More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0662 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0662  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 
350 aa  695    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.953358 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  65.53 
 
 
360 aa  457  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  66.29 
 
 
350 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  53.93 
 
 
356 aa  338  5.9999999999999996e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  52.38 
 
 
356 aa  331  1e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  41.69 
 
 
356 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0263  dihydroorotate dehydrogenase  41.48 
 
 
355 aa  280  3e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.519047  normal  0.910873 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  44.74 
 
 
339 aa  278  7e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  43.57 
 
 
349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.14 
 
 
348 aa  272  5.000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.37 
 
 
361 aa  273  5.000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.23 
 
 
344 aa  271  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.13 
 
 
363 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3837  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.22 
 
 
356 aa  266  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000541635 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.15 
 
 
344 aa  266  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1876  dihydroorotate dehydrogenase  39.06 
 
 
363 aa  265  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.821309  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1222  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.97 
 
 
376 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.53 
 
 
361 aa  260  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.02 
 
 
367 aa  259  4e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2007  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.03 
 
 
378 aa  259  4e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.69 
 
 
352 aa  258  7e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0895  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.85 
 
 
352 aa  257  2e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.934158  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  43.82 
 
 
367 aa  257  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0825  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.85 
 
 
352 aa  257  2e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.454847  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.69 
 
 
364 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  44.35 
 
 
374 aa  256  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1206  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.85 
 
 
352 aa  256  6e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.235362  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  41.18 
 
 
360 aa  255  9e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2490  dihydroorotate oxidase  41.41 
 
 
352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243938  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12169  dihydroorotate dehydrogenase 2  42 
 
 
357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.385563 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2362  dihydroorotate dehydrogenase 2  36.9 
 
 
377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.38 
 
 
364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.89 
 
 
356 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.51 
 
 
358 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.13 
 
 
364 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.3 
 
 
364 aa  252  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.86 
 
 
364 aa  252  7e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.92 
 
 
358 aa  252  7e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.92 
 
 
358 aa  252  7e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  42.5 
 
 
348 aa  252  8.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2860  dihydroorotate oxidase  42.82 
 
 
361 aa  251  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.69 
 
 
362 aa  250  2e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  41.03 
 
 
384 aa  249  4e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1294  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.69 
 
 
364 aa  249  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0509  dihydroorotate dehydrogenase  43.53 
 
 
370 aa  248  9e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.3 
 
 
343 aa  248  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.63 
 
 
364 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.26 
 
 
377 aa  248  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2353  dihydroorotate dehydrogenase  38.07 
 
 
377 aa  247  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7230  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.94 
 
 
340 aa  246  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.11 
 
 
351 aa  246  4e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  42.34 
 
 
357 aa  246  4e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5791  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.27 
 
 
342 aa  246  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.78 
 
 
364 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.66 
 
 
358 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.87 
 
 
357 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2143  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.83 
 
 
351 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1056  dihydroorotate dehydrogenase  36.72 
 
 
355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.02 
 
 
364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3039  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.86 
 
 
353 aa  243  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  42.32 
 
 
361 aa  243  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.37 
 
 
354 aa  243  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.49 
 
 
364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.08 
 
 
352 aa  243  5e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1870  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.96 
 
 
377 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.37 
 
 
349 aa  242  7.999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2144  dihydroorotate dehydrogenase 2  33.8 
 
 
354 aa  241  1e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  42 
 
 
362 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0934  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.06 
 
 
344 aa  241  1e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.33 
 
 
352 aa  241  1e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.86 
 
 
351 aa  240  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.72 
 
 
356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.72 
 
 
356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0627  dihydroorotate dehydrogenase  39.73 
 
 
364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.72 
 
 
356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.19 
 
 
364 aa  239  5.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1896  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.65 
 
 
377 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.71 
 
 
363 aa  238  9e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  44.59 
 
 
361 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3487  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.86 
 
 
353 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.054966  normal  0.648107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.52 
 
 
362 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.54 
 
 
356 aa  236  3e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0825  Dihydroorotate oxidase  36.14 
 
 
375 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.53 
 
 
336 aa  236  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.57 
 
 
359 aa  236  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0628  dihydroorotate dehydrogenase 2  34.93 
 
 
352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.75 
 
 
355 aa  236  6e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  38.71 
 
 
336 aa  235  7e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  39.82 
 
 
336 aa  235  8e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25100  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.09 
 
 
354 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.503416  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1850  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.64 
 
 
338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1911  Dihydroorotate oxidase  41.55 
 
 
363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.55 
 
 
348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2264  dihydroorotate dehydrogenase  41.55 
 
 
363 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02171  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.61 
 
 
389 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  38.78 
 
 
377 aa  233  3e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0786  dihydroorotate dehydrogenase 2  37.46 
 
 
352 aa  233  3e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  38.1 
 
 
335 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.88 
 
 
343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1140  dihydroorotate dehydrogenase 2  35.13 
 
 
357 aa  232  6e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.336473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>