More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1055 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1055  transport system permease protein  100 
 
 
344 aa  656    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  40.98 
 
 
330 aa  257  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  40.06 
 
 
337 aa  255  8e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  40.18 
 
 
330 aa  255  8e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  44.87 
 
 
363 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  40.98 
 
 
346 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  41.96 
 
 
361 aa  243  3e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  44.2 
 
 
338 aa  232  6e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  48.04 
 
 
334 aa  231  2e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  48.04 
 
 
334 aa  231  2e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  47.33 
 
 
363 aa  229  5e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  39.71 
 
 
340 aa  228  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2134  transport system permease protein  44.48 
 
 
357 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0133047 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  38.84 
 
 
350 aa  217  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  42.81 
 
 
347 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  42.01 
 
 
356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  39.2 
 
 
336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  42.18 
 
 
362 aa  211  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  37.19 
 
 
356 aa  210  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  41.26 
 
 
383 aa  210  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  41.85 
 
 
355 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  40.06 
 
 
366 aa  210  3e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  38.78 
 
 
367 aa  209  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3078  transport system permease protein  45.89 
 
 
347 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0306769  normal  0.447072 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  42.96 
 
 
315 aa  206  4e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  40.56 
 
 
353 aa  205  8e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  42.68 
 
 
358 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  35.82 
 
 
359 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2493  corrinoid ABC transporter permease  47 
 
 
373 aa  205  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  39.74 
 
 
345 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  40.29 
 
 
367 aa  204  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  38.58 
 
 
342 aa  202  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  40.06 
 
 
380 aa  202  9e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  40.66 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  42.91 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  40.75 
 
 
352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  42.95 
 
 
340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  38.63 
 
 
371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  39.38 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  38.25 
 
 
368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  41.46 
 
 
355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  41.06 
 
 
358 aa  200  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1546  ABC transporter, inner membrane subunit  39.49 
 
 
387 aa  200  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  41.56 
 
 
354 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  40.76 
 
 
381 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  42.07 
 
 
338 aa  198  9e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  37.39 
 
 
343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  38.3 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  42.86 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  38.26 
 
 
342 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1753  transport system permease protein  40.5 
 
 
348 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000172591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  38.58 
 
 
345 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  38.58 
 
 
345 aa  196  6e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  40.06 
 
 
372 aa  196  6e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  38.58 
 
 
342 aa  196  7e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  38.58 
 
 
342 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  37.97 
 
 
368 aa  196  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  40.06 
 
 
452 aa  195  9e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  38.27 
 
 
342 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  37.75 
 
 
375 aa  195  1e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0657  ABC-type transporter, permease component  42.01 
 
 
346 aa  194  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  40.42 
 
 
350 aa  195  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  38.58 
 
 
342 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  40.81 
 
 
367 aa  193  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0603  transport system permease protein  45.1 
 
 
316 aa  193  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.39796  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3104  iron compound ABC transporter, permease protein  41.08 
 
 
359 aa  193  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0757  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  39.69 
 
 
355 aa  192  5e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.534132  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2357  iron compound ABC transporter, permease protein  41.19 
 
 
327 aa  192  5e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  40.49 
 
 
341 aa  192  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  33.44 
 
 
331 aa  192  7e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  34.69 
 
 
329 aa  192  7e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  38.68 
 
 
342 aa  192  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1735  transport system permease protein  39.18 
 
 
347 aa  192  9e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  43.81 
 
 
349 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  36.73 
 
 
343 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  38.89 
 
 
336 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1831  transport system permease protein  43.92 
 
 
376 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  43.57 
 
 
354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  36.33 
 
 
343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  42.56 
 
 
357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  38.66 
 
 
367 aa  189  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1736  transport system permease protein  40 
 
 
351 aa  190  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.914625  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  40.55 
 
 
348 aa  190  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4500  transport system permease protein  43.92 
 
 
363 aa  189  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.744299  normal  0.246741 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  34.05 
 
 
337 aa  190  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  36.21 
 
 
348 aa  189  5e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  40.99 
 
 
336 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  36.21 
 
 
348 aa  189  7e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3251  transport system permease protein  42.25 
 
 
345 aa  189  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000970776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0552  transport system permease protein  39.09 
 
 
326 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0845  transport system permease protein  33.64 
 
 
322 aa  188  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1711  transport system permease protein  38.49 
 
 
335 aa  188  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  33.74 
 
 
337 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  36.91 
 
 
343 aa  188  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7223  transport system permease protein  39.76 
 
 
351 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  39.93 
 
 
318 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  40.28 
 
 
330 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  37.14 
 
 
325 aa  187  3e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  40.48 
 
 
340 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  36.71 
 
 
333 aa  186  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>