More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3856 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3856  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 313 aa  589  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  0.0542249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  45.39 
 
 		 333 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  43.54 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  42 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  40.86 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  44.78 
 
 		 308 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  46.56 
 
 		 287 aa  176  6e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  47.43 
 
 		 294 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  40.27 
 
 		 316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  42.63 
 
 		 309 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  41.94 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 300 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  34.9 
 
 		 312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  40.73 
 
 		 311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 296 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 		 301 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  38.87 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  38.04 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  38.23 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0129  transcriptional regulator, LysR family  43.35 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00685914  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  40.86 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2340  transcriptional regulator, LysR family  36.91 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  0.887111 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  37.95 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 		 304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  36.54 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  41.99 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  32.12 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  39.77 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  38.41 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  38.08 
 
 		 308 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  37.84 
 
 		 308 aa  142  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  36.4 
 
 		 301 aa  142  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3713  LysR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0563526  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 305 aa  136  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  38.05 
 
 		 319 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  38.94 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 304 aa  135  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  33.94 
 
 		 303 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  40.13 
 
 		 309 aa  135  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8854  LysR family transcriptional regulator  49.73 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  34.33 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 295 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  33.44 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  35.65 
 
 		 331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  36.95 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6871  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 283 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  36.03 
 
 		 303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 311 aa  125  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0208  transcriptional regulator, LysR family  34.56 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  37.4 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  35 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3401  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185395  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  35.39 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  37.75 
 
 		 295 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  34.4 
 
 		 309 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 327 aa  122  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  35.57 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  28.43 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  35.32 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  36.07 
 
 		 288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 292 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4824  transcriptional regulator, LysR family  34.42 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00015803  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  34.17 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  38.74 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  34.77 
 
 		 296 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0450  LysR substrate-binding protein  35.17 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  34.78 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  34.27 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  37.55 
 
 		 294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4270  transcriptional regulator, LysR family  34.45 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0190021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0838  LysR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 304 aa  112  9e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00258172  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1193  transcriptional regulator, LysR family  39.78 
 
 		 347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3091  transcriptional regulator, LysR family  36.4 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.339744  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3424  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  38.04 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34330  transcriptional regulator  35.27 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1027  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 305 aa  109  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2421  LysR substrate-binding  25.61 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  35.07 
 
 		 304 aa  109  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1897  transcriptional regulator, LysR family  35.79 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0474391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>