106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2303 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2303  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 137 aa  276  5e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1694  preprotein translocase, YajC subunit  51.95 
 
 		 133 aa  84.3  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15090  preprotein translocase, YajC subunit  55.41 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  47.37 
 
 		 113 aa  72.8  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  49.32 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2062  preprotein translocase subunit YajC  41.18 
 
 		 113 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.373337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12608  preprotein translocase subunit YajC  37.84 
 
 		 115 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0597309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3817  preprotein translocase subunit YajC  46.05 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0436653  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2275  preprotein translocase subunit YajC  46.05 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2322  preprotein translocase subunit YajC  46.05 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.90527  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2314  preprotein translocase subunit YajC  46.05 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19372  normal  0.374026 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3392  preprotein translocase, YajC subunit  42.47 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000230513  hitchhiker  0.00000668456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2582  preprotein translocase subunit YajC  43.42 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162406  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1342  preprotein translocase, YajC subunit  43.24 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0529442  normal  0.794399 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  35.64 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1372  protein translocase subunit yajC  34.91 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3052  preprotein translocase, YajC subunit  40.86 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193234  normal  0.994127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  38.1 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  39.51 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2030  preprotein translocase, YajC subunit  32.29 
 
 		 181 aa  50.8  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000255015 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  29.07 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  32.14 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  31.94 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  32.88 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  31.58 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0416  preprotein translocase subunit YajC  30.77 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2388  protein translocase subunit yajC  39.47 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5143  preprotein translocase, YajC subunit  33.73 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.261853  hitchhiker  0.00047755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2112  preprotein translocase, YajC subunit  38.27 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00156357  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17540  preprotein translocase, YajC subunit  33.73 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  35.06 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  34.25 
 
 		 112 aa  48.1  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  27.91 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  34.18 
 
 		 109 aa  48.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  27.91 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  32.1 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  30.23 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  32.89 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 127 aa  47  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  31.88 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  35.85 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  32.91 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  32.53 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1716  preprotein translocase, YajC subunit  28.57 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.741067 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2058  preprotein translocase, YajC subunit  28.57 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.674684  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0727  preprotein translocase subunit YajC  32.5 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0798345  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  32.88 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  31.08 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0942  preprotein translocase, YajC subunit  37.74 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.129581  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1797  preprotein translocase, YajC subunit  37.97 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284758  normal  0.10344 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1995  preprotein translocase, YajC subunit  28.57 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0113559 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  33.75 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  34.25 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  31.88 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  34.57 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  34.57 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  29.76 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1008  preprotein translocase, YajC subunit  28.42 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.868301  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  31.71 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1605  preprotein translocase, YajC subunit  36.51 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.257286  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  31.33 
 
 		 109 aa  42.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12870  preprotein translocase, YajC subunit  30.39 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.195332  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  32.88 
 
 		 105 aa  42.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13970  preprotein translocase, YajC subunit  30.83 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478729  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  28.26 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  26.03 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  32.1 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3437  preprotein translocase, YajC subunit  38.98 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.616709  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  32.47 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  31.71 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  35.37 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  32.1 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2355  preprotein translocase, YajC subunit  29.07 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2108  preprotein translocase, YajC subunit  29.36 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  29.87 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  28.05 
 
 		 114 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  29.87 
 
 		 113 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  32.14 
 
 		 109 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 		 107 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  29.59 
 
 		 146 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1020  preprotein translocase subunit YajC  36.51 
 
 		 110 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  30.34 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  30 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  30.86 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  28.95 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  35.71 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1695  preprotein translocase, YajC subunit  35.19 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1728  preprotein translocase, YajC subunit  35.19 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136772  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  28.99 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>