More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_5037 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_5037  peptidase M20  100 
 
 		 375 aa  715    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.357422  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  41.05 
 
 		 357 aa  189  9e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  37.9 
 
 		 364 aa  170  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  35.83 
 
 		 380 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  38.17 
 
 		 364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.19 
 
 		 395 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  35.14 
 
 		 373 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.75 
 
 		 413 aa  129  8.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  25.4 
 
 		 402 aa  123  4e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.05 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  32.35 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  35.35 
 
 		 424 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.32 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  31.85 
 
 		 386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  30.54 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  28.27 
 
 		 384 aa  110  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 		 384 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0233  peptidase M20  29.87 
 
 		 420 aa  108  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571831  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  30.21 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  26.61 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  25.98 
 
 		 392 aa  106  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  31.06 
 
 		 411 aa  106  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  28.14 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1040  peptidase dimerisation  29.62 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.108705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.24 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2796  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.52 
 
 		 397 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.884075 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  31.69 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  24.35 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.94 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  32.59 
 
 		 380 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  24.28 
 
 		 391 aa  103  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0611  acetylornithine deacetylase (ArgE)  33.55 
 
 		 389 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  29.95 
 
 		 386 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  27.67 
 
 		 374 aa  103  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  29.24 
 
 		 386 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  30.96 
 
 		 428 aa  103  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  30.82 
 
 		 388 aa  102  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.98 
 
 		 370 aa  102  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  29.24 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  28.94 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  31.11 
 
 		 375 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  28.23 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  24.94 
 
 		 422 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  32.27 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.69 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  32.14 
 
 		 385 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2961  peptidase  25.96 
 
 		 395 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.85 
 
 		 398 aa  100  5e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.78 
 
 		 414 aa  100  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  30.21 
 
 		 387 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.81 
 
 		 400 aa  99.8  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  32.27 
 
 		 380 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  29.47 
 
 		 385 aa  99.8  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  25.41 
 
 		 381 aa  99.8  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  31.45 
 
 		 388 aa  99.4  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  30.53 
 
 		 387 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  25.31 
 
 		 422 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  29.65 
 
 		 383 aa  98.6  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0227  acetylornithine deacetylase  26.86 
 
 		 382 aa  98.6  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  30.19 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  20.93 
 
 		 422 aa  98.2  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.36 
 
 		 399 aa  98.6  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.24 
 
 		 400 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.89 
 
 		 393 aa  97.8  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  29.49 
 
 		 387 aa  97.4  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  30.19 
 
 		 374 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  30.91 
 
 		 384 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  28.7 
 
 		 415 aa  97.4  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  31.55 
 
 		 384 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  31.63 
 
 		 380 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4562  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.01 
 
 		 388 aa  96.7  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.86 
 
 		 399 aa  96.7  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  31.58 
 
 		 383 aa  96.7  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  29.51 
 
 		 387 aa  96.3  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  29.41 
 
 		 387 aa  95.9  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  30.16 
 
 		 368 aa  95.9  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  29.41 
 
 		 387 aa  95.9  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  27.63 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  29.41 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4277  acetylornithine deacetylase  28.03 
 
 		 383 aa  95.5  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00886468  normal  0.333205 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  27.24 
 
 		 416 aa  95.5  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  28.19 
 
 		 388 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  29.34 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  32.4 
 
 		 389 aa  94.7  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  28.87 
 
 		 390 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  28.72 
 
 		 387 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  31.31 
 
 		 383 aa  94.7  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  24.63 
 
 		 422 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.31 
 
 		 435 aa  94.4  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.43 
 
 		 391 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  24.69 
 
 		 422 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.76 
 
 		 407 aa  94  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  28.42 
 
 		 387 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.76 
 
 		 407 aa  94  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.27 
 
 		 423 aa  93.6  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2789  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.44 
 
 		 380 aa  93.2  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.345284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  28.28 
 
 		 389 aa  93.2  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.88 
 
 		 391 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  32.89 
 
 		 415 aa  93.2  7e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  27.81 
 
 		 412 aa  92.8  8e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>