More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1011 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1011  glutamine amidotransferase  100 
 
 		 260 aa  509  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1800  glutamine amidotransferase  63.07 
 
 		 242 aa  308  8e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.132369  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3327  glutamine amidotransferase  62.14 
 
 		 250 aa  299  3e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3824  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  58.26 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.14887  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2609  glutamine amidotransferase class-I  58.73 
 
 		 264 aa  278  5e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1270  glutamine amidotransferase  54.73 
 
 		 243 aa  275  5e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17353  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1315  glutamine amidotransferase  57.26 
 
 		 243 aa  261  6.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000170552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0014  glutamine amidotransferase  56.15 
 
 		 244 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2980  glutamine amidotransferase  52.5 
 
 		 260 aa  251  7e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0885879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14740  glutamine amidotransferase  52.7 
 
 		 242 aa  248  9e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.216669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4570  glutamine amidotransferase  55.14 
 
 		 243 aa  240  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30350  glutamine amidotransferase  51.43 
 
 		 245 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3263  glutamine amidotransferase  50.21 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1289  glutamine amidotransferase  45.68 
 
 		 246 aa  215  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0579596  normal  0.253406 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03160  glutamine amidotransferase  54.11 
 
 		 264 aa  215  5.9999999999999996e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1856  glutamine amidotransferase  44.86 
 
 		 243 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.991157  decreased coverage  0.0021836 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2155  glutamine amidotransferase  40.97 
 
 		 243 aa  105  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1509  glutamine amidotransferase class-I  36.89 
 
 		 241 aa  97.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  32.35 
 
 		 247 aa  92.8  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4466  glutamine amidotransferase class-I  35.38 
 
 		 241 aa  92.4  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  36.11 
 
 		 247 aa  89.7  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0865  glutamine amidotransferase class-I  30.34 
 
 		 246 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0038327  hitchhiker  0.0000262286 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3672  glutamine amidotransferase class-I  39.47 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0325  glutamine amidotransferase class-I  40.97 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0817  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing]  31.18 
 
 		 228 aa  87.8  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1063  glutamine amidotransferase class-I  34.15 
 
 		 232 aa  87  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1179  glutamine amidotransferase, class I  30.65 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1214  glutamine amidotransferase class-I  35.33 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1607  glutamine amidotransferase class-I  46.79 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.471476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0948  glutamine amidotransferase  36.02 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  34.64 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5138  GMP synthase - Glutamine amidotransferase domain- like protein  36.69 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.127338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4317  glutamine amidotransferase class-I  29.27 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1637  glutamine amidotransferase class-I  35.78 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.419704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2521  glutamine amidotransferase  38.46 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00189035  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2584  glutamine amidotransferase class-I  29.8 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2875  glutamine amidotransferase class-I  33.11 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.511003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07470  GMP synthase family protein  34.67 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  43.81 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1742  glutamine amidotransferase  32.5 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  41.1 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1424  glutamine amidotransferase  37.4 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16280  GMP synthase family protein  39.04 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.311796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2563  glutamine amidotransferase  36.55 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.703088  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0875  glutamine amidotransferase, class I  31.12 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327652  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2745  glutamine amidotransferase  33.52 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.562281  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1523  glutamine amidotransferase  35.21 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3619  glutamine amidotransferase class-I  44 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1819  glutamine amidotransferase class-I  40 
 
 		 222 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1670  glutamine amidotransferase  32 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03836  glutamine amidotransferase  34.69 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  41.27 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2986  glutamine amidotransferase class-I  30.61 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000292655  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3581  glutamine amidotransferase class-I  36.36 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2916  glutamine amidotransferase class-I  33.33 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3985  glutamine amidotransferase  36.05 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.759173 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3152  glutamine amidotransferase class-I  32.77 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000980969  hitchhiker  0.000546532 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1906  glutamine amidotransferase class-I  27.18 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  31.19 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  40.95 
 
 		 520 aa  72  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2532  glutamine amidotransferase class-I  35.1 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1887  glutamine amidotransferase class-I  29.3 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2917  glutamine amidotransferase class-I domain protein  35.1 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0936  glutamine amidotransferase, class I  35.53 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228928  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  31.37 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3397  glutamine amidotransferase class-I  36.81 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1260  glutamine amidotransferase class-I  29.63 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0557  glutamine amidotransferase class-I  30.57 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1861  GMP synthase  31.93 
 
 		 515 aa  68.9  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3619  glutamine amidotransferase-like protein  30.72 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0942  GMP synthase, large subunit  37 
 
 		 535 aa  68.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00705801  normal  0.0196156 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3336  glutamine amidotransferase class-I  32.5 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0839  glutamine amidotransferase  32.44 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2606  glutamine amidotransferase class-I  28.77 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.672568  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5032  glutamine amidotransferase class-I  33.55 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4275  glutamine amidotransferase class-I  32.92 
 
 		 308 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01005  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  30.14 
 
 		 509 aa  65.5  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4908  glutamine amidotransferase  30.63 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0589  GMP synthase  32.65 
 
 		 506 aa  63.9  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0213  glutamine amidotransferase  30.91 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.486178 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4097  glutamine amidotransferase class-I  34.75 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.593636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3343  glutamine amidotransferase  34.82 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  22.97 
 
 		 507 aa  64.7  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  33.33 
 
 		 513 aa  63.5  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10270  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  40 
 
 		 530 aa  63.9  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.38684 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19190  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.24 
 
 		 536 aa  63.2  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0538351 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  27.68 
 
 		 529 aa  63.2  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0065  glutamine amidotransferase  29.41 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0718  glutamine amidotransferase class-I  33.9 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7211  putative glutamine amidotransferase, class-I  30.98 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2377  GMP synthase  27.84 
 
 		 509 aa  62  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  27.66 
 
 		 511 aa  62.4  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2798  glutamine amidotransferase class-I  31.53 
 
 		 236 aa  62  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2919  glutamine amidotransferase  34.23 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.973635  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02180  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  27.23 
 
 		 544 aa  62  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2617  glutamine amidotransferase class-I  33.81 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0408  GMP synthase  27.4 
 
 		 525 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000376888  decreased coverage  0.00000308048 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1623  glutamine amidotransferase  34.23 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.153893  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4083  glutamine amidotransferase  34.23 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2978  glutamine amidotransferase  34.23 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>