More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0980 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0980  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 
202 aa  388  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0296  protein of unknown function UPF0126  79.21 
 
 
218 aa  296  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0539  protein of unknown function UPF0126  85 
 
 
219 aa  295  4e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2312  protein of unknown function UPF0126  79.6 
 
 
217 aa  288  3e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.27452 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4150  protein of unknown function UPF0126  73.1 
 
 
216 aa  273  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2719  protein of unknown function UPF0126  71.29 
 
 
223 aa  270  8.000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0167  protein of unknown function UPF0126  41.84 
 
 
206 aa  157  7e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1367  hypothetical protein  41.12 
 
 
223 aa  156  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000869837 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1359  hypothetical protein  41.97 
 
 
208 aa  153  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0580  hypothetical protein  42.13 
 
 
199 aa  153  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.257402  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1304  hypothetical protein  41.62 
 
 
199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0434  protein of unknown function UPF0126  35.9 
 
 
204 aa  144  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2206  protein of unknown function UPF0126  31.46 
 
 
219 aa  111  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1929  hypothetical protein  34.55 
 
 
209 aa  111  8.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0753  protein of unknown function UPF0126  32.84 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0874  protein of unknown function UPF0126  35.94 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0778284  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0180  hypothetical protein  34.52 
 
 
204 aa  102  4e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.210979  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0375  hypothetical protein  32.99 
 
 
210 aa  101  6e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0995  protein of unknown function UPF0126  30.69 
 
 
205 aa  99.4  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.560054  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1555  hypothetical protein  34.43 
 
 
209 aa  97.8  9e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000546939 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2113  protein of unknown function UPF0126  34.67 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3735  hypothetical protein  29.95 
 
 
207 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3466  hypothetical protein  30.1 
 
 
207 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3758  hypothetical protein  29.95 
 
 
207 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3473  hypothetical protein  30.1 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.020213  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1208  hypothetical protein  35.47 
 
 
214 aa  92.8  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.101022  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0622  hypothetical protein  31.22 
 
 
206 aa  91.7  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000256648  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3554  hypothetical protein  29.44 
 
 
207 aa  91.3  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3453  hypothetical protein  29.44 
 
 
207 aa  91.3  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3717  hypothetical protein  29.44 
 
 
207 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.39161e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3838  hypothetical protein  29.44 
 
 
207 aa  91.3  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1231  protein of unknown function UPF0126  35.32 
 
 
206 aa  91.3  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000107452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1498  hypothetical protein  28.99 
 
 
207 aa  91.3  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199535  normal  0.061622 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3807  hypothetical protein  28.99 
 
 
207 aa  91.3  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1380  thioredoxin reductase (trxr)  31.41 
 
 
202 aa  90.5  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0825177  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1493  hypothetical protein  37.25 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1580  hypothetical protein  31.25 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0682  hypothetical protein  34.52 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00825878  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  31.61 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0571  protein of unknown function UPF0126  36.04 
 
 
211 aa  89.4  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2385  hypothetical protein  28.78 
 
 
207 aa  89  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.389297  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  30.73 
 
 
213 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  0.0000000000418622 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  30.73 
 
 
213 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  30.73 
 
 
213 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  30.73 
 
 
213 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000814353  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0604  hypothetical protein  33.17 
 
 
201 aa  87.8  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000379798  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0628  hypothetical protein  33.5 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.0000000261982  hitchhiker  0.0000034229 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  86.7  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3482  hypothetical protein  34.38 
 
 
202 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000236563  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1683  hypothetical protein  32.54 
 
 
220 aa  86.3  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000472975 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2916  hypothetical protein  32.4 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  32.35 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2603  hypothetical protein  31.12 
 
 
213 aa  85.5  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.624077  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  30.73 
 
 
217 aa  85.9  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  34.01 
 
 
202 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3199  hypothetical protein  35.75 
 
 
208 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4251  hypothetical protein  29.5 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5168  hypothetical protein  35.75 
 
 
208 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  32.99 
 
 
210 aa  85.1  7e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5111  hypothetical protein  35.75 
 
 
208 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0716  hypothetical protein  28.14 
 
 
210 aa  84.7  9e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0926  hypothetical protein  28.5 
 
 
207 aa  84.7  9e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.568487  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  30.58 
 
 
206 aa  84  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1386  hypothetical protein  30.27 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  31.37 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  29.17 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  33.5 
 
 
202 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  33.5 
 
 
202 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  28.35 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  29.17 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  29.17 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000881867  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  33.5 
 
 
202 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  33.5 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  33.5 
 
 
202 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0831  hypothetical protein  33.5 
 
 
202 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144812  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  31.86 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  32.5 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  29.17 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3969  hypothetical protein  32.65 
 
 
222 aa  82  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0683  protein of unknown function UPF0126  34.87 
 
 
208 aa  82  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397825 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  30.65 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  33.51 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0215  hypothetical protein  33.33 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15830  predicted membrane protein  30.65 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0326737  normal  0.0662663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1854  protein of unknown function UPF0126  36 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  29.29 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0830  protein of unknown function UPF0126  38.69 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0734  hypothetical protein  26.8 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.706428  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  32.98 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  31.94 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  32.98 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  28.35 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2463  hypothetical protein  32.64 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000441132  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0870  hypothetical protein  32.99 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  26.4 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  30.88 
 
 
208 aa  79  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2576  hypothetical protein  32.14 
 
 
201 aa  79  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09293  membrane protein  28.86 
 
 
209 aa  79  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.294649  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  31.37 
 
 
208 aa  79  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1394  protein of unknown function UPF0126  27.59 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>