263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4689 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013745  Htur_4689  L-lactate permease  100 
 
 		 578 aa  1122    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0208  L-lactate permease  50.69 
 
 		 590 aa  519  1e-146  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.454514 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4690  L-lactate permease  41.8 
 
 		 564 aa  435  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2686  L-lactate transport  41.89 
 
 		 564 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001224  L-lactate permease  41.43 
 
 		 563 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.57325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3634  L-lactate transport  42.26 
 
 		 564 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1039  L-lactate transport  44.25 
 
 		 568 aa  409  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.302493  normal  0.540207 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1422  L-lactate transport  41.73 
 
 		 568 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0255  putative L-lactate permease  42.7 
 
 		 582 aa  405  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0363  L-lactate transport  42.33 
 
 		 563 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05091  L-lactate permease Psort location  41.83 
 
 		 620 aa  398  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2205  L-lactate transport  40.66 
 
 		 553 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1588  L-lactate transport  41.52 
 
 		 575 aa  395  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0198  L-lactate permease  42.96 
 
 		 566 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1076  L-lactate permease  40.67 
 
 		 567 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304031  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2067  L-lactate transport  41.35 
 
 		 574 aa  395  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.554646  hitchhiker  0.00175436 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2927  L-lactate transport  40.81 
 
 		 588 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166776  normal  0.708084 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3238  L-lactate transport  41.86 
 
 		 570 aa  388  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265406  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2279  L-lactate transport  40.62 
 
 		 611 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1045  L-lactate transport  41.51 
 
 		 570 aa  385  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0725199  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0347  L-lactate transport  42.56 
 
 		 570 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.054106  normal  0.809759 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1888  L-lactate transport  40.51 
 
 		 585 aa  379  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0784  L-lactate transport  42.1 
 
 		 570 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.939606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33840  L-lactate transport  43.06 
 
 		 592 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1861  L-lactate permease  41.01 
 
 		 569 aa  375  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2169  L-lactate transport  41.49 
 
 		 562 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3390  L-lactate transport  38.9 
 
 		 601 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.736321  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1714  L-lactate permease  41.73 
 
 		 566 aa  372  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1653  glycolate/L-lactate:H+ symporter  39.42 
 
 		 585 aa  366  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.112262 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1681  L-lactate transport  40.43 
 
 		 585 aa  365  1e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000226861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3174  L-lactate transport  40.35 
 
 		 586 aa  360  3e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0322  L-lactate transport  40.64 
 
 		 610 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0964076 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3391  L-lactate permease  37.03 
 
 		 623 aa  343  4e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0907  L-lactate permease  34.04 
 
 		 547 aa  312  9e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.425278  decreased coverage  0.000000225287 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0331  L-lactate permease  35.88 
 
 		 563 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2994  L-lactate permease  33.04 
 
 		 547 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.576445  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2734  L-lactate permease  33.45 
 
 		 548 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.718337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2807  L-lactate permease  33.45 
 
 		 548 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2793  L-lactate permease  33.33 
 
 		 550 aa  295  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.956098  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3135  L-lactate permease  32.22 
 
 		 547 aa  293  6e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.770152  normal  0.436399 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2439  L-lactate permease, putative  32.98 
 
 		 547 aa  293  7e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.947271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3007  L-lactate permease  32.63 
 
 		 547 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0831108  hitchhiker  0.000000523615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1340  L-lactate permease  32.63 
 
 		 547 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210524  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1377  L-lactate permease  32.63 
 
 		 547 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0525284  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1354  L-lactate permease  32.63 
 
 		 547 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00178054  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1522  L-lactate permease, putative  33.39 
 
 		 547 aa  289  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1272  L-lactate permease  33.22 
 
 		 547 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0565099  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2669  L-lactate permease  33.39 
 
 		 570 aa  286  9e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2904  L-lactate permease  32.34 
 
 		 547 aa  278  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0676147  normal  0.129872 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2574  L-lactate permease  32.81 
 
 		 557 aa  269  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.231573  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2865  Elongator protein 3/MiaB/NifB  34.79 
 
 		 538 aa  254  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.689167  normal  0.783414 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1396  L-lactate permease  30.5 
 
 		 511 aa  209  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0575  L-lactate transport  28.48 
 
 		 534 aa  201  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0708  L-lactate permease  29.83 
 
 		 559 aa  192  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000370423  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3854  L-lactate transport  27.98 
 
 		 526 aa  187  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0261983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3327  hypothetical protein  32.04 
 
 		 446 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00856  putative L-lactate permease, LctP  28.32 
 
 		 544 aa  170  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1837  L-lactate permease  27.79 
 
 		 530 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0373  L-lactate permease  31.57 
 
 		 504 aa  162  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.561383  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6084  L-lactate transporter  26.42 
 
 		 570 aa  158  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592385  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2170  L-lactate transport  27.37 
 
 		 545 aa  154  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.882764  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1728  L-lactate transporter  26.85 
 
 		 586 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0696  L-lactate transport  25.49 
 
 		 556 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.91775  hitchhiker  0.00000653044 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4723  L-lactate transport  27.01 
 
 		 553 aa  152  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3472  L-lactate transport  27.85 
 
 		 552 aa  152  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0353521  normal  0.697356 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1121  L-lactate transport  28.23 
 
 		 545 aa  151  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4736  L-lactate transport  25.09 
 
 		 556 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5295  L-lactate transport  25.85 
 
 		 552 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0827  L-lactate permease  24.42 
 
 		 545 aa  147  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2994  L-lactate permease  31.08 
 
 		 548 aa  147  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.528271  normal  0.115704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4601  L-lactate transport  24.91 
 
 		 556 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0523719  normal  0.0421821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4735  L-lactate transport  24.91 
 
 		 556 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168353  hitchhiker  0.00377155 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5445  L-lactate permease  25.98 
 
 		 569 aa  146  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654018  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1438  L-lactate transport  27.09 
 
 		 556 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1750  L-lactate transport  25.04 
 
 		 516 aa  145  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0680792  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3412  L-lactate transport  26.82 
 
 		 553 aa  144  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190436  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4067  L-lactate transport  26.82 
 
 		 553 aa  144  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0561  L-lactate transport  28.04 
 
 		 560 aa  144  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.044221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5796  L-lactate transport  27.03 
 
 		 553 aa  144  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.325715 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0106  L-lactate transport  27.34 
 
 		 543 aa  144  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4131  L-lactate transport  27.11 
 
 		 554 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.868822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3408  L-lactate transport  25.59 
 
 		 552 aa  143  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.432982  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2428  L-lactate transport  27.49 
 
 		 584 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.21162 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2303  L-lactate transport  24.9 
 
 		 592 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.922577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2974  L-lactate transporter  26.72 
 
 		 558 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.838258  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0564  L-lactate transport  27.49 
 
 		 575 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.374965  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0072  L-lactate permease  25.3 
 
 		 565 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0753  L-lactate permease  26.22 
 
 		 564 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226744 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4016  L-lactate permease  24.28 
 
 		 551 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3893  L-lactate permease  24.21 
 
 		 551 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0113  L-lactate permease  25 
 
 		 560 aa  140  7e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.610577  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3344  L-lactate permease  26.56 
 
 		 560 aa  140  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542026  normal  0.656646 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4078  L-lactate permease  24.11 
 
 		 551 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2301  L-lactate transport  25.7 
 
 		 561 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.422272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43070  L-lactate permease  25.83 
 
 		 562 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.357177  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3971  L-lactate permease  24.11 
 
 		 551 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737729 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2129  L-lactate transport  26.2 
 
 		 551 aa  139  2e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2515  L-lactate transport  26.78 
 
 		 558 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.419445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2897  L-lactate transport  26.22 
 
 		 576 aa  138  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3172  L-lactate transport  26.97 
 
 		 557 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>