194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1972 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1972  protein of unknown function DUF461  100 
 
 
147 aa  300  4.0000000000000003e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1566  hypothetical protein  41.61 
 
 
162 aa  104  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1067  hypothetical protein  40 
 
 
213 aa  104  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263125  normal  0.430464 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0797  hypothetical protein  38.93 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.435603  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1037  hypothetical protein  33.09 
 
 
146 aa  84.3  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.394202 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0097  hypothetical protein  36.51 
 
 
150 aa  83.6  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2883  protein of unknown function DUF461  34.19 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.284917 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1033  hypothetical protein  31.62 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.426906  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1578  hypothetical protein  35.25 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.828878  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001589  copper metallochaperone  34.4 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00860885  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1583  hypothetical protein  36.36 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3566  hypothetical protein  35.92 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000659278  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1750  hypothetical protein  31.86 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3432  hypothetical protein  33.57 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0144838 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4267  hypothetical protein  33.63 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828499  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1239  hypothetical protein  34.51 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.647444 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05561  hypothetical protein  34.4 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2150  hypothetical protein  32.74 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113189  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0676  hypothetical protein  33.63 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.575507  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1131  hypothetical protein  33.63 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.391283  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1155  hypothetical protein  33.63 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0856  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0563  hypothetical protein  31.58 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04841  hypothetical protein  39.13 
 
 
155 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2446  hypothetical protein  31.58 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2835  hypothetical protein  31.58 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.538436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2759  hypothetical protein  31.58 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2818  hypothetical protein  31.58 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.097425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1769  hypothetical protein  31.58 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1458  protein of unknown function DUF461  32.56 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2874  hypothetical protein  32.41 
 
 
429 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0987  hypothetical protein  34.56 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4408  hypothetical protein  35.17 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108164 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0905  hypothetical protein  33.33 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000768649  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0923  TerC protein  32.81 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0872  phosphomannomutase  33.07 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3335  hypothetical protein  32.09 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0452404  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0917  hypothetical protein  35.94 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000487122  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3424  protein of unknown function DUF461  36.54 
 
 
190 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.119907 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3383  hypothetical protein  30 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1814  hypothetical protein  32.52 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219792  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4984  hypothetical protein  30 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407405  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0693  hypothetical protein  32.23 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616261  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2684  hypothetical protein  37.4 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1136  conserved hypothetical protein (DUF461 domain protein)  29.69 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5303  hypothetical protein  30 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0691155 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1952  hypothetical protein  32 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11730  hypothetical protein  36.72 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.259328  normal  0.299727 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4927  hypothetical protein  31.71 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.955255  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2986  protein of unknown function DUF461  37.84 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00293351  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25020  DUF461 family hypothetical protein  29.14 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3332  hypothetical protein  36.57 
 
 
150 aa  72  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0868  hypothetical protein  36.11 
 
 
144 aa  72  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.13745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0963  hypothetical protein  38.1 
 
 
204 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0417724 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1170  protein of unknown function DUF461  34.75 
 
 
193 aa  70.9  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.292974 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2687  hypothetical protein  32.65 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04891  hypothetical protein  33.61 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00197754  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0691  hypothetical protein  34.45 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  33.91 
 
 
342 aa  70.1  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1192  hypothetical protein  32.17 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0736084  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3482  hypothetical protein  35.24 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3421  hypothetical protein  34.78 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0722  hypothetical protein  30.43 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000048039  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0679  hypothetical protein  33.06 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0702  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0803  protein of unknown function DUF461  29.5 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000315548  hitchhiker  0.000000000835288 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1171  protein of unknown function DUF461  36 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3707  hypothetical protein  29.91 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  31.97 
 
 
334 aa  67.8  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2017  hypothetical protein  37.07 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2895  hypothetical protein  32.89 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645793  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0728  hypothetical protein  37.07 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.342188 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  31.97 
 
 
351 aa  67.8  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4755  hypothetical protein  25.37 
 
 
147 aa  66.6  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2207  hypothetical protein  35.59 
 
 
158 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3479  hypothetical protein  33.59 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.49381  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3239  hypothetical protein  30.43 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00124495  hitchhiker  0.00000947918 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0765  hypothetical protein  29.71 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000429985  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2380  hypothetical protein  29.79 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.179232  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2866  hypothetical protein  37.86 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0750  hypothetical protein  30.43 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  normal  0.044131 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3907  hypothetical protein  29.2 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0810  hypothetical protein  28.78 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00181969  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0778  hypothetical protein  28.78 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000798625  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3199  protein of unknown function DUF461  30.71 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1897  hypothetical protein  29.17 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3581  hypothetical protein  28.78 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000271819  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4714  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4836  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.743142  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4198  hypothetical protein  30.14 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00896972  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4537  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4628  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102521 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2688  hypothetical protein  30.08 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0504943  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0541  hypothetical protein  28.47 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0312213  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3315  hypothetical protein  28.37 
 
 
160 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.186593 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2850  hypothetical protein  29.08 
 
 
162 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000551875  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3079  hypothetical protein  33.87 
 
 
185 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3428  hypothetical protein  33.01 
 
 
187 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0308042  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4892  hypothetical protein  32.5 
 
 
161 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.489085  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0771  hypothetical protein  30.46 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000551146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2594  hypothetical protein  32.17 
 
 
175 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.557794 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>