48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1566 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1566  HEAT domain containing protein  100 
 
 		 2243 aa  4286    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.832677 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  23.91 
 
 		 958 aa  84.7  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1094 aa  79.3  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.85 
 
 		 510 aa  70.5  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  25.46 
 
 		 493 aa  68.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  23.84 
 
 		 644 aa  65.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.48 
 
 		 1343 aa  62  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2599  WD-40 repeat protein  29.9 
 
 		 511 aa  60.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1224 aa  58.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  29.24 
 
 		 1766 aa  57.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  21.93 
 
 		 490 aa  55.8  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  24.93 
 
 		 959 aa  55.5  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.65 
 
 		 395 aa  55.5  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.13 
 
 		 1181 aa  55.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.66 
 
 		 737 aa  54.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.19 
 
 		 192 aa  53.9  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 208 aa  53.9  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.42 
 
 		 636 aa  53.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.84 
 
 		 666 aa  52.8  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.64 
 
 		 1412 aa  51.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  25.23 
 
 		 1477 aa  51.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.77 
 
 		 325 aa  51.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  28.24 
 
 		 1190 aa  51.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.86 
 
 		 622 aa  51.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  29.83 
 
 		 1334 aa  51.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.73 
 
 		 370 aa  50.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  32.86 
 
 		 1217 aa  49.3  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.82 
 
 		 1856 aa  48.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  30.69 
 
 		 773 aa  48.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  30.11 
 
 		 1399 aa  49.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  26.52 
 
 		 501 aa  48.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  26.57 
 
 		 1177 aa  48.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  24.12 
 
 		 1209 aa  48.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  32.29 
 
 		 593 aa  48.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.32 
 
 		 399 aa  48.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  28.5 
 
 		 1484 aa  48.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  27.09 
 
 		 1148 aa  48.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3070  WD-40 repeat protein  32.76 
 
 		 438 aa  47.8  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16001  hypothetical protein  32.73 
 
 		 269 aa  47  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.96 
 
 		 642 aa  47.4  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.11 
 
 		 698 aa  47.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  26.46 
 
 		 652 aa  46.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2761  WD-40 repeat-containing protein  31.76 
 
 		 1117 aa  46.2  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645221  normal  0.818272 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2844  WD-40 repeat-containing protein  31.9 
 
 		 440 aa  46.2  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.46 
 
 		 919 aa  46.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01387  meiotic recombination protein Ski8/Rec14, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G08860)  24.23 
 
 		 306 aa  45.8  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000000649458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.67 
 
 		 1684 aa  45.8  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  25.69 
 
 		 437 aa  45.8  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>