118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3190 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3190  cytochrome c class I  100 
 
 		 111 aa  220  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3005  cytochrome c class I  80.18 
 
 		 110 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505825  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3724  cytochrome c-551  51.35 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4979  cytochrome c-551  50.44 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5303  cytochrome c-551  49.56 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5653  cytochrome c-551  49.56 
 
 		 107 aa  103  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.432356 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5035  cytochrome c-551  49.56 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4865  cytochrome c-551  49.56 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4880  cytochrome c-551  49.56 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5417  cytochrome c-551  49.56 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5273  cytochrome c-551  49.56 
 
 		 107 aa  103  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717075 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5291  cytochrome c-551  52.21 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5348  cytochrome c-551  52.21 
 
 		 107 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0828  cytochrome c-550  48.08 
 
 		 118 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000131619  hitchhiker  6.35976e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4408  cytochrome c-550  48.08 
 
 		 118 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000137345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4143  cytochrome c class I  47.12 
 
 		 118 aa  97.1  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000375642  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4371  cytochrome c-550  47.12 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063902  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3018  cytochrome c class I  47.12 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0223373  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4425  cytochrome c-550  47.12 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000170237  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4031  cytochrome c-550  46.15 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000040592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2412  cytochrome c class I  44.44 
 
 		 120 aa  94.7  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000673714  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4041  cytochrome c-550  45.19 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000123285  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4193  cytochrome c-550  44.23 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000176262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4514  cytochrome c-550  44.23 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000708555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4313  cytochrome c-550  44.23 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.74805e-54 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0159  cytochrome c class I  40.38 
 
 		 120 aa  89.4  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0490  cytochrome c class I  44.16 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  37.31 
 
 		 329 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1903  hypothetical protein  39.25 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2129  cytochrome c class I  46.15 
 
 		 255 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000120589  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1378  Quinoprotein glucose dehydrogenase  41.46 
 
 		 769 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.618452 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1434  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  43.75 
 
 		 255 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0832764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1406  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c subunit  43.75 
 
 		 255 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1088  cytochrome c, class I  44.62 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000582284  hitchhiker  0.0000137635 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1546  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  43.75 
 
 		 255 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 		 330 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1618  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  43.75 
 
 		 255 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0848  cytochrome c class I  39.22 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4247  hypothetical protein  30.56 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1248  cytochrome c class I  42.19 
 
 		 255 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.254815  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3178  putative cytochrome c  29.81 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.733909  normal  0.809001 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1449  cytochrome c class I  40.62 
 
 		 255 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3765  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  40.62 
 
 		 255 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1985  nitrite reductase NirS  38.57 
 
 		 546 aa  47.4  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000493691  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1651  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  40.62 
 
 		 255 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1406  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c subunit  40.62 
 
 		 255 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118842  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0017  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  45.07 
 
 		 293 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1687  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  40.62 
 
 		 255 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.615326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1580  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  40.62 
 
 		 255 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0014  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  44.93 
 
 		 293 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1651  hypothetical protein  30.59 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  35.8 
 
 		 525 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3953  Quinoprotein glucose dehydrogenase  37.14 
 
 		 747 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1443  hypothetical protein  32.89 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2704  Quinoprotein glucose dehydrogenase  31.51 
 
 		 731 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3662  cytochrome c class I  44.64 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0062  Pyrrolo-quinoline quinone  38.33 
 
 		 704 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387664 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1911  hypothetical protein  35.53 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.859056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  41.94 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3172  nitrite reductase protein N  36.11 
 
 		 517 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.854794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  31.68 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1716  hypothetical protein  34.21 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1913  hypothetical protein  36.51 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000530569  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  36.23 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0728  cytochrome c, class I  32.76 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0783308 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0012  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  42.25 
 
 		 293 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2602  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  43.33 
 
 		 308 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000191523  normal  0.411563 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1337  cytochrome c550  36.49 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.807392 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1045  cytochrome c class I  32.43 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1538  cytochrome c550  36.49 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.866024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3942  cytochrome c class I  44.68 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.914915 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4229  heme-binding protein NirN  38.89 
 
 		 542 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0733  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  40.58 
 
 		 293 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1809  cytochrome c class I  37.8 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2077  cytochrome c class I  34.78 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1003  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  39.24 
 
 		 304 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  35.29 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1478  cytochrome CytM  44.68 
 
 		 145 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.611234 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1848  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  43.66 
 
 		 318 aa  41.6  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149886  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11331  cytochrome cM  29.07 
 
 		 130 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.969799 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4871  cytochrome c550  35.14 
 
 		 140 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.15236 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1566  diheme cytochrome c  45.28 
 
 		 324 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0652  Nitrite reductase (NO-forming)  38.27 
 
 		 565 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2419  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  39.44 
 
 		 298 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.203271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4302  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  39.34 
 
 		 305 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0300725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  25 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1988  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  43.55 
 
 		 323 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0201798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3043  cytochrome c class I  38.6 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  60.87 
 
 		 530 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1132  PQQ-dependent enzyme-like protein  32.79 
 
 		 701 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0946665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1234  cytochrome c class I  36.84 
 
 		 163 aa  41.2  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5253  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2011  hypothetical protein  26.15 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3260  cytochrome d1, heme region  41.38 
 
 		 528 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4020  cytochrome c, class I  44.68 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.442148  normal  0.970341 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2650  hypothetical protein  38.81 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2009  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  49.02 
 
 		 322 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0902386  hitchhiker  0.0000000272898 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1966  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  49.02 
 
 		 322 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00926304  hitchhiker  0.00889683 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2110  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  49.02 
 
 		 322 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0408813  normal  0.504179 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2147  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.620434 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2103  cytochrome c class I  42.86 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>