42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4866 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4866  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  367  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894538  normal  0.194277 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1907  putative DNA-binding repressor transcription regulator protein  43.79 
 
 		 173 aa  117  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4178  helix-turn-helix domain-containing protein  41.38 
 
 		 130 aa  92  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.886419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3337  XRE family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 123 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.98805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4829  XRE family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 123 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.584136  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0314  XRE family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 116 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000214612  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0797  XRE family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 116 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000538753  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0766  Cro/CI family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 106 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.047378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01337  phage-related protei  36.42 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.317958  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3025  DNA-binding protein, putative  50.56 
 
 		 120 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2310  XRE family transcriptional regulator  50.62 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000103087  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2710  XRE family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3673  XRE family transcriptional regulator  43 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151534  hitchhiker  0.000000782403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3376  XRE family transcriptional regulator  43 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4100  Cro/CI family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.394089  normal  0.0554933 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  53.03 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2619  XRE family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000698613  hitchhiker  0.000000000219561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1764  helix-turn-helix domain-containing protein  41 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2585  XRE family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00026111  hitchhiker  0.00000611184 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2276  XRE family transcriptional regulator  48 
 
 		 214 aa  67.8  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220665 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1627  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 135 aa  67.4  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0177  putative DNA-binding repressor transcription regulator protein  40.91 
 
 		 149 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3316  XRE family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0996495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2265  hypothetical protein  33.1 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2898  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  51.14 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.294834 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4463  XRE family transcriptional regulator  59.02 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2905  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0131008  normal  0.248064 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3047  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  51.56 
 
 		 149 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0185896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3181  transcriptional regulator, putative  50 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.387057  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2626  transcriptional regulator, XRE family  41.11 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0239529  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1608  XRE family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 185 aa  51.6  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0405  hypothetical protein  33.68 
 
 		 118 aa  45.1  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000114125  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  41.94 
 
 		 230 aa  44.7  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  28.57 
 
 		 113 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 117 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  40 
 
 		 238 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3411  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 183 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3742  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 130 aa  42  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0294477  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1700  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 156 aa  41.6  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2085  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 207 aa  40.8  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>