More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2706 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 389 aa  784    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  47.34 
 
 		 350 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  47.34 
 
 		 350 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  46.13 
 
 		 350 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  48.02 
 
 		 351 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  41.76 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  35.75 
 
 		 342 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  34.36 
 
 		 329 aa  219  5e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  36.98 
 
 		 316 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  37.31 
 
 		 362 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 		 362 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  32.94 
 
 		 311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  38.71 
 
 		 313 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  36.66 
 
 		 362 aa  213  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  34.5 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  33.91 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  40.47 
 
 		 310 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  34.99 
 
 		 359 aa  202  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  36.42 
 
 		 300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  35.35 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  36.12 
 
 		 408 aa  196  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  31.32 
 
 		 358 aa  195  9e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  33.14 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  37.06 
 
 		 337 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  34.73 
 
 		 321 aa  193  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  37.06 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  37.06 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  33.43 
 
 		 329 aa  190  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  35.2 
 
 		 288 aa  189  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  33.92 
 
 		 405 aa  189  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  35.8 
 
 		 316 aa  183  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  33.54 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  33.13 
 
 		 426 aa  180  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  31.23 
 
 		 318 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  33.64 
 
 		 399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  33.7 
 
 		 384 aa  173  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  32.45 
 
 		 382 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  32.45 
 
 		 382 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  35.13 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 382 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 		 382 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  33.56 
 
 		 384 aa  157  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  28.5 
 
 		 444 aa  156  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  31.8 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  33.95 
 
 		 391 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  35.02 
 
 		 211 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  32.18 
 
 		 370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  32.57 
 
 		 367 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  32.1 
 
 		 354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  51.43 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  31.35 
 
 		 330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  38.86 
 
 		 330 aa  112  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2026  cytochrome c oxidase, subunit II  33.8 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905775 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  29.36 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  32.56 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  48.11 
 
 		 274 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  35.78 
 
 		 272 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  48.04 
 
 		 336 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  29.89 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  42.28 
 
 		 244 aa  109  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  29.96 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1471  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  26.95 
 
 		 401 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  31.17 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  32.6 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  48.57 
 
 		 321 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  43.81 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  39.1 
 
 		 272 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  33.77 
 
 		 326 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  28.68 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  36.11 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  44.14 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  38.46 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0362  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2) transmembrane protein  24.52 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3379  cytochrome c oxidase, subunit II  32.35 
 
 		 318 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  27.79 
 
 		 311 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  29.82 
 
 		 334 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0407  cytochrome c oxidase, subunit II  26.95 
 
 		 435 aa  104  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  28.74 
 
 		 273 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  33.02 
 
 		 243 aa  103  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  32.2 
 
 		 322 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0515  cytochrome c class I  41.59 
 
 		 176 aa  103  7e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3660  cytochrome c oxidase subunit II  34.9 
 
 		 308 aa  103  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  43.64 
 
 		 355 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  39.68 
 
 		 339 aa  102  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  29.58 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  48.04 
 
 		 291 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  23.24 
 
 		 528 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  30.4 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  28.32 
 
 		 387 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  25.74 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1237  cytochrome c oxidase, subunit II  27.27 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109976 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  41.82 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  36.67 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2183  putative cytochrome c oxidase polypeptide II precursor  35.14 
 
 		 338 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  33.48 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  27.67 
 
 		 389 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  47.32 
 
 		 232 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  43.3 
 
 		 360 aa  100  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  30.6 
 
 		 334 aa  100  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>