295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3934 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3934  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 306 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0858224  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  95.39 
 
 		 282 aa  455  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0042e-23 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2676  hypothetical protein  62.01 
 
 		 299 aa  269  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.955594  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0189  hypothetical protein  58.14 
 
 		 299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.41043  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.99 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00529542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0627  hypothetical protein  49.03 
 
 		 290 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  40.88 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0305  hypothetical protein  49.27 
 
 		 349 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0201  hypothetical protein  41.6 
 
 		 301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0216  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.6 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.2 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22564 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  33.68 
 
 		 321 aa  122  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.77 
 
 		 325 aa  122  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  36.36 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.94 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  32.88 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2269  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.73 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4041  hypothetical protein  37.41 
 
 		 307 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3308  drug/metabolite exporter (DME) family protein  37.41 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  26.94 
 
 		 317 aa  98.2  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00200  predicted permease, DMT superfamily  36.5 
 
 		 326 aa  97.1  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0474  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.83 
 
 		 318 aa  95.9  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2155  hypothetical protein  32.73 
 
 		 307 aa  92.8  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3359  hypothetical protein  32.16 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1701  hypothetical protein  37.99 
 
 		 330 aa  90.9  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.228923  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7788  hypothetical protein  38.71 
 
 		 296 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.847344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0475  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.96 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0331  hypothetical protein  36.82 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1897  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.05 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.454728 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27900  membrane protein  34.12 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0399576 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.51 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  29.71 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.26 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2030  hypothetical protein  32.25 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0852704 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.11 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.36 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0769  hypothetical protein  32.88 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  27.96 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3305  catalase  36.17 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.371892 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  26.07 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  32.59 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  26.21 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  32.23 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2394  hypothetical protein  29.66 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  27.91 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  27.62 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.39 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.55 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.15 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  25.39 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  25.39 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.39 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.39 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.39 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  29.49 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.39 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  28.69 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.37 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.39 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.15 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.15 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0341  hypothetical protein  29.49 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  32.49 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.15 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  26.15 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1571  hypothetical protein  29.11 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.358849 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  25.39 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  26.9 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.74 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.78 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  31.5 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0919  hypothetical protein  26.54 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  34.66 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  27.05 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  29.03 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3004  hypothetical protein  29.77 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.315518  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  24.57 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2593  hypothetical protein  33.33 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  25.9 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  28.08 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  30.67 
 
 		 358 aa  54.3  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  32.65 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  26.93 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  32.65 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  32.65 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  28.37 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  24.44 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  24.44 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  29.9 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  26.26 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  28.49 
 
 		 300 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  26.22 
 
 		 292 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  30.33 
 
 		 298 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0316  hypothetical protein  29.35 
 
 		 281 aa  53.1  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.238675  normal  0.667988 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  27.59 
 
 		 293 aa  53.1  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  24.61 
 
 		 327 aa  53.1  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  25.19 
 
 		 306 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.72 
 
 		 305 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>