249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1268 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1268  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 293 aa  580  1.0000000000000001e-165  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19900  condensin subunit ScpA  55.1 
 
 		 342 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5063  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.36 
 
 		 354 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0369754  normal  0.0383606 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3122  chromosome segregation and condensation protein ScpA  49.28 
 
 		 293 aa  216  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129768  hitchhiker  0.00203337 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1562  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.15 
 
 		 298 aa  212  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.94 
 
 		 338 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2832  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.06 
 
 		 312 aa  209  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0391082  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1204  condensin subunit ScpA  50.61 
 
 		 274 aa  208  9e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1917  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.5 
 
 		 342 aa  206  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.536791  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1491  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.76 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.400172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1930  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.08 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.441348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  49.21 
 
 		 359 aa  203  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25350  condensin subunit ScpA  46.46 
 
 		 289 aa  199  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1532  condensin subunit ScpA  50.61 
 
 		 296 aa  200  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0065622  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2495  condensin subunit ScpA  47.35 
 
 		 309 aa  199  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1452  condensin subunit ScpA  48.58 
 
 		 314 aa  198  7.999999999999999e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2994  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.04 
 
 		 283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1532  chromosome segregation and condensation protein ScpA  49.39 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000075545 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15210  hypothetical protein  48.22 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0264564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  44.73 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2155  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.9 
 
 		 303 aa  193  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2991  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.72 
 
 		 268 aa  192  5e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0974  chromosome segregation and condensation protein ScpA  44.24 
 
 		 291 aa  192  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2946  condensin subunit ScpA  46.34 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0970123  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.32 
 
 		 275 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.219886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2931  condensin subunit ScpA  46.34 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2975  condensin subunit ScpA  46.34 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11724  hypothetical protein  43.57 
 
 		 278 aa  189  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.295485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2819  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.74 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.67 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0991582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4056  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.67 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2373  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.67 
 
 		 295 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1238  condensin subunit ScpA  43.9 
 
 		 275 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3278  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.6 
 
 		 274 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0238  hypothetical protein  36.82 
 
 		 304 aa  159  7e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  27.97 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0721  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.13 
 
 		 304 aa  99.4  7e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00886352  normal  0.0253766 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.07 
 
 		 240 aa  97.1  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  25.4 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  28.14 
 
 		 247 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  28.14 
 
 		 247 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  28.14 
 
 		 247 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  26.82 
 
 		 248 aa  92.4  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  28.14 
 
 		 247 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  28.14 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  28.14 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  28.14 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  26.82 
 
 		 247 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  26.82 
 
 		 247 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.05 
 
 		 243 aa  90.5  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  27.41 
 
 		 247 aa  89  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.62 
 
 		 285 aa  89  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.24 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  30.04 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07170  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.6 
 
 		 243 aa  87.8  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000172776  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.29 
 
 		 245 aa  87.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  26.62 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.07 
 
 		 287 aa  86.3  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.14 
 
 		 261 aa  85.9  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1303  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.77 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2584  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.84 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000515385  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.46 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  27.31 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0097  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.31 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0377485  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  27.31 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0093  putative segregation and condensation protein A  26.01 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.92 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.96 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  26.83 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1464  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.83 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.86 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376675  decreased coverage  0.00403881 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1256  condensin subunit ScpA  30.58 
 
 		 274 aa  79  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.62 
 
 		 236 aa  79  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  28.8 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.25 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.875947  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2190  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.41 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  29.39 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1954  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.81 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  27.89 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.27 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  26.34 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1688  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.53 
 
 		 272 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.176972  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0821  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.25 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.51 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1883  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.34 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0105417  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  25.77 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.4 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1398  segregation and condensation protein A  26.74 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.331498  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  25.29 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  24.52 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.16 
 
 		 238 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  25.51 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4345  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.27 
 
 		 254 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.331059 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0645  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.16 
 
 		 287 aa  72.4  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  26.92 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1569  condensin subunit ScpA  24.6 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.729802  normal  0.82385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  27.42 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1751  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.88 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.133467  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1004  condensin subunit ScpA  27.56 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>