More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2696 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 606 aa  1144    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.39 
 
 		 634 aa  613  9.999999999999999e-175  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.27 
 
 		 663 aa  610  1e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.12 
 
 		 565 aa  530  1e-149  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54 
 
 		 597 aa  509  1e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 		 564 aa  254  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  37.5 
 
 		 547 aa  204  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.93 
 
 		 572 aa  192  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.37 
 
 		 569 aa  190  8e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04170  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  35.7 
 
 		 592 aa  183  9.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0420701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.26 
 
 		 544 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 		 540 aa  172  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.84 
 
 		 515 aa  169  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.7 
 
 		 547 aa  166  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19470  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  34.85 
 
 		 576 aa  166  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.71 
 
 		 572 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.6 
 
 		 510 aa  162  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04590  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  34.32 
 
 		 551 aa  162  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 		 564 aa  158  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 		 550 aa  156  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 		 532 aa  155  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 		 509 aa  154  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553789  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  27.11 
 
 		 560 aa  146  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.82 
 
 		 576 aa  146  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.1 
 
 		 543 aa  141  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.98 
 
 		 547 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 		 518 aa  135  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.453337 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.37 
 
 		 551 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.83 
 
 		 528 aa  134  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.402791 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.76 
 
 		 545 aa  134  6e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.59 
 
 		 742 aa  133  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 		 601 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0744847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.46 
 
 		 743 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.97 
 
 		 758 aa  128  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.8 
 
 		 545 aa  127  5e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.93 
 
 		 561 aa  126  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  26.36 
 
 		 530 aa  125  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.59 
 
 		 740 aa  125  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.04 
 
 		 597 aa  124  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  25.29 
 
 		 516 aa  122  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.98 
 
 		 575 aa  121  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.74 
 
 		 512 aa  120  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000649932  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  25.32 
 
 		 700 aa  120  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2817  thiamine transporter membrane protein  36.41 
 
 		 523 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229213  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 		 565 aa  117  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.9 
 
 		 563 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.57 
 
 		 579 aa  116  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.53 
 
 		 728 aa  116  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.38 
 
 		 741 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.42 
 
 		 692 aa  115  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.52 
 
 		 587 aa  115  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.432532 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  24.9 
 
 		 516 aa  115  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0350  thiamine transporter membrane protein  25.66 
 
 		 540 aa  114  5e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  29.66 
 
 		 587 aa  114  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.25 
 
 		 569 aa  114  7.000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  26.48 
 
 		 741 aa  113  8.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  24.09 
 
 		 685 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.57 
 
 		 692 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.62 
 
 		 692 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  26.38 
 
 		 741 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.6 
 
 		 615 aa  111  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.242541 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  25.9 
 
 		 535 aa  109  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.45 
 
 		 544 aa  109  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2069  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.22 
 
 		 551 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.11 
 
 		 692 aa  107  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  29.45 
 
 		 543 aa  107  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  26.89 
 
 		 536 aa  107  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4361  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.52 
 
 		 590 aa  107  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1397  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.78 
 
 		 275 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4019  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.7 
 
 		 275 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.392742  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0059  thiamine transporter membrane protein  26.25 
 
 		 536 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.35 
 
 		 563 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  26.5 
 
 		 536 aa  105  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0059  thiamine transporter membrane protein  40.22 
 
 		 504 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0329  thiamine transporter membrane protein  29.7 
 
 		 521 aa  104  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356206 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.19 
 
 		 669 aa  104  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1035  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  27.83 
 
 		 589 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.86 
 
 		 579 aa  104  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  26.98 
 
 		 535 aa  104  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1329  sulfate ABC transporter, permease protein, putative  29.52 
 
 		 288 aa  104  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0287943  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 		 275 aa  103  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  25.1 
 
 		 535 aa  103  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  26.04 
 
 		 536 aa  104  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1289  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.52 
 
 		 288 aa  103  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  26.04 
 
 		 536 aa  104  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2799  thiamine transporter membrane protein  39.11 
 
 		 504 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2275  putative transmembrane ABC transporter protein  27.83 
 
 		 589 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  26.25 
 
 		 536 aa  103  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1855  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.36 
 
 		 273 aa  103  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.174317  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  26.25 
 
 		 536 aa  103  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  26.98 
 
 		 535 aa  103  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  26.14 
 
 		 535 aa  103  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 		 541 aa  103  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.48 
 
 		 590 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.48 
 
 		 590 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297205  normal  0.0450564 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0072  thiamine transporter membrane protein  26.46 
 
 		 536 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.04 
 
 		 590 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167103  normal  0.195265 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1768  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  28.91 
 
 		 590 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.0413415 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1726  iron, putative  27.13 
 
 		 585 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0368916  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.91 
 
 		 590 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.312998  normal  0.625588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>