93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1627 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1627  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 135 aa  273  8e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1907  putative DNA-binding repressor transcription regulator protein  39.85 
 
 		 173 aa  87.4  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2310  XRE family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 130 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000103087  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3316  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0996495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2619  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000698613  hitchhiker  0.000000000219561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2585  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00026111  hitchhiker  0.00000611184 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01337  phage-related protei  36.29 
 
 		 143 aa  70.1  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.317958  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4866  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 179 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894538  normal  0.194277 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2710  XRE family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2626  transcriptional regulator, XRE family  38.28 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0239529  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0797  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000538753  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0314  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000214612  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  46.03 
 
 		 227 aa  57.4  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3025  DNA-binding protein, putative  39.76 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2265  hypothetical protein  36 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0405  hypothetical protein  37.04 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000114125  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3673  XRE family transcriptional regulator  37 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151534  hitchhiker  0.000000782403 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2905  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0131008  normal  0.248064 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4178  helix-turn-helix domain-containing protein  34.41 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.886419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4829  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.584136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3337  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.98805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0766  Cro/CI family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.047378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1608  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2276  XRE family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 214 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3376  XRE family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4100  Cro/CI family transcriptional regulator  36 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.394089  normal  0.0554933 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 229 aa  51.2  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3047  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  44.26 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0185896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1764  helix-turn-helix domain-containing protein  36 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226226 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  45.31 
 
 		 296 aa  50.8  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0177  putative DNA-binding repressor transcription regulator protein  34.12 
 
 		 149 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3181  transcriptional regulator, putative  42.62 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.387057  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 268 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  44.44 
 
 		 149 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  42.37 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  36.07 
 
 		 196 aa  47  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  47.17 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  47.17 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  47.17 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  23.89 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  47.17 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  29.07 
 
 		 252 aa  45.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1268  repressor protein, putative  44.68 
 
 		 230 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.019488  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4463  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3742  XRE family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0294477  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 205 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 231 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0219  putative phage repressor  30.38 
 
 		 235 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.449525  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0978  XRE family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0552  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.162215  hitchhiker  0.0000852105 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0860  XRE family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0845  helix-turn-helix domain-containing protein  35.9 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000284644  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  37.31 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2271  transcriptional regulator, XRE family  26.19 
 
 		 141 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.571583 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  32.86 
 
 		 229 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0753  DNA-binding protein  34.38 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.389457  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 380 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  32.86 
 
 		 229 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0597  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 75 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5367  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.216549 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  32.79 
 
 		 194 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3770  transcriptional regulator, XRE family  55 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0813  DNA-binding protein  32.81 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.371509  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6072  putative transcriptional regulator Cro/CI family  42.65 
 
 		 233 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  44.74 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3707  molybdate metabolism transcriptional regulator  32.32 
 
 		 374 aa  40.8  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.487138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  35.42 
 
 		 263 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  30.43 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000978101  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  31.15 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  34.33 
 
 		 209 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0596  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.128395  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0652  DNA-binding protein  34.38 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0741  DNA-binding protein  32.81 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153081 
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  44.74 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0752  XRE family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.273056  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2347  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 304 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4619  DNA-binding protein  34.38 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.985933  normal  0.0107743 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0996  helix-turn-helix domain-containing protein  38 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0600  XRE family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>