137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0746 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 646 aa  1248    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  91.49 
 
 		 646 aa  1085    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  46.21 
 
 		 670 aa  555  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  45.98 
 
 		 666 aa  479  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.66 
 
 		 667 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.72 
 
 		 668 aa  330  7e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.09 
 
 		 1343 aa  137  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.25 
 
 		 641 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  24.85 
 
 		 958 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1094 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.96 
 
 		 510 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  25.83 
 
 		 643 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2732  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.02 
 
 		 690 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378578  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  29.38 
 
 		 1148 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.08 
 
 		 642 aa  104  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.71 
 
 		 642 aa  97.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.21 
 
 		 1181 aa  95.1  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2824  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.29 
 
 		 690 aa  94.7  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126862  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  27.25 
 
 		 493 aa  93.2  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2916  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.19 
 
 		 690 aa  91.7  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0883054  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1224 aa  88.2  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.66 
 
 		 1438 aa  88.6  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.42 
 
 		 232 aa  88.2  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  25.31 
 
 		 644 aa  87.4  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  26.32 
 
 		 959 aa  82  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  25.44 
 
 		 546 aa  81.6  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  26.73 
 
 		 1328 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.91 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  26.38 
 
 		 838 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0578  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.94 
 
 		 492 aa  75.1  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.94571  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.69 
 
 		 1139 aa  74.3  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.53 
 
 		 490 aa  73.9  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.27 
 
 		 524 aa  73.9  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  30.14 
 
 		 501 aa  72  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  28.51 
 
 		 428 aa  72  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.51 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  28.15 
 
 		 886 aa  70.9  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  28.77 
 
 		 593 aa  69.3  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2265  HEAT domain containing protein  25 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0591737 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.61 
 
 		 200 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1458  hypothetical protein  28.48 
 
 		 357 aa  62  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.77 
 
 		 1412 aa  61.6  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  26.09 
 
 		 1133 aa  61.6  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.94 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.87 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.85 
 
 		 390 aa  60.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.24 
 
 		 302 aa  59.3  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0469  HEAT domain containing protein  42.28 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.421538 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  29.17 
 
 		 319 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  27.41 
 
 		 517 aa  58.9  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  36.36 
 
 		 199 aa  58.5  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.6 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.43 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.16 
 
 		 831 aa  57  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.61 
 
 		 331 aa  56.6  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  26.48 
 
 		 431 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2324  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.91 
 
 		 182 aa  55.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2744  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.48 
 
 		 121 aa  56.2  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  24.16 
 
 		 408 aa  56.2  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.48 
 
 		 157 aa  55.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.1 
 
 		 285 aa  55.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.44 
 
 		 320 aa  54.7  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  29.21 
 
 		 319 aa  54.7  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.57 
 
 		 313 aa  53.9  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.85 
 
 		 180 aa  53.9  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  30.34 
 
 		 773 aa  53.9  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  29.05 
 
 		 381 aa  53.9  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 176 aa  53.5  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.17 
 
 		 321 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03245  PBS lyase HEAT-like repeat  34.69 
 
 		 213 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.83 
 
 		 377 aa  52  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0241  diguanylate cyclase  27.54 
 
 		 450 aa  52  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  24.19 
 
 		 2194 aa  51.6  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0577  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  28.23 
 
 		 218 aa  51.6  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1170  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.15 
 
 		 150 aa  51.6  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2017  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.85 
 
 		 375 aa  51.2  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1988  HEAT-like repeat-containing protein  33.85 
 
 		 375 aa  51.2  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00393125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1970  HEAT-like repeat-containing protein  33.85 
 
 		 375 aa  51.2  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000496262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2171  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.85 
 
 		 375 aa  51.2  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0184822  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  33.84 
 
 		 323 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1313  hypothetical protein  32.84 
 
 		 361 aa  50.8  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1489  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.37 
 
 		 374 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.451629  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1518  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.37 
 
 		 374 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5858  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.1 
 
 		 614 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2194  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  33.07 
 
 		 375 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0153783 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  32.43 
 
 		 1110 aa  49.7  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.42 
 
 		 1041 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4203  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.64 
 
 		 319 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2006  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.85 
 
 		 375 aa  49.3  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000482717  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4091  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.64 
 
 		 319 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0472779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1566  HEAT domain containing protein  31.73 
 
 		 2243 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.832677 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2231  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.08 
 
 		 335 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  34.57 
 
 		 1204 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2314  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  33.08 
 
 		 375 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000816736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2177  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  33.08 
 
 		 375 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3139  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  33.08 
 
 		 375 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640173  normal  0.0140567 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.9 
 
 		 331 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  31.01 
 
 		 320 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.53 
 
 		 224 aa  48.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2190  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.18 
 
 		 411 aa  48.1  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>