More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3548 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03043  protease, ATP-dependent zinc-metallo  60.18 
 
 		 644 aa  654    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000537455  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0529  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.18 
 
 		 647 aa  655    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000027152  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1787  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.99 
 
 		 656 aa  719    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.124146 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2522  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.43 
 
 		 635 aa  734    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000162887  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2383  FtsH peptidase  61.42 
 
 		 639 aa  674    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  58.53 
 
 		 614 aa  748    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4718  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.69 
 
 		 637 aa  649    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518421  normal  0.0121069 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  52.15 
 
 		 651 aa  659    Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000721667  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1848  cell division protein FtsH  55.23 
 
 		 638 aa  661    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.35 
 
 		 657 aa  664    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000853792  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  52.32 
 
 		 658 aa  664    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.81 
 
 		 634 aa  782    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3452  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.66 
 
 		 660 aa  653    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.380893  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  59.71 
 
 		 644 aa  655    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1197  cell division protein FtsH  58.76 
 
 		 649 aa  666    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4497  cell division protein FtsH  62.64 
 
 		 634 aa  645    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.554573  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.26 
 
 		 645 aa  659    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.35 
 
 		 657 aa  664    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000787677  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.91 
 
 		 640 aa  673    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  60.18 
 
 		 644 aa  654    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000177959  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2842  cell division protease ftsH  52.77 
 
 		 639 aa  637    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2711  cell division protease ftsH  52.77 
 
 		 639 aa  637    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4187  peptidase M41, FtsH  62.81 
 
 		 634 aa  646    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000128423  normal  0.66671 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3615  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.27 
 
 		 640 aa  653    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0280177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0944  FtsH peptidase  65.23 
 
 		 626 aa  689    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.129158  normal  0.715931 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  61.27 
 
 		 644 aa  659    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3044  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.27 
 
 		 646 aa  686    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000897526  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.89 
 
 		 634 aa  678    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1133  membrane protease FtsH catalytic subunit  53.65 
 
 		 630 aa  636    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0177636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2710  peptidase M41, FtsH  60.04 
 
 		 640 aa  670    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  60.18 
 
 		 647 aa  655    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  60.48 
 
 		 647 aa  655    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000069949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2569  peptidase M41, FtsH  52.37 
 
 		 641 aa  658    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000845189  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0772  membrane protease FtsH catalytic subunit  61.21 
 
 		 635 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000087079  normal  0.0618887 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.14 
 
 		 641 aa  659    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0997  ATP-dependent zinc protease/ cell division protein  66.48 
 
 		 616 aa  726    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000353226  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0211  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.47 
 
 		 655 aa  664    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.6 
 
 		 626 aa  638    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.765362 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5471  cell division protein FtsH  54.82 
 
 		 642 aa  651    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  60.66 
 
 		 644 aa  656    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000683259  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  58.77 
 
 		 608 aa  758    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2611  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.36 
 
 		 642 aa  665    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1513  FtsH peptidase  57.27 
 
 		 665 aa  739    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000097295  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.4 
 
 		 657 aa  663    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.63 
 
 		 651 aa  652    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1268  membrane protease FtsH catalytic subunit  61.39 
 
 		 640 aa  673    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399956  normal  0.37717 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3246  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.35 
 
 		 657 aa  664    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000231825  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0483  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.42 
 
 		 631 aa  680    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000161272  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1098  membrane protease FtsH catalytic subunit  54.26 
 
 		 640 aa  682    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.13074  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  59.96 
 
 		 652 aa  637    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.1 
 
 		 657 aa  652    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000520805  hitchhiker  0.00000681699 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1495  FtsH peptidase  63.86 
 
 		 635 aa  790    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0168  ATP-dependent metallopeptidase HflB  58.74 
 
 		 764 aa  652    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000170494  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1818  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.34 
 
 		 638 aa  665    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.4 
 
 		 650 aa  640    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000774852  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.61 
 
 		 636 aa  645    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.97 
 
 		 640 aa  668    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.86 
 
 		 640 aa  661    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2011  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.14 
 
 		 639 aa  671    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.34 
 
 		 617 aa  734    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000099937  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4743  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.07 
 
 		 638 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  51.9 
 
 		 631 aa  669    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2852  membrane protease FtsH catalytic subunit  60.67 
 
 		 640 aa  674    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.1 
 
 		 640 aa  659    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1000  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.41 
 
 		 656 aa  661    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000544697  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4141  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.3 
 
 		 638 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  60 
 
 		 647 aa  652    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000114537  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.71 
 
 		 638 aa  665    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  60.18 
 
 		 647 aa  655    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000879508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  53.95 
 
 		 659 aa  654    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000536506  decreased coverage  0.000042164 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.74 
 
 		 627 aa  637    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0064  FtsH peptidase  54.63 
 
 		 637 aa  697    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  60.66 
 
 		 647 aa  657    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000470783  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.1 
 
 		 642 aa  665    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.1 
 
 		 642 aa  660    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4719  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.69 
 
 		 634 aa  650    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  59.36 
 
 		 638 aa  650    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  63.21 
 
 		 643 aa  649    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000499281  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3167  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.01 
 
 		 645 aa  669    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347357  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2834  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.8 
 
 		 655 aa  657    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000517945  normal  0.0155634 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.82 
 
 		 615 aa  636    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  53.29 
 
 		 612 aa  655    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2617  FtsH peptidase  59.81 
 
 		 641 aa  672    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258853  normal  0.61812 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1019  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.76 
 
 		 657 aa  663    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000780208  hitchhiker  0.000608132 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1084  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.93 
 
 		 657 aa  665    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000445375  normal  0.0888545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1975  FtsH peptidase  53.52 
 
 		 639 aa  659    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.182239  hitchhiker  0.00765382 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0983  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.01 
 
 		 657 aa  668    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000296667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  59.53 
 
 		 649 aa  652    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  60.18 
 
 		 647 aa  655    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000724409  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62860  cell division protein FtsH  55.08 
 
 		 639 aa  650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.95 
 
 		 647 aa  665    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0714  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.88 
 
 		 634 aa  649    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.87442  normal  0.0617842 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0551  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.43 
 
 		 652 aa  732    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.4 
 
 		 673 aa  711    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.76 
 
 		 657 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.12 
 
 		 640 aa  662    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2252  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.28 
 
 		 621 aa  738    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000390574  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.03 
 
 		 641 aa  646    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4584  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.69 
 
 		 634 aa  649    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  61.74 
 
 		 650 aa  659    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>