More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1059 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  55.73 
 
 		 714 aa  721    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  58.18 
 
 		 712 aa  733    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  51.81 
 
 		 703 aa  645    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  54.01 
 
 		 687 aa  685    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  54.33 
 
 		 717 aa  671    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  57.1 
 
 		 706 aa  739    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  57.1 
 
 		 706 aa  739    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  100 
 
 		 685 aa  1376    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  52.9 
 
 		 713 aa  657    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  52.2 
 
 		 706 aa  643    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  56.43 
 
 		 714 aa  733    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  57.25 
 
 		 703 aa  713    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  55.12 
 
 		 703 aa  699    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  58.78 
 
 		 734 aa  718    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  51.06 
 
 		 711 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  54.29 
 
 		 713 aa  676    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  58.49 
 
 		 714 aa  743    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  54.13 
 
 		 694 aa  682    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  55.64 
 
 		 709 aa  711    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  54.12 
 
 		 687 aa  692    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  55.7 
 
 		 708 aa  723    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  53.85 
 
 		 687 aa  684    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  57.38 
 
 		 708 aa  718    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  50.81 
 
 		 716 aa  629  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  50.14 
 
 		 717 aa  626  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  48.58 
 
 		 709 aa  591  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  49.4 
 
 		 694 aa  589  1e-167  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  48.34 
 
 		 696 aa  590  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  47.83 
 
 		 723 aa  590  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  54.11 
 
 		 546 aa  532  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  43.85 
 
 		 759 aa  509  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  50.09 
 
 		 577 aa  503  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  52.57 
 
 		 582 aa  503  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  50.09 
 
 		 577 aa  501  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  45.41 
 
 		 726 aa  465  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  43.36 
 
 		 715 aa  444  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  43.63 
 
 		 694 aa  443  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  45.47 
 
 		 536 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  39.1 
 
 		 636 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  41.9 
 
 		 528 aa  364  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  35.01 
 
 		 615 aa  313  4.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  36.36 
 
 		 683 aa  310  5e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  33.58 
 
 		 658 aa  306  1.0000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  34.67 
 
 		 688 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  34.67 
 
 		 688 aa  305  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  37.17 
 
 		 681 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  34.91 
 
 		 683 aa  296  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  36.38 
 
 		 690 aa  293  7e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  35.39 
 
 		 682 aa  293  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  34.96 
 
 		 679 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  33.38 
 
 		 667 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  34.5 
 
 		 684 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  36.43 
 
 		 679 aa  282  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  35.16 
 
 		 677 aa  283  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  34.67 
 
 		 684 aa  282  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  34.58 
 
 		 680 aa  280  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  34.54 
 
 		 687 aa  275  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  34.64 
 
 		 687 aa  274  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  34.36 
 
 		 709 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  33.63 
 
 		 654 aa  269  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  34.54 
 
 		 689 aa  261  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  35.44 
 
 		 765 aa  259  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  34.3 
 
 		 740 aa  259  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  31.02 
 
 		 751 aa  257  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  32.57 
 
 		 645 aa  254  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  33.33 
 
 		 692 aa  250  6e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  49.6 
 
 		 369 aa  243  7e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  33.43 
 
 		 727 aa  236  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  31.99 
 
 		 623 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  31.09 
 
 		 690 aa  232  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  33.92 
 
 		 754 aa  231  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2347  ParB-like nuclease  72.33 
 
 		 156 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  31.76 
 
 		 662 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  31.28 
 
 		 662 aa  208  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  29.79 
 
 		 669 aa  207  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  29.03 
 
 		 729 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7403  putative chromosome partitioning protein parB  77.42 
 
 		 133 aa  191  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1468  putative plasmid stabilization protein  71.54 
 
 		 129 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  29.68 
 
 		 670 aa  168  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3327  putative plasmid stabilization protein  70.73 
 
 		 129 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  36.63 
 
 		 626 aa  161  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  36.63 
 
 		 626 aa  161  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  36.63 
 
 		 626 aa  161  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  27.64 
 
 		 652 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  36.18 
 
 		 624 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4956  nuclease  61.44 
 
 		 172 aa  159  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  28.1 
 
 		 654 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  27.54 
 
 		 654 aa  154  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  36.33 
 
 		 624 aa  152  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  46.54 
 
 		 597 aa  151  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  37.23 
 
 		 624 aa  150  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  37.23 
 
 		 624 aa  150  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  27.29 
 
 		 652 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  32.18 
 
 		 595 aa  144  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4994  ParB domain protein nuclease  37.66 
 
 		 380 aa  144  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00893638  normal  0.0336784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7705  hypothetical protein  58.87 
 
 		 133 aa  139  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2258  nuclease  33.92 
 
 		 607 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0720626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3609  ParB family protein  33.92 
 
 		 606 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2079  ParB family protein  33.92 
 
 		 603 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3345  nuclease  33.16 
 
 		 603 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.0526297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>