More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4669 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4669  heat shock protein Hsp20  100 
 
 
147 aa  294  3e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4943  heat shock protein Hsp20  65.49 
 
 
149 aa  203  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0508199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1805  heat shock protein Hsp20  67.61 
 
 
149 aa  202  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  0.803886 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4157  heat shock protein Hsp20  69.63 
 
 
150 aa  195  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4467  heat shock protein Hsp20  62.68 
 
 
149 aa  192  9e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4761  heat shock protein Hsp20  62.68 
 
 
149 aa  192  9e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.735655  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4380  heat shock protein Hsp20  62.68 
 
 
149 aa  192  9e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.642417  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0609  heat shock protein Hsp20  55.86 
 
 
156 aa  177  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.346897  normal  0.0142886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0179  heat shock protein Hsp20  55.78 
 
 
149 aa  168  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0098  heat shock protein Hsp20  50.68 
 
 
168 aa  140  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0160  heat shock protein Hsp20  47.48 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.248861  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3600  heat shock protein Hsp20  45.07 
 
 
165 aa  121  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.484768  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3103  heat shock protein Hsp20  44.44 
 
 
137 aa  119  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.533921  normal  0.0104027 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3659  heat shock protein Hsp20  44.9 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.701015  normal  0.191586 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3038  heat shock protein Hsp20  42.25 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.86939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3573  heat shock protein Hsp20  43.36 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16210  heat shock protein Hsp20  46.27 
 
 
163 aa  115  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221164  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3448  heat shock protein Hsp20  42.54 
 
 
142 aa  114  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2704  heat shock protein Hsp20  41.26 
 
 
145 aa  113  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.923873  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1736  heat shock protein Hsp20  40.97 
 
 
143 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.619884  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4887  heat shock protein Hsp20  42.66 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4235  heat shock protein Hsp20  44.78 
 
 
143 aa  106  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.283869  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0843  heat shock protein Hsp20  38.3 
 
 
144 aa  90.5  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.505886  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2957  HSP20 family protein  37.86 
 
 
143 aa  90.1  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4119  heat shock protein Hsp20  32.65 
 
 
149 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00303961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1929  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 
149 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.638493  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1289  Molecular chaperone (small heat shock protein)- like protein  39.29 
 
 
148 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1149  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 
140 aa  85.9  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1219  heat shock protein Hsp20  37.04 
 
 
140 aa  85.9  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1824  heat shock protein Hsp20  31.75 
 
 
146 aa  86.3  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6419  heat shock protein Hsp20  36.69 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6654  heat shock protein Hsp20  36.69 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344847  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2477  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4514  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.165488  normal  0.480818 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6091  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
146 aa  84.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4382  heat shock protein Hsp20  34.31 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2188  heat shock protein Hsp20  33.11 
 
 
156 aa  84  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.345525  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3430  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 
147 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0383  heat shock protein Hsp20  32.89 
 
 
158 aa  83.6  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6388  heat shock protein Hsp20  34.78 
 
 
146 aa  83.6  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0687951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3084  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 
147 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0200  putative small HEAT shock protein  33.58 
 
 
140 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.32202 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6252  heat shock protein Hsp20  36.43 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0400474  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2532  HSP20 family protein  37.86 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0403  heat shock protein Hsp20  32.61 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2730  heat shock protein Hsp20  37.5 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1979  heat shock protein Hsp20  41.12 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000641758  hitchhiker  0.000000531995 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0505  heat shock protein Hsp20  30.82 
 
 
158 aa  80.1  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2809  HSP20 family protein  34.78 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0002171  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4650  heat shock protein Hsp20  33.58 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.761162 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1010  heat shock protein Hsp20  36.28 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1743  heat shock protein Hsp20  42.99 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174126  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3765  heat shock protein Hsp20  35.07 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2398  putative heat shock protein  33.81 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0850393  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0836  heat shock protein Hsp20  39.6 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534587  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0530  HSP20 family protein  34.31 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3047  HSP20 family protein  34.31 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1572  HSP20 family protein  34.31 
 
 
215 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1472  HSP20 family protein  34.31 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.287102  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0624  HSP20 family protein  34.31 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2055  heat shock protein Hsp20  37.23 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1441  HSP20 family protein  34.31 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1247  HSP20 family protein  34.31 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0543  heat shock protein Hsp20  29.41 
 
 
147 aa  77  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0340696  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0538  HSP20 family protein  33.33 
 
 
147 aa  77  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0197  heat shock protein Hsp20  34.27 
 
 
147 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0542117 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1320  Hsp20/alpha crystallin family protein  30.83 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2365  heat shock protein Hsp20  39.02 
 
 
135 aa  77  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181504  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1262  small heat shock protein  30.83 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.753574  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3612  hypothetical protein  41.9 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5150  heat shock protein Hsp20  35.97 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1704  heat shock protein Hsp20  32.54 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2580  putative small heat shock protein, Hsp20-related  32.12 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4342  heat shock protein Hsp20  33.1 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232434  normal  0.204531 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0539  heat shock protein Hsp20  34.75 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2366  heat shock protein Hsp20  31.88 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550987  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0557  heat shock protein Hsp20  28.68 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0117197  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2643  heat shock protein Hsp20  36.54 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.840862  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02640  low molecular weight heat shock protein  37.96 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2612  Hsp20 family heat-shock protein  32.61 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000112353  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4541  Hsp20 family heat-shock protein  32.61 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000390119  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2325  stress response protein  33.33 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.908249  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2320  heat shock protein Hsp20  35.58 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1142  heat shock protein Hsp20  36.03 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0125  heat shock protein Hsp20  31.62 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.369397  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1348  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.403253 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2024  heat shock protein Hsp20  33.79 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.106375 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1110  heat shock protein Hsp20  30.99 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.339847  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4463  heat shock protein Hsp20  30.88 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1730  HSP20 family protein  32.89 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.34799  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0891  heat shock protein Hsp20  29.32 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.805469  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0788  heat shock protein Hsp20  37.62 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351008  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0989  heat shock protein Hsp20  30.56 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543303  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5733  heat shock protein Hsp20  35.51 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384471  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3085  heat shock protein Hsp20  39.81 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0926  heat shock protein Hsp20  33.6 
 
 
152 aa  74.3  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2035  stress response protein  33.09 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0314  heat shock protein Hsp20  40.59 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1059  stress response protein  33.09 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1345  stress response protein  33.09 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>