More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1094 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1094  elongation factor Tu domain protein  100 
 
 		 399 aa  814    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0852  elongation factor Tu  90.23 
 
 		 399 aa  723    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29780  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  76.69 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.573725 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0585  translation elongation factor Tu  75.94 
 
 		 396 aa  633  1e-180  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344387  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2692  elongation factor Tu  75.94 
 
 		 396 aa  621  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3145  elongation factor Tu  76.5 
 
 		 396 aa  624  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2979  elongation factor Tu  75.69 
 
 		 396 aa  620  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.990994  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23870  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  74.56 
 
 		 395 aa  613  9.999999999999999e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  73.93 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  73.75 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  74.26 
 
 		 401 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  73.68 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  72.61 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2661  translation elongation factor Tu  73 
 
 		 397 aa  595  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  73.87 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  73.87 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  73.87 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  72.25 
 
 		 397 aa  596  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17200  elongation factor Tu  76.13 
 
 		 396 aa  592  1e-168  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232418  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 397 aa  593  1e-168  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1183  translation elongation factor Tu  73 
 
 		 397 aa  590  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10699  elongation factor Tu  73.43 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  71.25 
 
 		 397 aa  580  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  71 
 
 		 397 aa  578  1e-164  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  72.75 
 
 		 397 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  70.75 
 
 		 397 aa  574  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  70.5 
 
 		 397 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1119  translation elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  70.47 
 
 		 400 aa  571  1.0000000000000001e-162  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0580  elongation factor Tu  72.25 
 
 		 397 aa  570  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.700966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6616  translation elongation factor Tu  71.5 
 
 		 397 aa  567  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4323  translation elongation factor Tu  71.07 
 
 		 397 aa  567  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0924  translation elongation factor Tu  72.18 
 
 		 397 aa  565  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0489446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0560  translation elongation factor Tu  70.25 
 
 		 397 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  68.25 
 
 		 395 aa  561  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  68.25 
 
 		 395 aa  561  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  68.75 
 
 		 397 aa  558  1e-158  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  68.75 
 
 		 397 aa  558  1e-158  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  70.25 
 
 		 395 aa  557  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0685  elongation factor Tu  70.25 
 
 		 397 aa  555  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6051  elongation factor Tu  71.75 
 
 		 397 aa  553  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198403  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1178  translation elongation factor Tu  68.06 
 
 		 401 aa  554  1e-156  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000242479  unclonable  0.0000000292333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1084  elongation factor Tu  70 
 
 		 397 aa  551  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  68.08 
 
 		 400 aa  548  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  67.83 
 
 		 399 aa  548  1e-155  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3925  elongation factor Tu  71 
 
 		 397 aa  549  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  67.58 
 
 		 400 aa  545  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1184  translation elongation factor Tu  68.4 
 
 		 405 aa  545  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000189456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  67.08 
 
 		 399 aa  546  1e-154  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2621  translation elongation factor Tu  68.4 
 
 		 405 aa  545  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2157  elongation factor Tu  67.33 
 
 		 400 aa  545  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2170  elongation factor Tu  67.33 
 
 		 400 aa  545  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0151946  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4317  elongation factor Tu  71 
 
 		 397 aa  547  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  69.25 
 
 		 397 aa  544  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  69.25 
 
 		 397 aa  544  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  67.33 
 
 		 399 aa  545  1e-154  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  66.67 
 
 		 396 aa  542  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  66.67 
 
 		 396 aa  542  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1672  elongation factor Tu  69.83 
 
 		 399 aa  541  1e-153  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000990168  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  68.07 
 
 		 400 aa  541  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0396  translation elongation factor Tu  69.67 
 
 		 395 aa  541  1e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0792  elongation factor Tu  69.02 
 
 		 396 aa  544  1e-153  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.476652  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  68.34 
 
 		 395 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  66.92 
 
 		 397 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  67.42 
 
 		 396 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3182  elongation factor Tu  67.17 
 
 		 396 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00127613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3196  elongation factor Tu  67.17 
 
 		 396 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526973  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  67.42 
 
 		 396 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  64.91 
 
 		 394 aa  538  9.999999999999999e-153  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  67.42 
 
 		 396 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  67.25 
 
 		 396 aa  539  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252436  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  67.25 
 
 		 396 aa  539  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  66.5 
 
 		 395 aa  538  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  66.83 
 
 		 397 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3324  elongation factor Tu  67.17 
 
 		 396 aa  538  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3341  elongation factor Tu  67.17 
 
 		 396 aa  538  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  66.5 
 
 		 395 aa  538  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  67.75 
 
 		 394 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  67.75 
 
 		 394 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  66.75 
 
 		 399 aa  538  9.999999999999999e-153  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1168  elongation factor Tu  68.09 
 
 		 396 aa  538  9.999999999999999e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000000207672  hitchhiker  4.69343e-22 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  67.75 
 
 		 394 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  67.75 
 
 		 394 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0734  elongation factor Tu  66.92 
 
 		 391 aa  538  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.481957  normal  0.0967794 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0756  elongation factor Tu  66.92 
 
 		 391 aa  538  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.097757  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  66.58 
 
 		 396 aa  536  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  67.17 
 
 		 396 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000468547  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  67.17 
 
 		 396 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  66.58 
 
 		 396 aa  536  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  67.17 
 
 		 396 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  67.57 
 
 		 400 aa  535  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3070  elongation factor Tu  67.17 
 
 		 396 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000360276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3084  elongation factor Tu  67.17 
 
 		 396 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000577807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  67.17 
 
 		 396 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  67.17 
 
 		 396 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  67.17 
 
 		 396 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  67.17 
 
 		 396 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  67.5 
 
 		 396 aa  535  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  65.02 
 
 		 405 aa  536  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  65.02 
 
 		 405 aa  536  1e-151  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>