258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4514 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4514  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 		 576 aa  1194    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0113275  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2839  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  61.22 
 
 		 522 aa  594  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.224922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2474  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  59.15 
 
 		 528 aa  574  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1778  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  52.06 
 
 		 505 aa  495  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.513471  normal  0.693923 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2320  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.11 
 
 		 463 aa  231  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.389053 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00525  putative arginine decarboxylase  29.2 
 
 		 486 aa  228  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2811  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.68 
 
 		 467 aa  225  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0595118  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5527  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.81 
 
 		 494 aa  219  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.27948  normal  0.0601213 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1868  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.35 
 
 		 463 aa  217  5e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.11106  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3427  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  29.05 
 
 		 501 aa  216  9e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0150373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6223  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.15 
 
 		 465 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1576  arginine decarboxylase, biosynthetic  27.78 
 
 		 430 aa  204  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584037  normal  0.0102246 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2068  arginine decarboxylase  26.49 
 
 		 654 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1983  arginine decarboxylase  26.49 
 
 		 654 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119208  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1677  arginine decarboxylase  22.47 
 
 		 681 aa  87.8  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.814883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1896  arginine decarboxylase  26.49 
 
 		 654 aa  87.8  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.907046  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1650  arginine decarboxylase  22.81 
 
 		 681 aa  87  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00521  arginine decarboxylase  23.82 
 
 		 648 aa  86.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.234716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4038  arginine decarboxylase  23.44 
 
 		 679 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.781244 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0026  arginine decarboxylase  26.93 
 
 		 650 aa  85.5  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2172  arginine decarboxylase  23.87 
 
 		 642 aa  84.3  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3349  arginine decarboxylase  27.52 
 
 		 659 aa  83.2  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0843  arginine decarboxylase  27.52 
 
 		 659 aa  83.2  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3466  arginine decarboxylase  24.71 
 
 		 645 aa  83.2  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0845  arginine decarboxylase  27.52 
 
 		 659 aa  83.2  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1037  arginine decarboxylase  23.12 
 
 		 647 aa  82.8  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.919876 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1964  arginine decarboxylase  25.23 
 
 		 660 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.015476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1413  arginine decarboxylase  27.38 
 
 		 653 aa  82  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.909421  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2513  arginine decarboxylase  23.94 
 
 		 642 aa  81.6  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3973  arginine decarboxylase  27.61 
 
 		 658 aa  81.3  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0202  arginine decarboxylase  26.64 
 
 		 634 aa  81.6  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.500667  normal  0.147392 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0557  arginine decarboxylase  25.73 
 
 		 629 aa  80.9  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.321507  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3430  arginine decarboxylase  27.3 
 
 		 632 aa  80.9  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000516135 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3249  arginine decarboxylase  26.4 
 
 		 632 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.225168  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3333  arginine decarboxylase  26.4 
 
 		 632 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.104142 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3124  arginine decarboxylase  25.48 
 
 		 627 aa  79  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1771  arginine decarboxylase  25.26 
 
 		 706 aa  78.6  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3260  arginine decarboxylase  26.4 
 
 		 632 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3325  arginine decarboxylase  26.4 
 
 		 632 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591958  normal  0.70504 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0508  arginine decarboxylase  26.4 
 
 		 658 aa  77.8  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595355  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03648  arginine decarboxylase  27.27 
 
 		 628 aa  77.8  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3934  arginine decarboxylase  22.69 
 
 		 655 aa  77  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.532155  normal  0.948508 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1309  arginine decarboxylase  23.82 
 
 		 635 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000212107 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3903  arginine decarboxylase  26.32 
 
 		 659 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0317541  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0207  diaminopimelate decarboxylase  25.85 
 
 		 435 aa  77  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3706  arginine decarboxylase  26.32 
 
 		 660 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0526106  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2916  arginine decarboxylase  23.82 
 
 		 635 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000828  biosynthetic arginine decarboxylase  26.59 
 
 		 640 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00030199  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28311  arginine decarboxylase  22.98 
 
 		 648 aa  75.1  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.205321 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02768  arginine decarboxylase  26.98 
 
 		 658 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0756  arginine decarboxylase  26.98 
 
 		 658 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4241  arginine decarboxylase  26.98 
 
 		 632 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3371  arginine decarboxylase  26.98 
 
 		 658 aa  74.7  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3096  arginine decarboxylase  26.98 
 
 		 658 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3081  arginine decarboxylase  26.98 
 
 		 632 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602145  hitchhiker  0.00168239 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2606  arginine decarboxylase  23.36 
 
 		 635 aa  74.7  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.455337  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02731  hypothetical protein  26.98 
 
 		 658 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3281  arginine decarboxylase  26.98 
 
 		 658 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0773  arginine decarboxylase  26.98 
 
 		 658 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439854 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00521  arginine decarboxylase  19.37 
 
 		 648 aa  74.3  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.325981  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3873  arginine decarboxylase  23.33 
 
 		 642 aa  73.9  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03894  arginine decarboxylase  24.46 
 
 		 639 aa  73.6  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0027527  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1536  arginine decarboxylase  25.48 
 
 		 643 aa  73.6  0.000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.649083  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0419  arginine decarboxylase  25.14 
 
 		 661 aa  73.6  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00340731  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0983  arginine decarboxylase  24.53 
 
 		 635 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1142  arginine decarboxylase  21.28 
 
 		 693 aa  73.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.344888  hitchhiker  0.00702994 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2412  arginine decarboxylase  28.22 
 
 		 626 aa  73.2  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00461  arginine decarboxylase  19.61 
 
 		 648 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1761  arginine decarboxylase  26.96 
 
 		 637 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0168893  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3768  arginine decarboxylase  26.14 
 
 		 629 aa  72  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2517  arginine decarboxylase  26.96 
 
 		 637 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.977379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1805  arginine decarboxylase  26.96 
 
 		 637 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0026532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1768  arginine decarboxylase  26.96 
 
 		 637 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0174014  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0901  arginine decarboxylase  26.42 
 
 		 638 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000100122  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0550  arginine decarboxylase  25.16 
 
 		 657 aa  71.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.314322  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0046  arginine decarboxylase  19.3 
 
 		 648 aa  71.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06737  arginine decarboxylase  26.54 
 
 		 640 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3423  arginine decarboxylase  22.26 
 
 		 671 aa  71.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1846  arginine decarboxylase  22.67 
 
 		 669 aa  70.5  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00481  arginine decarboxylase  19.89 
 
 		 648 aa  70.5  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1675  arginine decarboxylase  22.47 
 
 		 635 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00247787  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07050  arginine decarboxylase  25.32 
 
 		 636 aa  69.7  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0013  diaminopimelate decarboxylase  25.89 
 
 		 443 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1647  arginine decarboxylase  26.24 
 
 		 637 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2321  arginine decarboxylase  24.92 
 
 		 655 aa  69.7  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1870  arginine decarboxylase  27 
 
 		 637 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0006  arginine decarboxylase  24.73 
 
 		 630 aa  68.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0006  arginine decarboxylase  24.73 
 
 		 630 aa  68.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2280  arginine decarboxylase  26.45 
 
 		 636 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000837435  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1536  arginine decarboxylase  25.16 
 
 		 645 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.767792 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3344  arginine decarboxylase  25.84 
 
 		 658 aa  69.7  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0121  arginine decarboxylase  24.25 
 
 		 628 aa  68.6  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.183445  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2097  arginine decarboxylase  24.22 
 
 		 636 aa  68.6  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1557  arginine decarboxylase  27 
 
 		 637 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1632  arginine decarboxylase  27 
 
 		 637 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.386766  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2517  arginine decarboxylase  24.85 
 
 		 639 aa  68.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.332138  normal  0.039824 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1629  diaminopimelate decarboxylase  23.54 
 
 		 459 aa  68.2  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1624  arginine decarboxylase  27 
 
 		 637 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0743651 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0683  diaminopimelate decarboxylase  21.8 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000143238  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0106  arginine decarboxylase  25.5 
 
 		 628 aa  67.4  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.895522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>