More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0286 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  555  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.55 
 
 
314 aa  256  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  48.11 
 
 
303 aa  252  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  47.2 
 
 
294 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  47.2 
 
 
294 aa  249  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  47.6 
 
 
291 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.71 
 
 
287 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598398  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  47.62 
 
 
318 aa  228  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25270  predicted permease, DMT superfamily  52.57 
 
 
291 aa  226  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.206  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  42.45 
 
 
324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  50.71 
 
 
395 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  46.69 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  44.32 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  43.82 
 
 
318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2279  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.57 
 
 
301 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136903  normal  0.215844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0619  hypothetical protein  46.28 
 
 
346 aa  212  7e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.28 
 
 
290 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  44.65 
 
 
290 aa  209  6e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.82 
 
 
290 aa  202  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.77 
 
 
303 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4185  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.82 
 
 
291 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4210  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.52 
 
 
290 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2455  hypothetical protein  41.33 
 
 
272 aa  192  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0070  carboxylate/amino acid/amine transporter  41.57 
 
 
288 aa  192  7e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  40.62 
 
 
335 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2764  hypothetical protein  48.85 
 
 
310 aa  183  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.876324  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.48 
 
 
317 aa  179  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3677  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.11 
 
 
285 aa  178  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.9 
 
 
302 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0151  putative transmembrane protein  47.27 
 
 
309 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0551496  normal  0.867935 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3499  hypothetical protein  39.22 
 
 
285 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290777  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4124  hypothetical protein  39.22 
 
 
285 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0215  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.52 
 
 
285 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000175088  normal  0.378069 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4245  hypothetical protein  38.87 
 
 
285 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000122262  hitchhiker  0.00219233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2455  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.96 
 
 
362 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0213  hypothetical protein  38.16 
 
 
285 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223398  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4527  integral membrane domain-containing protein  38.89 
 
 
284 aa  110  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3933  hypothetical protein  38.67 
 
 
284 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000367698  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3735  hypothetical protein  38.67 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.486754 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3806  hypothetical protein  38.67 
 
 
284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.305382  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3644  hypothetical protein  31.16 
 
 
293 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3337  hypothetical protein  30.74 
 
 
298 aa  99.4  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.491654 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003645  permease  32.11 
 
 
295 aa  90.5  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.436376  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  31.93 
 
 
299 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  33.18 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  29.41 
 
 
274 aa  80.5  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2433  hypothetical protein  32 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.21912  normal  0.079185 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02200  hypothetical protein  30 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  30.09 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0682  hypothetical protein  27.93 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.095942  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  29.19 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  29.25 
 
 
301 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  26.74 
 
 
311 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  30.36 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.57 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  26.77 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  25 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  29.12 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 
340 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.28 
 
 
349 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3565  DMT family permease  28.92 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  29.95 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  24.2 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  29.95 
 
 
300 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.12 
 
 
289 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.45 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.87 
 
 
367 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2348  hypothetical protein  29.95 
 
 
300 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  28.09 
 
 
307 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  26.32 
 
 
299 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4228  drug/metabolite exporter family protein  21.32 
 
 
299 aa  63.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  30.21 
 
 
306 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  26.17 
 
 
322 aa  62.8  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  25.2 
 
 
316 aa  62.8  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1436  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.2 
 
 
331 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.397565  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.37 
 
 
317 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  27.87 
 
 
335 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.24 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  27.85 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  27.34 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  26.15 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  23.38 
 
 
298 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  28.37 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.29 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.67 
 
 
307 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.98 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  30.67 
 
 
307 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  30.74 
 
 
303 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  30.07 
 
 
298 aa  60.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1980  hypothetical protein  25.48 
 
 
283 aa  60.5  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.463491  normal  0.74257 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  29.51 
 
 
308 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3137  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.91 
 
 
331 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 
299 aa  60.1  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  29.18 
 
 
301 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  31.96 
 
 
343 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  28.57 
 
 
302 aa  60.1  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  31.96 
 
 
343 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.81 
 
 
312 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
313 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>