39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01337 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01337  phage-related protei  100 
 
 		 143 aa  294  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.317958  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4866  XRE family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894538  normal  0.194277 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1627  transcriptional regulator, XRE family  36.29 
 
 		 135 aa  70.1  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00124147  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2310  XRE family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000103087  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2710  XRE family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1907  putative DNA-binding repressor transcription regulator protein  31.76 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0629084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1764  helix-turn-helix domain-containing protein  39.18 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226226 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4100  Cro/CI family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.394089  normal  0.0554933 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0314  XRE family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000214612  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4178  helix-turn-helix domain-containing protein  39.56 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.886419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0797  XRE family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 116 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000538753  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4829  XRE family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.584136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3337  XRE family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.98805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3673  XRE family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151534  hitchhiker  0.000000782403 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3025  DNA-binding protein, putative  36.56 
 
 		 120 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  46.15 
 
 		 227 aa  57  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3376  XRE family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2585  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00026111  hitchhiker  0.00000611184 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2619  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000698613  hitchhiker  0.000000000219561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2276  XRE family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 214 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220665 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3316  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0996495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0405  hypothetical protein  34.74 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000114125  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0766  Cro/CI family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 106 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.047378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2905  XRE family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0131008  normal  0.248064 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0177  putative DNA-binding repressor transcription regulator protein  38.27 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1700  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1608  XRE family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2265  hypothetical protein  32 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3047  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.68 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0185896 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  36.71 
 
 		 240 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  36.71 
 
 		 240 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01531  hypothetical protein  30.84 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0356913  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01539  prophage CP-9330 DicA-like protein  30.84 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0413815  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4463  XRE family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0524  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.138157  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_489  DNA-binding protein  45.1 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.140066  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2252  transcriptional repressor DicA  32.98 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000218001  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3742  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 130 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0294477  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0548  DNA-binding protein  45.1 
 
 		 67 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>