More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1889 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 413 aa  826    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  24.75 
 
 		 380 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4114  ABC-2 type transporter  29.65 
 
 		 437 aa  142  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  27.55 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4703  ABC-2 type transporter  26.43 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29660  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.74 
 
 		 382 aa  106  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.98 
 
 		 396 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  33.77 
 
 		 398 aa  97.4  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0057  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 449 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 241 aa  93.6  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  29.33 
 
 		 241 aa  92.4  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  29.67 
 
 		 260 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  21.58 
 
 		 381 aa  90.1  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3377  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 		 440 aa  87.8  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  25.71 
 
 		 365 aa  87  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  25.94 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6846  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3438  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0748672 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  26.64 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  21.07 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  26.05 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3747  ABC-2 type transporter  28.03 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2625  ABC-2 type transporter  20.62 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  22.87 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  21.64 
 
 		 427 aa  80.5  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0131  ABC-2 type transporter  20.47 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0390339  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  27.72 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3063  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.09 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3634  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 403 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135402  normal  0.0306752 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  25.13 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  23.74 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5035  ABC-2 type transporter  27.11 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1843  hypothetical protein  25.74 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1641  multidrug ABC transporter, permease  25.74 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000991751  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  27.35 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1663  hypothetical protein  25.74 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0766835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1795  hypothetical protein  25.74 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  27.65 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0259  ABC transporter  31.29 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.474488  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  22.38 
 
 		 375 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  27.22 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  25.68 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  21.07 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1709  ABC-2 type transporter  23.86 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0615816  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2108  ABC-2 type transporter  26.87 
 
 		 386 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0017  ABC transporter, permease protein  28 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  25.68 
 
 		 360 aa  72.8  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  22.55 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3970  hypothetical protein  26.91 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  23.81 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  24.77 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  24.71 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1669  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0258  ABC transporter permease  26.63 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.716995  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  22.55 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  21.45 
 
 		 373 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3153  ABC-2 type transporter  27.39 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  22.3 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  22.3 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  22.17 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2323  ABC transporter, permease  27.11 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00174786  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0764  ABC-2 type transporter  27.22 
 
 		 269 aa  69.3  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2599  putative ABC transporter, permease protein  26.38 
 
 		 339 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2544  ABC transporter, permease protein, putative  27.11 
 
 		 339 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0951215  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.48 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1758  ABC-2 type transporter  25.44 
 
 		 341 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  26.6 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  21.2 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  21.2 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5801  ABC-2 type transporter  22.08 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552117  normal  0.846192 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  26.51 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2556  putative ABC transporter, permease protein  27.38 
 
 		 339 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0674400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  26.06 
 
 		 376 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  21.2 
 
 		 373 aa  67  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2365  ABC transporter permease  26.51 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.93 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10200  ABC-type multidrug transport system, permease component  30 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0158104  normal  0.0492855 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2542  ABC transporter permease  26.51 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1683  multidrug ABC transporter permease component  30.29 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0017586  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  22.77 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  23.38 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  32.14 
 
 		 281 aa  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  25.38 
 
 		 242 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  21.18 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0209  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 393 aa  66.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4131  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  23.44 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  22.52 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4844  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  22.78 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  26.49 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0750  ABC-2 type transporter  27.68 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  21.45 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0386  ABC transporter, permease component  22.01 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246762  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4702  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  24.12 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0511  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  30.12 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3952  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106214  normal  0.0583359 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>