209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2045 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2045  mevalonate kinase  100 
 
 
330 aa  642    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.558295  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2604  mevalonate kinase  77.74 
 
 
327 aa  494  1e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.395275  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0439  mevalonate kinase  76.38 
 
 
328 aa  467  9.999999999999999e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.289557  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2541  mevalonate kinase  76.62 
 
 
328 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1829  mevalonate kinase  73.37 
 
 
338 aa  451  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.516533  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  38.21 
 
 
301 aa  172  9e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0476  mevalonate kinase  38.46 
 
 
321 aa  171  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2395  mevalonate kinase  39.26 
 
 
303 aa  166  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000672574  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0681  mevalonate kinase  38.02 
 
 
290 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0966  mevalonate kinase  37.58 
 
 
336 aa  155  9e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.104962  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2376  mevalonate kinase  36.25 
 
 
289 aa  150  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2213  mevalonate kinase  37.57 
 
 
289 aa  149  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  36.94 
 
 
322 aa  146  6e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  31.12 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1812  mevalonate kinase  35.84 
 
 
289 aa  123  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1602  mevalonate kinase  31.88 
 
 
316 aa  122  8e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0123084  normal  0.126865 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  33.77 
 
 
314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1358  mevalonate kinase  29.02 
 
 
314 aa  119  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1323  mevalonate kinase  32.07 
 
 
309 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.516434  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4315  mevalonate kinase  34 
 
 
313 aa  116  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1835  mevalonate kinase  34.95 
 
 
310 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.782527 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  35.03 
 
 
315 aa  114  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  28.09 
 
 
313 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  28.09 
 
 
313 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1653  mevalonate kinase  33.12 
 
 
314 aa  106  7e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2002  mevalonate kinase  36.58 
 
 
356 aa  105  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.360358  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0258  mevalonate kinase  28.72 
 
 
317 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0646  mevalonate kinase  28.01 
 
 
319 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.199793  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1338  mevalonate kinase  29.08 
 
 
317 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0580  mevalonate kinase  29.09 
 
 
317 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.761954  normal  0.0461716 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1100  mevalonate kinase  30.16 
 
 
306 aa  99  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.979552  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03869  mevalonate kinase (AFU_orthologue; AFUA_4G07780)  29.35 
 
 
735 aa  97.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.105428  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2890  mevalonate kinase  40.85 
 
 
289 aa  96.7  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00676748  normal  0.719721 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40742  mevalonate kinase  27.73 
 
 
432 aa  96.7  5e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0150941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  33.33 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0915  mevalonate kinase  28.57 
 
 
316 aa  87.4  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00806632  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  28.41 
 
 
361 aa  87  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0454  mevalonate kinase  27.63 
 
 
310 aa  86.3  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01740  cystathionine beta-lyase, putative  29.27 
 
 
900 aa  84.7  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1385  mevalonate kinase  29.97 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0775  mevalonate kinase  28.48 
 
 
356 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0913  phosphomevalonate kinase  26.86 
 
 
375 aa  83.2  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000929735  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0722  putative phopshomevalonate kinase  26.41 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000190894  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1733  GHMP kinase  22.81 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  29.14 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2135  mevalonate kinase  31.61 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0621  mevalonate kinase  26.11 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.132017  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53929  mevalonate kinase  28.35 
 
 
490 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.323174  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  30.17 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1033  mevalonate kinase  25.93 
 
 
322 aa  77.4  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  30.84 
 
 
369 aa  77  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2461  mevalonate kinase  33.12 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  28.19 
 
 
383 aa  76.6  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  24.64 
 
 
385 aa  75.5  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  25.41 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1000  GHMP kinase domain protein  26.46 
 
 
370 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00600942  normal  0.518194 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1326  mevalonate kinase, putative  28.81 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0418302  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  25.3 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  29.57 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  29.45 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  28.61 
 
 
403 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  26.43 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  27.95 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  26.75 
 
 
389 aa  73.2  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1124  mevalonate kinase  25.42 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  25.98 
 
 
386 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  26.61 
 
 
398 aa  72.8  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  26.76 
 
 
382 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  26.51 
 
 
386 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  26.76 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  26.01 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  30.86 
 
 
382 aa  70.5  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  26.47 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0598  mevalonate kinase  28.28 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  28.99 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  26.47 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0465  GHMP kinase  27.27 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0240407  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  26.47 
 
 
382 aa  69.7  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  26.36 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  29.55 
 
 
400 aa  69.7  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  26.57 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  26.57 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  26.57 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  27.03 
 
 
405 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  26.57 
 
 
382 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  28.02 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  28.02 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  22.19 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  26.57 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0776  galactokinase  28.86 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  26.1 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  28.02 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  27.3 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  25.96 
 
 
404 aa  67  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  24.86 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0613  mevalonate kinase  27.93 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0628  mevalonate kinase  27.93 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  26.27 
 
 
382 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  25.65 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  26.43 
 
 
385 aa  66.2  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>