More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3319 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 		 555 aa  1113    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.131298 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0856  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.53 
 
 		 503 aa  623  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0104833  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2718  DEAD/DEAH box helicase  54.8 
 
 		 799 aa  533  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.370248  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4464  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.29 
 
 		 501 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3984  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.95 
 
 		 519 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.950119 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4353  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.95 
 
 		 519 aa  481  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.807247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0999  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.28 
 
 		 527 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.431733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.96 
 
 		 504 aa  468  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0717985  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.38 
 
 		 484 aa  466  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3974  putative ATP-dependent RNA helicase  61.5 
 
 		 478 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.522913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2120  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.45 
 
 		 521 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308058  decreased coverage  0.00839171 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1913  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.1 
 
 		 505 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4759  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.49 
 
 		 537 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00346691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3323  DEAD/DEAH box helicase domain protein  64.59 
 
 		 465 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.469232  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0954  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.94 
 
 		 494 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000813647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1478  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.98 
 
 		 499 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142934  hitchhiker  0.00960181 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2431  ATP-dependent RNA helicase  51.26 
 
 		 516 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0938  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  52.03 
 
 		 482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.556655  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0933  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  52.03 
 
 		 482 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.01 
 
 		 507 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.173393  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.01 
 
 		 516 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1333  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.15 
 
 		 493 aa  450  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218178  normal  0.0904092 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2536  ATP-dependent helicase, DEAD-box  61.01 
 
 		 518 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314913  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2249  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.49 
 
 		 498 aa  452  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.03 
 
 		 482 aa  451  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.341636 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1051  DEAD/DEAH box helicase-like protein  57.55 
 
 		 458 aa  451  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0480198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1773  DEAD/DEAH box helicase-like  52.55 
 
 		 477 aa  450  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2985  DEAD/DEAH box helicase  52.49 
 
 		 516 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0305282 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2833  DEAD/DEAH box helicase-like  62.8 
 
 		 503 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.900807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2463  DEAD/DEAH box helicase-like  62.94 
 
 		 500 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2755  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.46 
 
 		 472 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0813357  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1324  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.22 
 
 		 498 aa  448  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.695587  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1200  DEAD/DEAH box helicase-like  58.79 
 
 		 644 aa  441  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.994083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1657  DEAD/DEAH box helicase  62.2 
 
 		 483 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0121598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2321  DEAD/DEAH box helicase-like  59.32 
 
 		 487 aa  437  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1809  DEAD/DEAH box helicase-like  50.4 
 
 		 493 aa  437  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1292  DEAD/DEAH box helicase-like  53.08 
 
 		 464 aa  429  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2746  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.25 
 
 		 678 aa  427  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633229  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0608  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.6 
 
 		 462 aa  423  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.166251  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0140  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.92 
 
 		 448 aa  422  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.398154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.21 
 
 		 491 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  50.4 
 
 		 535 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.21 
 
 		 578 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1148  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.37 
 
 		 489 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.7 
 
 		 511 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.84 
 
 		 513 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.43 
 
 		 484 aa  366  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.65 
 
 		 549 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.21 
 
 		 549 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.45 
 
 		 504 aa  365  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1053  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.18 
 
 		 484 aa  364  2e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.62 
 
 		 487 aa  362  8e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000619  ATP-dependent RNA helicase RhlE  50.94 
 
 		 522 aa  360  4e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.67 
 
 		 494 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.4 
 
 		 526 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.4 
 
 		 525 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.4 
 
 		 525 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.4 
 
 		 515 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.68 
 
 		 486 aa  355  1e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0203924  hitchhiker  0.000949009 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.4 
 
 		 550 aa  355  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.11 
 
 		 497 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.65 
 
 		 571 aa  355  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  47.42 
 
 		 492 aa  355  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3878  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.85 
 
 		 486 aa  354  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  50.82 
 
 		 559 aa  353  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.37 
 
 		 482 aa  353  7e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  51.37 
 
 		 482 aa  353  7e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  51.37 
 
 		 482 aa  353  7e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  51.37 
 
 		 482 aa  353  7e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  51.37 
 
 		 481 aa  352  7e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3028  DEAD/DEAH box helicase-like  45.28 
 
 		 506 aa  353  7e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.287974  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  51.37 
 
 		 482 aa  353  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.65 
 
 		 489 aa  352  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.98 
 
 		 485 aa  351  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0617  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.48 
 
 		 479 aa  350  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.028654 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.68 
 
 		 437 aa  350  3e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.65 
 
 		 482 aa  350  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0899  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  47.09 
 
 		 537 aa  350  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.37 
 
 		 511 aa  349  9e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06483  hypothetical protein  50.13 
 
 		 527 aa  348  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.37 
 
 		 509 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1769  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.79 
 
 		 467 aa  348  2e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.327095  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2570  ATP-dependent RNA helicase  47.3 
 
 		 446 aa  347  2e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3200  dystroglycan-type cadherin-like  48.29 
 
 		 516 aa  347  3e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2687  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  45.69 
 
 		 533 aa  347  3e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.915441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  50.13 
 
 		 491 aa  347  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.38 
 
 		 443 aa  346  5e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0456  DEAD/DEAH box helicase-like protein  49.74 
 
 		 540 aa  346  7e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  51.37 
 
 		 527 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.75 
 
 		 520 aa  345  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0312074 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1556  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.43 
 
 		 418 aa  344  2e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000449749  hitchhiker  0.000184572 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1704  DEAD/DEAH box helicase-like  44.75 
 
 		 520 aa  345  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2316  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.75 
 
 		 520 aa  345  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.74 
 
 		 463 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.37 
 
 		 493 aa  343  4e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4573  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.13 
 
 		 415 aa  343  5e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50 
 
 		 463 aa  343  5e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2335  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.7 
 
 		 467 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0940399  normal  0.127544 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0544  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.88 
 
 		 418 aa  343  5e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  44.88 
 
 		 476 aa  343  5.999999999999999e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>