
599 aa  458  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.28 
 
 
602 aa  456  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.37 
 
 
615 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.74 
 
 
607 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.29 
 
 
601 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.51 
 
 
609 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.37 
 
 
615 aa  455  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.37 
 
 
615 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.2 
 
 
615 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.37 
 
 
615 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.57 
 
 
607 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.84 
 
 
607 aa  451  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.34 
 
 
601 aa  449  1e-125  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40 
 
 
593 aa  452  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40 
 
 
593 aa  452  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.57 
 
 
607 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.57 
 
 
607 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.94 
 
 
717 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.57 
 
 
607 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.97 
 
 
607 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1644  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.73 
 
 
709 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.87 
 
 
608 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.68 
 
 
610 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.71 
 
 
615 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.17 
 
 
712 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.9 
 
 
711 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.87 
 
 
603 aa  444  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.24 
 
 
715 aa  445  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.4 
 
 
607 aa  444  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  39.73 
 
 
709 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1604  ATP-dependent DNA helicase  41.34 
 
 
601 aa  445  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.39 
 
 
709 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.17 
 
 
599 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.54 
 
 
707 aa  445  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.9 
 
 
613 aa  444  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.07 
 
 
607 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.97 
 
 
714 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824216  hitchhiker  0.00000305051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4022  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.73 
 
 
715 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0251984 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.78 
 
 
710 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.28 
 
 
602 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.07 
 
 
607 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.07 
 
 
714 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.73 
 
 
607 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4516  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.57 
 
 
715 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121492  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.8 
 
 
715 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1066  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.05 
 
 
681 aa  436  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.859317  hitchhiker  0.0000965484 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0911  superfamily II DNA helicase  39.94 
 
 
621 aa  435  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.37 
 
 
617 aa  438  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1711  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.63 
 
 
624 aa  438  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.66 
 
 
607 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1868  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.64 
 
 
719 aa  434  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1489  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.83 
 
 
603 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0818763 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.4 
 
 
731 aa  435  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.08 
 
 
674 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2808  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.13 
 
 
705 aa  430  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>