More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_07800 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  47.07 
 
 		 1447 aa  1279    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1439  DNA polymerase III, alpha subunit  61.99 
 
 		 1210 aa  1084    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.476857  normal  0.05643 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0831  DNA polymerase III PolC  49.4 
 
 		 1436 aa  1246    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0685824  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1397 aa  2873    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3859  DNA polymerase III, alpha subunit  43.6 
 
 		 970 aa  728    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  44.38 
 
 		 1468 aa  1129    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  46.92 
 
 		 1443 aa  1163    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2619  DNA polymerase III, alpha subunit  49.16 
 
 		 1527 aa  1250    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.768829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3669  DNA polymerase III PolC  49 
 
 		 1433 aa  1297    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0360  DNA polymerase III PolC  50.56 
 
 		 1367 aa  1233    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3559  DNA polymerase III PolC  49.19 
 
 		 1433 aa  1297    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl288  DNA polymerase III alpha subunit  43.35 
 
 		 1493 aa  990    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1806  DNA polymerase III, alpha subunit  56.62 
 
 		 1402 aa  1404    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3577  DNA polymerase III PolC  49 
 
 		 1433 aa  1297    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1324  DNA polymerase III PolC  50.16 
 
 		 1438 aa  1246    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0332  DNA polymerase III, alpha subunit  47.18 
 
 		 1465 aa  1109    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1039  DNA polymerase III PolC  48.55 
 
 		 1362 aa  1113    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1721  DNA polymerase III PolC  50.54 
 
 		 1390 aa  1134    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.670328  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1483  DNA polymerase III PolC  46.31 
 
 		 1388 aa  1151    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3955  DNA polymerase III PolC  49 
 
 		 1433 aa  1297    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0154434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3865  DNA polymerase III PolC  49.08 
 
 		 1433 aa  1298    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00985865  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1350  DNA polymerase III PolC  50.16 
 
 		 1438 aa  1246    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  52.83 
 
 		 1426 aa  1474    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0339  DNA polymerase III, alpha subunit  43.68 
 
 		 1479 aa  1039    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1045  DNA polymerase III, alpha subunit  62.76 
 
 		 1214 aa  1087    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186954  unclonable  0.0000000541415 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1328  DNA polymerase III PolC  48.93 
 
 		 1433 aa  1297    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0462488  hitchhiker  0.0000648048 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0420  DNA polymerase III PolC  39.22 
 
 		 1442 aa  858    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0342  DNA polymerase III PolC  50.6 
 
 		 1367 aa  1234    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3830  DNA polymerase III PolC  49 
 
 		 1433 aa  1297    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.80742e-56 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2470  DNA polymerase III PolC  49.48 
 
 		 1433 aa  1304    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  51.85 
 
 		 1421 aa  1243    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  56.43 
 
 		 1449 aa  1445    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  56.59 
 
 		 1449 aa  1449    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1808  DNA-directed DNA polymerase  42.69 
 
 		 989 aa  642    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0349481  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1150  DNA polymerase III PolC  53.33 
 
 		 1435 aa  1355    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0319687  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0895  DNA-directed DNA polymerase  55.62 
 
 		 1212 aa  1004    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.210067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3916  DNA polymerase III PolC  49.11 
 
 		 1433 aa  1298    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111889  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  45.88 
 
 		 1635 aa  1153    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0983  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  44.83 
 
 		 1437 aa  1053    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0809  DNA polymerase III, alpha subunit ( type)  48.76 
 
 		 1432 aa  1163    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164061 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0689  DNA polymerase III catalytic subunit, PolC type  42.11 
 
 		 1437 aa  1091    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  46.35 
 
 		 1464 aa  1136    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3640  DNA polymerase III PolC  49.41 
 
 		 1433 aa  1304    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  58.33 
 
 		 1407 aa  1508    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  53.27 
 
 		 1433 aa  1480    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  50.88 
 
 		 1444 aa  1363    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0598  DNA polymerase III, alpha subunit  47.07 
 
 		 1365 aa  1127    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  51.56 
 
 		 1440 aa  1392    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  39.64 
 
 		 1438 aa  851    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  52.8 
 
 		 1442 aa  1467    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3856  DNA polymerase III, alpha subunit  58.81 
 
 		 483 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2507  DNA polymerase III, alpha subunit  24.61 
 
 		 1157 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00161108  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1391  DNA polymerase III, alpha subunit  24.11 
 
 		 1127 aa  176  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3092  DNA polymerase III, alpha subunit  23.98 
 
 		 1156 aa  174  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00110918  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0434  DNA polymerase III, alpha subunit  23.9 
 
 		 1139 aa  173  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  24.84 
 
 		 1075 aa  173  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0675  DNA polymerase III, alpha subunit  24.18 
 
 		 1148 aa  171  7e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  43 
 
 		 584 aa  171  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1169  DNA polymerase III, alpha subunit  23.23 
 
 		 1155 aa  169  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0036  DNA polymerase III, alpha subunit  22.83 
 
 		 1240 aa  167  9e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1265  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  23.84 
 
 		 1170 aa  167  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0809  DNA polymerase III DnaE  24.12 
 
 		 1145 aa  167  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000123157  decreased coverage  0.00151258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.86 
 
 		 595 aa  165  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0549  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  25 
 
 		 1134 aa  165  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2068  DNA polymerase III, alpha subunit  23.96 
 
 		 1184 aa  165  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1050  DNA polymerase III, alpha subunit  24.95 
 
 		 1153 aa  165  5.0000000000000005e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000216104  hitchhiker  0.00986832 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1222  DNA polymerase III, alpha subunit  23.1 
 
 		 1156 aa  163  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1464  DNA polymerase III, alpha subunit  23.46 
 
 		 1170 aa  163  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0650  hypothetical protein  23.06 
 
 		 1148 aa  162  4e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.394104 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2196  DNA polymerase III, alpha subunit  23.39 
 
 		 1165 aa  161  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2319  DNA polymerase III DnaE  23.02 
 
 		 1225 aa  160  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.511943  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1265  DNA polymerase III, alpha subunit  23.05 
 
 		 1176 aa  159  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  46.93 
 
 		 574 aa  157  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1192  DNA polymerase III DnaE  23.48 
 
 		 1145 aa  158  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2410  DNA polymerase III, alpha subunit  23.62 
 
 		 1190 aa  157  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00080646  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.76 
 
 		 584 aa  157  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2747  DNA polymerase III, alpha subunit  22.91 
 
 		 1159 aa  157  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.782351 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1096  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  23.68 
 
 		 1165 aa  155  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.35277  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1215  DNA polymerase III, alpha subunit  23.84 
 
 		 1155 aa  155  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000331804  hitchhiker  0.00000568126 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2723  DNA polymerase III, alpha subunit  22.36 
 
 		 1179 aa  154  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03140  DNA polymerase III catalytic subunit, DnaE type  23.45 
 
 		 1122 aa  153  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.677635  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.5 
 
 		 605 aa  153  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3300  hypothetical protein  44.81 
 
 		 630 aa  152  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906388  normal  0.18719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  45.4 
 
 		 578 aa  152  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1264  DNA polymerase III DnaE  22.36 
 
 		 1181 aa  152  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.756254  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  44.74 
 
 		 574 aa  151  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4709  DNA polymerase III, alpha subunit  22.72 
 
 		 1214 aa  151  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204837  normal  0.0609725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  39.9 
 
 		 584 aa  151  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  42.6 
 
 		 616 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1438  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.5 
 
 		 205 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  45.81 
 
 		 590 aa  150  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3606  DNA polymerase III, alpha subunit  22.51 
 
 		 1178 aa  150  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.402124  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  44.57 
 
 		 617 aa  150  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3289  hypothetical protein  44.26 
 
 		 630 aa  150  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3351  hypothetical protein  44.26 
 
 		 630 aa  150  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.477195  normal  0.0699162 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1401  DNA polymerase III, alpha subunit  22.69 
 
 		 1155 aa  149  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.67909  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.81 
 
 		 595 aa  148  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1225  DNA polymerase III, alpha subunit  22.57 
 
 		 1164 aa  147  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.344496  normal  0.610841 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.79 
 
 		 609 aa  148  9e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  39.09 
 
 		 566 aa  147  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.277294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>